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玉兰降糖胶囊治疗糖尿病肾病的整合代谢组学与网络药理学分析

期刊:PhytomedicineDOI:10.1016/j.phymed.2025.157189

玉兰降糖胶囊治疗糖尿病肾病:整合代谢组学与网络药理学机制研究

主要作者与发表信息

本研究由北京中医药大学中药学院的研究团队完成,第一作者为Xiaochun Zheng和Lan Xie(二人为共同第一作者),通讯作者为Shuofeng Zhang和Fang Fang。该论文发表于Phytomedicine期刊第147卷(2025年),文章编号157189,于2025年3月19日投稿,2025年8月22日接收,2025年8月23日在线发表。

学术背景

糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)是糖尿病最严重的微血管并发症之一,也是导致终末期肾病和糖尿病患者死亡的重要原因。目前临床上针对DN的有效治疗药物仍然有限,主要依赖血糖控制、血压管理和肾素-血管紧张素系统阻断等策略,但疗效尚不理想。因此,开发安全有效的DN治疗药物具有迫切的临床需求。

传统中药(traditional Chinese medicine,TCM)在糖尿病及其并发症的管理中展现了广泛的临床应用价值。玉兰降糖胶囊(Yulan Jiangtang Capsules,YL)是经临床批准的中成药,由黄芩(Scutellaria baicalensis Georgi)、桑叶(Morus alba L.)、牛蒡子(Arctium lappa L.)、蓝花参(Wahlenbergia marginata)、半枝莲(Scutellaria barbata D.Don)、假万寿竹根(Disporopsis longifolia Craib)和青葙子(Celosia argentea L.)等药材组成。既往临床研究表明,YL能有效降低2型糖尿病患者的空腹血糖(fasting blood glucose,FBG)、餐后2小时血糖和糖化血红蛋白水平,并改善糖尿病视网膜病变症状。然而,YL对DN的治疗作用及其分子机制尚不完全清楚。

本研究旨在采用网络药理学(network pharmacology)、代谢组学(metabolomics)和实验验证相结合的综合策略,系统阐明YL治疗DN的潜在机制,为其临床应用提供实验依据。

研究流程与方法

本研究主要包括五个研究环节:

第一环节:YL化学成分鉴定。 采用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱串联质谱(UPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS/MS)对YL的化学成分进行系统鉴定。流动相采用0.1%甲酸水溶液(A相)和乙腈(B相),梯度洗脱25分钟,分别在正、负离子模式下采集数据。质谱扫描范围为100–1500 m/z,一级质谱分辨率为70,000 FWHM,二级质谱分辨率为17,500 FWHM。数据经Xcalibur 3.2软件和Compound Discoverer软件处理,通过保留时间、前体离子质量和碎片离子质量进行化合物鉴定。

第二环节:网络药理学分析。 将鉴定出的YL化学成分的结构信息输入SwissTargetPrediction和Super-Pred数据库获取药物靶点;从GeneCards和Therapeutic Target Database检索DN相关靶点;取交集获得YL治疗DN的潜在靶点。利用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,设置物种为“Homo sapiens”,互作评分阈值≥0.7,通过Cytoscape 3.9.0可视化并筛选核心靶点。利用DAVID数据库进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析(显著性阈值p<0.05)。此外,采用AutoDock Tools 1.5.6对排名前十的关键化合物与核心靶点进行半柔性分子对接,以二甲双胍和厄贝沙坦为参考配体,评估结合亲和力。

第三环节:动物实验验证。 采用高脂高糖饮食喂养4周联合链脲佐菌素(streptozotocin,STZ,35 mg/kg腹腔注射)建立DN大鼠模型。注射STZ后72小时随机血糖≥16.7 mmol/L视为糖尿病模型建立成功。2周后,经尿蛋白和微量白蛋白水平确认肾功能障碍后,将DN大鼠随机分为五组(每组16只,雌雄各半):模型组(Mod)、阳性药组(二甲双胍150 mg/kg+厄贝沙坦15.75 mg/kg)、YL低剂量组(189 mg/kg)、YL中剂量组(378 mg/kg)和YL高剂量组(756 mg/kg)。药物灌胃给药,每日两次,持续10周。检测指标包括体重、空腹血糖(FBG)、糖化血红蛋白(GHb)、24小时尿蛋白(24h UTP)、尿微量白蛋白(mALB)、血肌酐(SCr)、血尿素氮(BUN)、尿肌酐(UCr)和尿微量白蛋白/肌酐比值(UACR)。肾脏组织采用苏木精-伊红染色(H&E染色)、过碘酸雪夫染色(PAS染色)和透射电子显微镜(TEM)进行病理学评估。同时测定肾组织中的炎症因子(IL-1β、IL-6、TNF-α)、丙二醛(MDA)水平和超氧化物歧化酶(SOD)活性。采用蛋白质印迹法(Western blotting)检测肾组织中AGEs、RAGE、NF-κB p65和磷酸化NF-κB p65的蛋白表达水平。

第四环节:非靶向尿液代谢组学。 采用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱质谱(UHPLC-QE-MS)对对照组、模型组和YL高剂量组大鼠的尿液样本进行非靶向代谢组学分析。色谱柱为ACQUITY UPLC BEH C18柱,流速0.3 mL/min,正负离子模式同时采集。数据经MSConvertGUI转换后,使用Weka BioinCloud平台进行主成分分析(PCA),采用正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)识别组间差异。差异代谢物筛选标准为:倍数变化(fold change,FC)≥2或≤0.5,变量投影重要性(VIP)值>1,且p<0.05。使用MetaboAnalyst 6.0进行KEGG通路富集分析。

