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临床推进BDK抑制剂的研究

期刊:Journal of Medicinal ChemistryDOI:https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.5c00002

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主要作者与研究机构、发表时间与期刊

本文由 Kukkamudi Sreenivas 和 Chintada Nageswara Rao 两位作者完成,来自 University of South Carolina 的 Department of Drug Discovery and Biomedical Sciences,文章发表于 2025年1月15日的 *Journal of Medicinal Chemistry*(68卷,2441-2443页)。


主题

本文综述了分支链α-酮酸脱氢酶激酶(Branched-Chain α-Ketoacid Dehydrogenase Kinase,简称 BDK)抑制剂的临床应用前景,聚焦其在心血管疾病(Cardiovascular Diseases, CVD)、代谢紊乱以及其他疾病中的潜在治疗作用。文章特别探讨了首个具有临床潜力的BDK抑制剂 PF-07328948 的开发历程、分子特性及生物学意义。


主要观点

1. 背景知识和研究动机

文章指出,分支链氨基酸(Branched-Chain Amino Acids,BCAA)的代谢失衡与多种代谢性疾病如肥胖、胰岛素抵抗(T2DM)、心血管疾病和癌症的病理生理密切相关。BCAA 包括亮氨酸(Leucine)、异亮氨酸(Isoleucine)和缬氨酸(Valine),它们在蛋白质合成、能量代谢、营养信号调节等过程中发挥重要作用。然而,BCAA 代谢通路的不正常调控会诱发多种严重疾病,包括心血管障碍和神经代谢性疾病。

BDK 是 BCAA 代谢的重要负调控因子,其通过磷酸化 BCKDH(分支链α-酮酸脱氢酶复合物)抑制 BCAA 的氧化分解。这一机制的过度活跃会导致 BCAA 的异常累积,继而引发代谢紊乱。因此,开发针对 BDK 的抑制剂对恢复 BCAA 代谢平衡有重要意义。

2. 首个临床潜力 BDK 抑制剂 PF-07328948 的简介

作者综述了 PF-07328948 的开发过程和分子特性。PF-07328948 是一种高效、具有临床潜力的 BDK 抑制剂,目前正在用于心血管代谢障碍的 I 期临床试验中。文章强调,该化合物具有优越的药物特性,如高效的结合能力、良好的药物动力学性能以及可逆的非共价作用机制。

PF-07328948 的设计基于 BT2(一种早期BDK抑制剂)系列化合物的优化。将 BT2 分子中的部分取代基替换为氟原子及三氟甲氧基苯基基团,极大增强了分子与 BDK 的非极性作用和脂溶性适配性。同时,该化合物还利用了角二面角(dihedral angle)优化,使其对 BDK 的结合能力显著提高。

3. BCAA 代谢在疾病中的作用及 BDK 靶点意义

作者详细讨论了 BCAA 代谢失衡与多种疾病之间的关系,以及抑制BDK对相关病症的治疗潜力:

  • 心血管疾病与代谢紊乱
    文中指出,2021年全球约有2050万人死于心血管疾病,而 BCAA 代谢障碍与这些疾病的病理生理密切相关。BDK过度活跃被证明会导致BCAA代谢的损害,增强胰岛素抵抗和肥胖风险。通过抑制BDK,可降低亮氨酸诱导的 mTORC1 信号通路过度活跃,从而改善胰岛素敏感性和代谢健康。

  • 神经代谢性疾病
    BCKDH 突变或 BDK 过表达可能引发枫糖尿症(MSDU)等罕见病,以及自闭症、癫痫和认知障碍等神经发育性疾病。文章指出,BDK 抑制剂可能通过恢复 BCAA 的正常代谢对这些疾病产生积极作用。

  • 肿瘤发展
    在结直肠癌、肝细胞癌(HCC)等多种癌症中,BDK 的异常磷酸化(如 Y246 位点)会增强其活性,促进癌细胞的迁移、侵袭和上皮-间质转化(EMT)。因此,BDK 的靶向抑制有望作为抗肿瘤策略的一部分。

  • 糖尿病引发的心肌缺血再灌注(MI/R)损伤
    糖尿病患者因BCAA代谢缺陷更易受到MI/R损伤的影响。研究表明,BDK 抑制剂 BT2 可显著减轻 diabetic mice 的心肌损伤。

4. PF-07328948 的分子机制

文章详细描述了 PF-07328948 的分子作用机制及优势:
该药物通过结合 BDK 的激酶结构域及调控口袋,抑制其功能并使其更倾向于被降解。X射线晶体结构分析(如 PDB:9di9 数据)显示,PF-07328948 的关键化学改造生成了一种新颖的隐性结合口袋,从而显著增强了其抑制效能。同时,其作用可通过非共价机制实现可逆调节,避免了早期共价抑制剂可能引发的毒性风险。

此外,PF-07328948 的设计结合了分子对接预测和 Alphafold3 技术辅助的蛋白质结构超定位,这些先进技术显著加速了药物开发流程。

5. 关键意见与展望

作者强调,在当前的 BDK 抑制剂研究领域,PF-07328948 被认为是一个里程碑式的分子。它不仅在模型实验中表现出显著的代谢调控潜力,而且在心脏功能保护和代谢紊乱治疗中具有重要的临床意义。此外,文章呼吁深入研究 BDK 抑制剂的作用机制及在特定疾病环节中的靶点意义,以最大化其应用价值。


总结与意义

本文基于现有科研成果对 BDK 抑制剂的开发及其临床应用价值进行了深入综述,并通过探讨 PF-07328948 的分子机制及其生物学效应,展示了该领域的前沿进展和技术突破。这篇综述为进一步研究 BDK 与代谢紊乱的关联提供了理论依据,并对心血管疾病、神经代谢障碍及癌症等重大公共健康问题开辟了可能的治疗新方向。

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