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利用植物益生菌基因沉默技术实现多宿主植物对多食性害虫的可持续保护

期刊:trends in biotechnologyDOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.004

学术研究报告:基于植物益生菌的基因沉默技术实现对多食性害虫的可持续防控

一、研究团队与发表信息
本研究由陈静(Jing Chen)、张荣(Rong Zhang)、张珣(Xun Zhang)等来自中国林业科学研究院生态保护研究所的团队主导,合作单位包括中国民航科学技术研究院机场研究所。研究成果发表于2025年的*Trends in Biotechnology*期刊,标题为《Sustainable protection of multiple hosts against polyphagous pests using plant probiotic-based gene silencing》。

二、学术背景与研究目标
科学领域:本研究属于农业生物技术领域,聚焦RNA干扰(RNA interference, RNAi)技术与微生物工程的交叉应用。
研究背景:多食性害虫(polyphagous pests)如美国白蛾(*Hyphantria cunea*)能危害600余种植物,传统防控方法(如化学农药或单一宿主转基因植物)存在生态风险或局限性。RNAi技术虽能高效靶向害虫基因,但面临dsRNA(双链RNA)持久性不足、保护谱窄等问题。
研究目标:开发一种基于植物益生菌(plant probiotics)的基因沉默策略(PPGS, Plant Probiotic-Based Gene Silencing),通过工程化益生菌在多种宿主植物上定殖并递送dsRNA,实现对多食性害虫的广谱可持续防控。

三、研究流程与方法
1. 益生菌分离与鉴定
- 对象:从美国白蛾的4种宿主植物(如桑树*Morus alba*)中分离内生和附生细菌。
- 方法:通过16S rDNA、*gyrA*和*rpoB*基因测序鉴定出高转化效率的菌株Bacillus paralicheniformis SH-F8(保藏号CGMCC No. 30890)。

  1. 工程菌株构建

    • 关键步骤
      • 删除SH-F8的RNase III基因(*rnc*),防止其降解dsRNA。
      • 插入T7 RNA聚合酶和双向T7启动子系统,构建能表达靶向美国白蛾*VATPase A*基因的dsRNA的突变株SH-F8δrnc::T7dsVatpaseAT7-T7P。
    • 创新方法:采用等位基因交换(allelic exchange)将dsRNA表达盒整合至基因组,避免质粒丢失问题。
  2. dsRNA表达与功能验证

    • 实验设计:比较突变株与对照株(如E. coli HT115/L4440系统)的dsRNA产量,通过喂食实验评估对美国白蛾的致死效果。
    • 结果:突变株dsRNA产量达1.67 μg/mL(与HT115系统相当),喂食后导致80%幼虫死亡率及蛹畸形(图4)。转录组分析显示,*VATPase A*沉默同时破坏能量代谢、表皮形成和细胞色素P450通路(图5)。
  3. 益生菌定殖能力测试

    • 对象:桑树和杨树(*Populus alba*)叶片。
    • 方法:喷洒菌悬液后监测35天内菌落数(CFU/g)。
    • 结果:突变株在两种植物上均能稳定定殖(内定殖104–106 CFU/g,外定殖104–107 CFU/g),且在高温高湿环境下种群密度显著提升(图6, 7)。

四、主要研究结果
1. 工程菌株的高效杀虫效果:靶向*VATPase A*的dsRNA显著抑制害虫能量代谢,导致蛹畸形和死亡(图4)。
2. 多宿主定殖能力:SH-F8在桑树和杨树上可持续定殖超过害虫取食周期(35天),为跨宿主保护提供基础(图7)。
3. 环境适应性:菌株在20–45℃和70%湿度下生长良好,且对紫外线具有较强抗性(图6)。

五、研究结论与价值
1. 科学价值:首次提出以植物益生菌为底盘微生物的PPGS策略,解决了RNAi在多食性害虫防控中宿主范围窄和持久性差的问题。
2. 应用价值:为林业和农业中难以轮作的生态系统(如森林)提供可持续防控方案,减少化学农药依赖。
3. 技术亮点:基因组整合dsRNA表达系统避免了质粒不稳定性,且无需IPTG诱导,适合田间应用。

六、研究创新点
1. 方法创新:开发无需质粒的dsRNA表达系统,通过基因组整合提升稳定性。
2. 策略创新:利用益生菌跨宿主定殖能力,实现多植物协同保护。
3. 发现创新:揭示*VATPase A*沉默同时破坏害虫能量代谢和表皮形成的双重机制(图5)。

七、其他重要内容
研究还指出未来需优化菌株的dsRNA表达效率,评估工程菌株的生态风险,并探索同时靶向多种害虫的潜力(如整合多重dsRNA至单一菌株)。

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