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视网膜与大脑连接的多模态成像遗传学研究
作者及机构:
本研究由宾夕法尼亚大学、北卡罗来纳大学教堂山分校等机构的联合团队完成,通讯作者为Bingxin Zhao和Hongtu Zhu,合作作者包括Yujue Li、Zhenyi Wu等20余位研究者。研究成果发表于Nature Communications(2024年7月),标题为《Eye-brain connections revealed by multimodal retinal and brain imaging genetics》。
学术背景
科学领域:本研究属于神经科学与遗传学的交叉领域,聚焦于视网膜与大脑的结构和功能关联。
研究动机:视网膜作为大脑的解剖学延伸,其非侵入性成像特性为研究脑部疾病(如阿尔茨海默病、精神分裂症等)提供了独特窗口。然而,视网膜与大脑的遗传共架构(genetic co-architecture)尚未被系统解析。
研究目标:
1. 通过多模态视网膜和脑部成像数据,揭示表型与遗传层面的眼-脑关联;
2. 定位共享遗传风险的基因组区域;
3. 探索视网膜成像标志物对脑部疾病的预测潜力。
研究流程与方法
1. 数据来源与研究对象
- 数据来源:英国生物银行(UK Biobank, UKB)的15.6万参与者,其中6,454名白人英国裔个体用于表型关联分析,60,748人用于全基因组关联分析(GWAS)。
- 视网膜成像数据:
- 光学相干断层扫描(OCT):46项视网膜层厚度指标(如神经纤维层RNFL、神经节细胞层GCIPL等);
- 眼底摄影:通过11种预训练深度学习模型(如VGG19、ResNet50)提取110个图像特征。
- 脑部MRI数据:458项指标,包括结构MRI(101个脑区体积、63个皮质厚度)、扩散张量成像(DTI,110项白质参数)和功能MRI(fMRI,184项功能连接指标)。
2. 表型关联分析
- 方法:线性模型校正年龄、性别、血管风险因素等协变量,采用Bonferroni校正多重检验(显著性阈值p<6.99×10⁻⁷)。
- 关键发现:
- 视网膜厚度与脑结构:GCIPL厚度与初级视觉皮层(pericalcarine)体积正相关(β>0.052, p<5.90×10⁻⁵);
- 白质完整性:RNFL厚度与视辐射(optic radiation)的分数各向异性(FA)显著关联(β>0.142, p<1.91×10⁻²³);
- 性别差异:女性中视网膜-DTI关联更强,男性中皮质厚度关联更显著。
3. 遗传学分析
- GWAS与遗传力:
- OCT指标平均SNP遗传力(h²)为42.21%,眼底影像特征为19.27%;
- 发现258个基因组区域与视网膜性状相关,其中65个与脑部表型或疾病共享遗传信号(如11q24.3区域关联脑脊液体积与杯盘比)。
- 孟德尔随机化(MR):
- 双向因果分析显示,阿尔茨海默病(AD)与视网膜内核层(INL)厚度存在遗传因果关联(β>0.025, p<4.74×10⁻⁵)。
4. 跨器官预测模型
- 联合预测:视网膜与脑部成像数据联合预测流体智力(fluid intelligence)的准确率显著提升(r=0.344 vs. 单模态r=0.179)。
主要结果与逻辑链条
- 表型关联:视网膜厚度减少与脑萎缩、白质损伤显著相关,支持视网膜作为脑退行性变的早期标志物。
- 遗传共定位:65个基因组区域(如6q14.2)同时影响视网膜结构和脑疾病(如精神分裂症、AD),提示共同病理机制。
- 因果推断:MR证实脑疾病(如AD)可导致视网膜结构改变,反之亦然,揭示双向调控通路。
结论与价值
科学意义:
- 首次系统性揭示视网膜与大脑的遗传共架构,为“视网膜作为脑疾病窗口”假说提供遗传证据;
- 定位65个跨器官风险基因座,为神经退行性疾病(如AD、帕金森病)的早期诊断提供新靶点。
应用价值:
- 非侵入性视网膜成像可辅助脑疾病风险分层;
- 多模态影像联合分析提升脑表型预测精度,推动精准医学发展。
研究亮点
- 多模态创新:整合OCT、眼底摄影与多模态MRI,首次实现眼-脑表型与遗传的跨器官解析;
- 方法学突破:开发基于深度学习的眼底特征提取算法(如TransferGWAS),提升遗传分析灵敏度;
- 临床转化潜力:发现INL增厚与AD的负遗传相关,挑战传统神经退行性变模型,提示炎症早期作用。
其他重要发现
- 细胞机制:遗传变异富集于脑胶质细胞调控区(如neun-),提示胶质-视网膜轴在脑疾病中的关键角色;
- 跨人群验证:欧洲与非欧洲人群的遗传关联一致性达51.05%,支持结果普适性。
(全文完)