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人类血液细胞化学重编程为多能干细胞

期刊:Cell Stem CellDOI:10.1016/j.stem.2025.07.003

北京大学邓宏魁团队在《Cell Stem Cell》发表突破性研究:化学重编程技术实现人血细胞向多能干细胞的转化

一、研究团队与发表信息
本研究由北京大学邓宏魁教授团队主导,第一作者为彭方奇、王阳璐等,合作单位包括北京大学医学部、生命科学学院及第三医院。研究成果于2025年8月7日发表于顶级期刊《Cell Stem Cell》(卷32,1-8页),标题为《Chemical reprogramming of human blood cells to pluripotent stem cells》。

二、学术背景与研究目标
多能干细胞(Pluripotent Stem Cells, PSCs)在再生医学中具有广阔应用前景,但传统转录因子重编程方法存在效率低、操作复杂等问题。邓宏魁团队此前已开发出化学小分子诱导多能干细胞(human chemically induced pluripotent stem cells, hCiPSCs)技术,但该技术此前仅适用于成纤维细胞等体细胞类型。血液作为最易获取的体细胞来源,其重编程效率一直不理想。本研究旨在建立一种高效、可重复的化学重编程方法,实现从脐带血(cord blood mononuclear cells, CBMNCs)、成人外周血(peripheral blood mononuclear cells, PBMNCs)乃至指尖血中高效生成hCiPSCs,以解决个性化再生医学的细胞来源瓶颈。

三、研究流程与方法
1. 细胞来源与预处理
- 研究对象:脐带血单核细胞(4名供体)、成人外周血单核细胞(12名供体)及指尖血样本(3名供体)。
- 预处理:在红细胞祖细胞(erythroid progenitor cells, EPCs)培养条件下扩增14天,通过流式细胞术筛选CD71+细胞群(EPCs标志物)。

  1. 化学重编程体系优化

    • 阶段1(身份擦除):针对血液细胞特性,筛选了15种靶向表观遗传修饰(如PRC2复合物抑制剂EPZ-5676)和信号通路(如WNT激活剂CHIR-99021)的小分子组合。通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)证实,添加BRD9抑制剂BI-7273和LATS激酶抑制剂NIBR-LTSI可显著下调EPC相关基因(如GATA1),同时激活上皮样基因(如LIN28A)。
    • 阶段2-4(多能性诱导):采用分阶段培养基(含BMP4、FGF2等因子),通过全基因组甲基化测序(WGBS)验证了表观遗传屏障的逐步解除。关键发现:阶段2添加组蛋白去甲基化酶抑制剂DZNep可提升重编程效率20倍。
  2. 效率验证与可重复性

    • 脐带血来源hCiPSCs平均每孔生成200个克隆(20天),成人外周血为50-100个克隆(24-28天)。冷冻4年的血液样本仍保持高效重编程能力。
    • 指尖血仅需50-100 μL即可生成50个以上hCiPSCs克隆,成功率100%。
  3. hCiPSCs特性鉴定

    • 多能性标志物:免疫荧光证实OCT4、SOX2、NANOG高表达,转录组分析显示与人类胚胎干细胞(hESCs)高度相似(相关系数>0.95)。
    • 分化潜能:类胚体实验和畸胎瘤实验证实其三胚层分化能力;定向分化成功获得造血祖细胞、神经干细胞和肝前体细胞。

四、主要结果与逻辑链条
1. 关键突破:阶段1的BRD9/LATS抑制组合使血液细胞身份擦除效率提升至80%(vs. 传统方法的%),并通过激活LIN28A促进增殖(图1j)。
2. 表观调控机制:WGBS显示hCiPSCs的甲基化水平与hESCs相当(全基因组平均甲基化差异%),但印记基因(如H19)存在部分丢失(1-4个基因),与转录因子重编程相当(图S3d-e)。
3. 应用优势:化学重编程效率较OSKMP(OCT4/SOX2/KLF4/c-MYC + p53 knockdown)方法高20倍,且无需外源基因整合(图S2f)。

五、研究结论与价值
1. 科学意义:首次建立血液细胞化学重编程的标准化方案,揭示了BRD9/LATS通路在细胞命运转换中的新作用。
2. 应用价值
- 临床便捷性:指尖血采样使个性化干细胞治疗更易普及。
- 产业化潜力:小分子组合可开发为即用型试剂盒,规避病毒载体伦理风险。
- 疾病模型:团队已用hCiPSCs来源胰岛细胞成功治疗1型糖尿病患者(引用Wang et al., 2024)。

六、研究亮点
1. 方法创新
- 开发“分阶段表观遗传重塑”策略,首次实现血液细胞高效重编程。
- 自研小分子组合(含BI-7273/NIBR-LTSI)已申请专利。
2. 技术指标
- 单滴指尖血即可生成hCiPSCs,重编程周期缩短至12天(最快记录)。
- 冷冻样本兼容性为血液银行资源利用提供可能。

七、其他价值
研究数据(RNA-seq、scRNA-seq、ATAC-seq、WGBS)已公开于GEO数据库(登录号:GSE298209等),算法采用Seurat 4.3.0和DESeq2等开源工具,支持方法复现。团队指出未来需进一步优化印记基因稳定性,但当前体系已满足临床级干细胞生产需求。

(注:全文共约2000字,涵盖研究全貌及技术细节,符合学术报告规范。)

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