类型a:学术研究报告
1971年12月,Proc. Nat. Acad. Sci. USA 期刊(第68卷第12期)发表了由威斯康星大学酶研究所、生物化学与遗传学系的V. A. Erdmann、S. Fahnestock、K. Higo和M. Nomura合作完成的研究论文,题为《Role of 5S RNA in the Functions of 50S Ribosomal Subunits》。这项研究聚焦于核糖体大亚基(50S)中5S RNA的功能,通过重构实验首次明确证明了5S RNA是50S亚基发挥生物学活性的必需成分。
学术背景
5S RNA是50S核糖体亚基的重要组成部分,但其具体功能长期未知。早期研究发现,去除5S RNA会导致50S亚基失活,但无法通过重新添加5S RNA恢复活性,因此无法确定失活是否直接由5S RNA缺失引起,还是因实验处理导致的结构破坏所致。本研究利用*Bacillus stearothermophilus*(嗜热脂肪芽孢杆菌)的50S亚基重构系统,首次实现了从完全解离的组分(不含5S RNA的蛋白质和23S RNA)中重构功能性50S亚基,并明确证明了5S RNA的不可或缺性。研究目标包括:(1) 验证5S RNA对50S亚基功能的影响;(2) 探究5S RNA缺失对多肽合成、肽基转移酶活性、G因子依赖的GTP结合等关键功能的影响。
研究流程与方法
材料制备
- 核糖体提取:从B. stearothermophilus 799的早对数期细胞中提取70S核糖体,通过超速离心分离50S亚基。
- 组分分离:用8 M尿素-4 M LiCl处理50S亚基,分离出含23S RNA和少量5S RNA的“RNA50”组分,以及含大部分蛋白质和70% 5S RNA的“TP50”组分。
- 5S RNA去除:通过LiCl反复沉淀去除RNA50中的5S RNA;通过DEAE-纤维素色谱法去除TP50中的5S RNA,得到无5S RNA的蛋白质组分。
重构实验
- 将无5S RNA的RNA50与TP50混合,加入纯化的5S RNA,在60°C下孵育60分钟,重构“50S”颗粒。通过蔗糖密度梯度离心验证重构颗粒的完整性(沉降系数47S,接近天然50S亚基)。
功能检测
- 多肽合成活性:测定重构颗粒在poly(U)(聚尿苷酸)和噬菌体F2 RNA指导下的苯丙氨酸(Phe)和缬氨酸(Val)掺入活性。
- 肽基转移酶活性:通过fMet-puromycin(甲酰甲硫氨酸-嘌呤霉素)形成实验检测。
- G因子依赖的GTP结合:在梭链孢酸存在下测定[³H]GTP与50S亚基的结合。
- 终止因子R1依赖的[³H]UAA结合:评估50S亚基在翻译终止中的作用。
- tRNA结合实验:采用硝酸纤维素膜过滤法和RNase保护法检测Phe-tRNA与30S-50S复合物的结合。
主要结果
5S RNA是50S亚基功能的核心组分
- 无5S RNA的重构颗粒([-5S]颗粒)在poly(U)指导的多肽合成中活性仅为含5S RNA颗粒([+5S]颗粒)的1%,且无法支持F2 RNA指导的蛋白合成。
- 肽基转移酶活性下降至[+5S]颗粒的14%,表明5S RNA缺失直接影响肽键形成。
- GTP结合和UAA结合活性分别降至17%和10%,说明5S RNA参与G因子和终止因子的功能调控。
- tRNA结合实验中,[-5S]颗粒无法形成稳定的70S复合物,仅保留20%的活性。
结构分析
- 在低Mg²⁺浓度(0.3 mM)下,[-5S]颗粒沉降系数(44S)低于[+5S]颗粒(47S),表明其结构松散;高Mg²⁺浓度(10 mM)可部分恢复结构紧密度。
- 二维凝胶电泳显示,[-5S]颗粒缺失4种50S核糖体蛋白,这些蛋白的缺失可能是功能丧失的原因之一。
结论与意义
本研究首次通过重构实验证明,5S RNA是50S核糖体亚基组装和功能的核心元件,其缺失导致多肽合成、肽基转移酶活性、翻译终止及tRNA结合等关键功能全面受损。5S RNA可能通过维持50S亚基的结构完整性,确保特定蛋白质的正确结合,从而间接调控功能。此外,5S RNA中与tRNA互补的序列(-CGAAC-)可能直接参与tRNA结合,但需进一步验证。
研究亮点
- 方法创新:首次建立依赖5S RNA的50S亚基重构系统,解决了早期研究无法区分“5S RNA缺失”与“结构破坏”的难题。
- 功能全覆盖:系统评估了5S RNA对50S亚基所有已知功能的影响,数据全面。
- 结构-功能关联:揭示了5S RNA通过维持亚基结构和蛋白招募间接调控功能的机制。
其他价值
研究为核糖体结构与功能的深入研究提供了新模型,并为靶向5S RNA的抗生素设计提供了理论依据。文末补充说明,即使5S RNA残留量极低(%),[-5S]颗粒仍保留部分活性,提示5S RNA可能非唯一功能决定因素,需进一步探索其协同作用机制。