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银纳米颗粒沉淀希瓦氏菌生物膜的表面增强共聚焦拉曼显微镜原位分析

期刊:PLoS ONEDOI:10.1371/journal.pone.0145871

本文档属于类型a,以下为学术报告内容:

第一,研究的主要作者及机构
本研究的主要作者包括Gal Schkolnik、Matthias Schmidt、Marco G. Mazza、Falk Harnisch和Niculina Musat。Gal Schkolnik来自德国马克斯·普朗克动力学与自组织研究所(Max Planck Institute for Dynamics and Self-Organization)以及德国亥姆霍兹环境研究中心(Helmholtz Centre for Environmental Research)。其他作者也分别来自这些机构。该研究于2015年12月28日发表在《PLOS ONE》期刊上。

第二,研究的学术背景
本研究的主要科学领域是微生物电化学和生物膜分析。Shewanella oneidensis MR-1是一种电活性细菌,能够还原细胞外不溶性电子受体,如金属氧化物和正极电极。这种细菌在自然界中的营养循环以及微生物电化学技术(如微生物燃料电池和微生物电合成)中具有重要作用。本研究旨在利用Shewanella oneidensis MR-1在Ag/AgCl固体界面上沉淀银纳米颗粒(AgNP)的特性,通过表面增强共聚焦拉曼显微镜(SECRAM)技术,对生物膜的化学组成进行原位分析。研究的目标是监测生物膜中细胞色素、还原和氧化黄素、多糖和磷酸盐的分布,并开发一种新的方法,避免使用贵金属盐和还原剂,从而实现对生物膜的空间和时间分辨化学分析。

第三,研究的详细工作流程
研究包括以下几个主要步骤:
1. 细菌培养:使用Shewanella oneidensis MR-1菌株,首先在LB培养基中进行预培养,随后转移到含有20 mM乳酸钠的最小培养基中进行厌氧培养。
2. 实验装置准备:在显微镜载玻片上涂覆Ag/AgCl墨水,形成约2x5 mm²的椭圆形区域,并在100°C和200°C下分别进行预固化和固化处理。将细菌悬液沉积在固化后的Ag/AgCl区域上,并用盖玻片密封形成薄层腔室。
3. 对照实验:包括无细菌的对照组、使用非还原性墨水(介电聚合物)的对照组以及添加可溶性电子受体(富马酸钠)的对照组。
4. 显微镜观察:使用奥林巴斯BH-2光学显微镜在暗场模式下观察生物膜的生长情况,并记录图像和视频。
5. 表面增强共聚焦拉曼显微镜(SECRAM)分析:使用WITec alpha300共聚焦拉曼显微镜,以532 nm的激发波长和3 mW的激光功率进行拉曼光谱分析。研究在不同时间点(1、3、6、9和35天)对生物膜进行拉曼信号的时间序列分析。
6. SEM-EDX分析:使用Zeiss Merlin VP场发射扫描电子显微镜(SEM)和能量色散X射线光谱仪(EDX)对生物膜的形态和元素组成进行分析。样品在固定后进行临界点干燥和铬溅射处理。
7. 数据分析:通过拉曼光谱的基线扣除和成分分配,生成不同化学成分的强度图,并对最强烈的10%像素进行平均光谱计算,以分析生物膜的化学组成随时间的变化。

第四,研究的主要结果
1. 生物膜的形成与AgNP沉淀:Shewanella oneidensis MR-1在Ag/AgCl固体界面上形成了含有AgNP的生物膜。SEM-EDX分析显示,AgNP以多种形状(如圆形、三角形和六边形)存在于生物膜中,且随着时间推移,生物膜中的AgNP逐渐增多。
2. 拉曼信号的增强:SECRAM分析显示,随着生物膜的发展,拉曼信号热点出现在AgNP沉淀的区域。拉曼信号的强度随时间变化,表明生物膜中的化学成分分布发生了动态变化。
3. 化学成分的分布:研究发现,细胞色素和黄素在Ag/AgCl界面附近分布较为密集,而多糖和磷酸盐的分布则较为均匀。随着时间的推移,还原黄素的含量逐渐增加,表明细菌在生物膜中寻找电子受体的能力受到限制。
4. 对照实验的结果:无细菌的对照组未观察到AgNP沉淀,非还原性墨水对照组中的细菌未能存活,而添加富马酸钠的对照组中细菌虽然存活,但未形成富含多糖的生物膜。

第五,研究的结论
本研究开发了一种新的方法,利用Shewanella oneidensis MR-1在Ag/AgCl界面上沉淀AgNP的特性,通过SECRAM技术对生物膜进行原位化学分析。该方法避免了使用贵金属盐和还原剂,为研究电活性生物膜提供了新的工具。研究首次实现了对Shewanella生物膜中多种化学成分的空间和时间分辨分析,揭示了生物膜中细胞色素、黄素、多糖和磷酸盐的分布动态。

第六,研究的亮点
1. 新方法的开发:本研究首次利用生物沉淀的AgNP进行SECRAM分析,避免了传统方法中使用的贵金属盐和还原剂,为生物膜的原位分析提供了新的技术手段。
2. 化学成分的动态分析:研究首次实现了对Shewanella生物膜中多种化学成分的空间和时间分辨分析,揭示了生物膜中化学成分的动态变化。
3. 多学科交叉:本研究结合了微生物学、电化学和拉曼光谱学等多个学科的技术,为电活性生物膜的研究提供了新的视角。

第七,其他有价值的内容
本研究还探讨了AgNP的形状和大小对拉曼信号增强的影响,发现不同形状的AgNP(如三角形和六边形)在特定波长下具有不同的拉曼增强效果。此外,研究还提出了未来可以在三维空间和更高时间分辨率下进行类似分析的展望,为生物膜研究提供了新的方向。

本研究不仅为电活性生物膜的分析提供了新的技术手段,还为理解生物膜中化学成分的动态分布提供了重要的实验数据,具有重要的科学价值和应用潜力。

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