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DNA合成技术:缩小基因书写差距

期刊:nature reviews chemistryDOI:10.1038/s41570-022-00456-9

本文是一篇综述文章,发表于2023年3月的《Nature Reviews Chemistry》期刊,题为“DNA Synthesis Technologies to Close the Gene Writing Gap”。文章由Alex Hoose、Richard Vellacott、Marko Storch、Paul S. Freemont和Maxim G. Ryadnov等作者共同撰写,分别来自英国国家物理实验室、Biologic Technologies、伦敦生物铸造厂(Imperial College London)等机构。文章主要探讨了DNA合成技术的发展现状、商业化进展以及未来挑战,旨在缩小DNA“读取”与“写入”之间的技术差距。

学术背景

DNA作为生命的信息存储载体,自其结构被发现以来,已成为化学、生物学和材料科学等领域的重要研究工具。随着合成生物学的兴起,DNA的需求量急剧增加,尤其是在基因工程、治疗、数据存储和纳米技术等领域。尽管DNA测序技术(如下一代测序技术,NGS)取得了巨大进展,DNA合成技术却相对滞后,尤其是合成超过200个碱基对(bp)的长链DNA仍然成本高昂且效率低下。为了缩小这一差距,研究人员开发了多种替代技术,包括分子组装、克隆方法、无模板酶促合成、微阵列和滚环扩增等技术。

主要内容

文章首先回顾了DNA合成技术的发展历程,将其分为四个阶段:DNA测序技术的成熟、CRISPR基因编辑技术的兴起、DNA合成技术的商业化以及未来大规模DNA合成的需求。文章指出,尽管DNA测序技术已经能够以极低的成本快速读取DNA序列,但DNA合成技术仍然面临诸多挑战,尤其是在合成长链DNA时,效率低、成本高的问题尤为突出。

DNA合成技术的现状

文章详细介绍了当前主流的DNA合成技术,包括化学合成和酶促合成两大类。化学合成方法中,磷酸酰胺化学(phosphoramidite chemistry)是主流技术,能够高效合成短链DNA(<200 bp),但在合成长链DNA时效率显著下降。酶促合成技术则通过使用DNA聚合酶或末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)等酶类,能够在无模板的情况下合成DNA,具有更高的环境友好性和可扩展性。

商业化进展

文章列举了多家在DNA合成领域具有代表性的公司,如DNA Script、Twist Bioscience、Evonetix等,并分析了它们的技术优势和局限性。例如,DNA Script开发了基于TdT的酶促合成技术,能够快速合成短链DNA;Twist Bioscience则通过微阵列技术实现了高通量的DNA合成。此外,文章还讨论了DNA合成技术的商业模型,包括定制合成服务和桌面DNA打印机等。

未来挑战与展望

文章指出,尽管DNA合成技术取得了显著进展,但仍面临诸多挑战。首先,合成长链DNA的效率仍然较低,尤其是在合成超过1 kb的DNA时,错误率显著增加。其次,DNA合成技术的商业化需要更多的自动化和标准化,以降低成本并提高可重复性。此外,随着DNA合成技术的普及,生物安全问题也日益凸显,需要制定相应的监管政策。

文章的意义与价值

本文系统地回顾了DNA合成技术的发展历程和商业化进展,为研究人员提供了全面的技术概览。文章不仅总结了当前技术的优缺点,还展望了未来的发展方向,尤其是在合成长链DNA、提高合成效率和降低成本方面的潜力。此外,文章还强调了DNA合成技术在生物安全、环境保护和标准化方面的重要性,为未来的技术开发和政策制定提供了重要参考。

亮点

  1. 技术综述:文章全面回顾了DNA合成技术的发展历程,涵盖了化学合成、酶促合成、微阵列技术等多种方法。
  2. 商业化分析:文章详细分析了多家DNA合成公司的技术优势和商业模型,为读者提供了行业现状的全面了解。
  3. 未来展望:文章不仅总结了当前技术的局限性,还展望了未来的发展方向,尤其是在合成长链DNA和提高合成效率方面的潜力。
  4. 生物安全与标准化:文章强调了DNA合成技术在生物安全和标准化方面的重要性,为未来的技术开发和政策制定提供了重要参考。

本文为DNA合成技术的研究人员和行业从业者提供了宝贵的技术和商业参考,具有重要的学术和实际应用价值。

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