小麦粒重与产量调控新机制:TaGDSL-7D启动子自然变异的功能解析
作者与发表信息
本研究由Fei He、Dejie Du、Zhaoyan Chen等(†共同第一作者)及通讯作者Qixin Sun*与Zhongfu Ni*(中国农业大学分子设计育种前沿科学中心/作物杂种优势研究与利用教育部重点实验室)合作完成,于2025年5月29日发表于*Plant Biotechnology Journal*(DOI: 10.1111/pbi.70204)。
学术背景
小麦是全球重要的粮食作物,其产量三要素(单位面积穗数、穗粒数和粒重)中,粒重(Grain Weight, GW)是决定产量的关键因素之一。然而,小麦粒重的遗传调控机制尚未完全阐明。GDSL家族酯酶/脂肪酶(GDSL-family lipases/esterases)在植物中广泛存在,参与多种生理过程,但其在小麦粒重调控中的作用鲜有报道。本研究通过图位克隆(map-based cloning)鉴定到小麦7D染色体上的候选基因*TaGDSL-7D*,解析其启动子自然变异通过增强转录因子TaGT1结合能力提升表达水平,进而增加粒重的分子机制,为高产育种提供了重要靶点。
研究流程与实验设计
1. 近等基因系构建与表型分析
- 研究材料:以小麦品种Hesheng2(HS2)和Nongda4332(4332)为亲本,构建近等基因系(NILs)NILHS2和NIL4332,背景相似度达97.8%。
- 表型检测:田间试验显示,NILHS2的千粒重(TGW)、粒长、粒宽及单株产量显著高于NIL4332(P < 0.001),而株高、穗长无显著差异。
- 关键发现:粒重差异与*TaGDSL-7D*表达量显著相关。
2. 精细定位与候选基因鉴定
- 定位策略:利用重组单株(9500株群体)将*QTGW.CAU-7D*定位至7D染色体1.6 Mb区间(标记M4-M34),包含32个高置信基因。
- 候选基因筛选:通过启动子区(2 kb)变异分析和qRT-PCR,发现*TraesCS7D02G109200*(命名为*TaGDSL-7D*)在NILHS2中表达量较NIL4332高4.5倍,其编码GDSL家族蛋白,定位于内质网(ER)。
- 同源基因分析:*TaGDSL-7D*的同源基因*TaGDSL-7A*和*TaGDSL-7B*在籽粒中表达极低,提示其功能特异性。
3. 功能验证与分子机制
- 启动子变异验证:HS2启动子区-1666至-1665 bp的TT>GG变异通过瞬时表达实验证实增强转录活性(12倍差异)。
- CRISPR/Cas9敲除:在品种‘Fielder’(弱启动子型)中敲除*TaGDSL-7D*导致粒重显著下降;而在‘CB037’(强启动子型)中敲除同样验证其正向调控作用。
- 互补实验:将HS2启动子片段转入‘Fielder’后,粒重恢复并显著提升。
4. 转录调控机制解析
- 转录因子筛选:发现Trihelix家族蛋白TaGT1结合启动子区GT1-like motif(GGTTAG),EMSA和Y1H证实其结合能力受TT/GG变异影响(TT型结合更强)。
- 协同调控:TaGT1与油菜素内酯(BR)信号通路关键因子TaBZR1互作,通过Co-IP和双荧光素酶实验证明二者协同激活*TaGDSL-7D*表达。
5. 单倍型分析与育种应用
- 地理分布:在174份小麦材料中,*TaGDSL-7DHS2*等位基因仅存在于中国品种(频率7.5%),现代品种中占比显著高于地方种(85.5% vs 4.3%)。
- 产量潜力:NILHS2在高低密度种植下均比NIL4332增产,证实其育种价值。
主要结果与逻辑链条
- 定位与候选基因:通过NILs表型差异锁定*TaGDSL-7D*,其启动子变异(TT>GG)导致表达量差异。
- 功能验证:敲除实验证明*TaGDSL-7D*正向调控粒重;互补实验确认启动子变异的功能。
- 分子机制:TaGT1-TaBZR1复合物通过结合启动子GT1-like motif和BR响应元件(BRRE)协同激活转录。
- 育种意义:*TaGDSL-7DHS2*与早熟基因*FT-1*的紧密连锁解释了其在现代品种中的高频选择。
结论与价值
- 科学价值:首次揭示GDSL家族基因通过ER定位和脂代谢途径调控小麦粒重,拓展了粒重遗传网络。
- 应用价值:*TaGDSL-7DHS2*为分子标记辅助育种提供了高效靶点,其与*FT-1*的连锁可通过基因编辑优化组合以突破产量瓶颈。
研究亮点
- 新基因功能:发现*TaGDSL-7D*作为GDSL家族成员调控粒重的新机制。
- 创新方法:结合图位克隆、单倍型分析和基因编辑,系统解析自然变异的育种潜力。
- 调控网络:揭示TaGT1-TaBZR1协同转录调控的分子模块,为BR信号通路与粒重关联提供新证据。
其他价值
研究还发现*TaGDSL-7D*与早熟基因*FT-1*的紧密连锁可能通过育种选择无意固定,提示未来需通过基因编辑解耦此类关联以最大化产量潜力。