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花生转录因子AhHDZ70的生物信息学分析及耐盐耐旱性研究

期刊:生物技术通报DOI:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2025-0901

吴翠翠(1)、陈登科(1,2)、兰刚(1)、夏芝(1)、李朋波(1)等作者(1. 山西农业大学棉花研究所;2. 山西农业大学农学院)在《生物技术通报》(Biotechnology Bulletin)2026年第42卷第4期发表了题为《花生转录因子AhHDZ70的生物信息学分析及耐盐耐旱性研究》的原创性研究论文。该研究聚焦植物逆境生物学领域,针对干旱和盐胁迫严重影响花生产量与品质的农业问题,首次系统解析了花生HD-ZIP II家族转录因子AhHDZ70的分子特性及其在非生物胁迫响应中的功能机制,为花生抗逆育种提供了重要基因资源。

学术背景

花生(Arachis hypogaea L.)是我国重要的油料作物,但约3,000万公顷盐碱地和干旱地的低利用率制约其产业发展。HD-ZIP(Homeodomain-Leucine Zipper,同源结构域-亮氨酸拉链)转录因子家族在植物生长发育和逆境响应中具有关键作用,但花生中该家族基因的功能研究尚属空白。课题组前期发现AhHDZ70(Ah12g074600.1)在盐旱胁迫下表达显著上调,本研究旨在揭示其分子机制与生物学功能。

研究方法与流程

研究分为六个核心环节:
1. 生物信息学分析
- 从花生数据库(PeanutBase)获取AhHDZ70基因组数据,利用ExPASy、SMART、GSDS等工具分析其理化性质、结构域、基因结构及启动子顺式元件。样本为四倍体栽培种Tifrunner全基因组数据。
- 创新性发现:启动子区含2个干旱诱导元件(MBS基序)、1个逆境响应元件(TC-rich repeats)和1个低温响应元件(LTR),暗示其多胁迫调控潜能。

  1. 表达模式解析

    • 通过转录组(PRJNA291488、PRJNA248163)和RT-qPCR检测AhHDZ70在22个组织器官及盐(300 mmol/L NaCl)、干旱(30% PEG6000)、温度胁迫(4℃/37℃)下的表达谱。
    • 实验样本:花生品种”青花6号”苗期至种子膨大期的根、茎、叶等器官,各处理设3次生物学重复。内参基因选用β-actin(Ah10g253500.1)。
  2. 亚细胞定位验证

    • 构建AhHDZ70-GFP融合载体,通过农杆菌GV3101介导的烟草瞬时转化,使用激光共聚焦显微镜(Leica SP8)观察定位。
  3. 遗传转化与表型分析

    • 克隆AhHDZ70全长CDS(978 bp)并构建过表达载体,转化拟南芥(Columbia-0),经卡那霉素筛选获得T3代纯合株系。
    • 胁迫表型实验:设置150 mmol/L NaCl和PEG模拟盐旱胁迫,统计发芽率(n=10/株系)及根长(ImageJ测量)。
  4. 蛋白互作预测

    • 通过STRING软件(置信阈值0.3)预测AhHDZ70互作蛋白网络,发现其可能与含HOX、HLH结构域的蛋白协同作用。
  5. 数据分析流程

    • 进化树构建采用MEGA11.0(最大似然法,Bootstrap=1,000);启动子分析使用PlantCARE;蛋白互作网络通过STRING可视化。

主要结果

  1. 分子特性

    • AhHDZ70编码326个氨基酸,属不稳定亲水蛋白(不稳定指数69.78),含典型HD-ZIP II家族结构域:N端未知功能域(5-119 aa)、DNA结合域(HD, 154-216 aa)和二聚化域(LZ, 212-255 aa)。三级结构以无规则卷曲为主(77.3%)。
  2. 表达调控特征

    • 组织特异性:种子中表达量最高(RT-qPCR验证为对照6.9倍),其次是叶片和膨大期果针。
    • 胁迫响应:盐旱处理12 h表达达峰(6.9倍),高温3 h响应最快(5.5倍),低温3 h瞬时激活(5.4倍)。
  3. 功能验证

    • 亚细胞定位证实AhHDZ70定位于细胞核。
    • 转基因拟南芥在150 mmol/L NaCl和PEG下,发芽率较野生型(WT)提高20%-30%,根长增加15.2%-27.8%(p<0.01)。

结论与价值

本研究首次阐明AhHDZ70通过调控下游胁迫响应基因增强花生耐盐耐旱性,其机制可能涉及ABA信号通路和氧化还原平衡。科学价值在于拓展了对HD-ZIP II家族功能的认识,应用价值为分子设计育种提供了候选基因。

研究亮点

  1. 发现AhHDZ70具有多胁迫响应元件并验证其核定位特性;
  2. 建立花生HD-ZIP基因功能研究的标准化流程(生物信息学→表达分析→转基因验证);
  3. 首次报道HD-ZIP II转录因子在花生抗逆中的正向调控作用。

其他发现

蛋白互作网络提示AhHDZ70可能通过HOX结构域与氧化还原相关蛋白(如含POX结构域蛋白)互作,这为解析其下游调控网络提供了新方向。

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