第五环节:数据统计分析。 所有数据以均值±标准误表示,采用SPSS 25.0进行统计分析。正态性检验采用Shapiro-Wilk检验,正态分布数据采用单因素方差分析(ANOVA)和LSD事后检验,非正态分布数据采用非参数秩和检验,显著性水平设为p<0.05。图形绘制使用GraphPad Prism 9.0。

主要研究结果

化学成分鉴定结果: 从YL中共鉴定出119个化合物,其中正离子模式下56个,负离子模式下63个,包括57个黄酮类、9个有机酸类、8个酚类、5个木脂素类、5个氨基酸类、4个苯丙素类和4个萜类化合物等,其中104个化合物具有PubChem编号。

网络药理学结果: 鉴定出YL相关靶点791个,DN相关靶点650个,交集靶点143个。化合物-靶点网络分析显示,YL中的活性成分可作用于多个DN靶点,体现了多成分、多靶点的协同作用特点。根据网络拓扑参数,排名前十的关键化合物为:norwogonin、柚皮素((±)-naringenin)、芹菜素(apigenin)、香叶木素(diosmetin)、野黄芩素(scutellarein)、黄芩素(baicalein)、白杨素(chrysin)、山柰酚(kaempferol)、槲皮素(quercetin)和scutevulin。PPI网络分析确定了十个核心靶点:IL-6、TNF、AKT1、GAPDH、ALB、PPARG、TP53、NF-κB1、STAT3和EGFR。GO富集分析鉴定了929个显著富集条目(p<0.05),KEGG通路富集分析鉴定了170条显著富集通路(p<0.05),其中排名前十的通路包括糖尿病并发症中的AGEs-RAGE信号通路、HIF-1信号通路、胰岛素抵抗、TNF信号通路和PI3K-Akt信号通路等。分子对接结果显示,十个关键化合物与十个核心靶点的结合能均低于-5.0 kcal/mol,其中与AKT1和TNF的结合尤为紧密(结合能<-7.0 kcal/mol)。结合能排名前五的复合物为:scutevulin-AKT1、baicalein-AKT1、scutellarein-AKT1、chrysin-AKT1和scutevulin-TNF。氢键、疏水相互作用和π-堆积(平行)是化合物与靶点结合的主要作用力。

动物实验验证结果: 与对照组相比,DN模型组大鼠体重显著下降(p<0.05或p<0.01),FBG、GHb、24小时尿蛋白、mALB、SCr、BUN和UACR水平显著升高(p<0.01),UCr水平显著降低。高剂量YL(756 mg/kg)治疗可显著降低FBG、GHb、24小时尿蛋白、mALB、SCr、BUN和UACR水平(p<0.05或p<0.01),并显著升高UCr水平(p<0.05)。三个剂量组中,高剂量组疗效最佳。H&E染色显示模型组肾小管上皮细胞坏死、结构完整性丧失和胞质空泡化,YL治疗可显著改善这些损伤。PAS染色显示YL可减轻肾小球硬化程度。TEM结果显示模型组肾小球基底膜(glomerular basement membrane,GBM)增厚,YL治疗可降低GBM厚度。此外,YL治疗可显著降低肾组织中IL-6、IL-1β和TNF-α水平,降低MDA含量,并升高SOD活性(p<0.05)。

AGEs/RAGE/NF-κB通路验证结果: 与对照组相比,模型组大鼠肾组织中AGEs积累和RAGE蛋白表达显著增加(p<0.05),磷酸化NF-κB p65表达及p-NF-κB p65/NF-κB p65比值显著升高。YL治疗可显著降低肾组织中AGEs和RAGE蛋白表达水平(p<0.05),并显著降低磷酸化NF-κB p65表达及p-NF-κB p65/NF-κB p65比值。这些结果表明,YL通过调节AGEs-RAGE/NF-κB信号通路抑制炎症反应和氧化应激,从而发挥肾脏保护作用。

代谢组学结果: PCA分析显示对照组与模型组样本呈现显著分离,而YL高剂量组样本的分布与模型组有所不同。OPLS-DA模型的R²值在正负离子模式下分别为0.959和0.989(对照组vs模型组),0.956和1.0(模型组vs YL高剂量组),且Q²斜率均大于0,经200次置换检验验证模型未过拟合。与对照组相比,模型组在正离子模式下有117种代谢物发生改变,负离子模式下有69种代谢物发生改变。YL治疗可逆转5种在模型组升高而在YL高剂量组降低的代谢物(包括2′-脱氧胞苷、octopine、棕榈酸、N-苄氧羰基甘氨酸和N-乙酰神经氨酸)以及4种在模型组降低而在YL高剂量组升高的代谢物(包括α-亚麻酸、L-瓜氨酸、L-酪氨酸和N-L-γ-谷氨酰-L-亮氨酸)。KEGG通路富集分析显示,这些差异代谢物主要涉及苯丙氨酸/酪氨酸/色氨酸生物合成、苯丙氨酸代谢、α-亚麻酸代谢和精氨酸生物合成等通路。

结论与意义

本研究证实,YL治疗通过调节AGEs-RAGE轴和恢复代谢稳态,显著减轻DN大鼠的肾脏损伤,具体表现为降低血糖水平(FBG、GHb)、改善肾功能指标(SCr、BUN、24h UTP、UACR)、减轻肾脏病理损伤(肾小管上皮细胞坏死、GBM增厚等)、抑制肾脏炎症反应(降低IL-1β、IL-6、TNF-α水平)、减轻氧化应激(降低MDA、升高SOD活性)以及抑制AGEs/RAGE/NF-κB信号通路活化。同时,YL能够逆转DN大鼠尿液中多种代谢物的异常变化,涉及氨基酸代谢和脂肪酸代谢等途径。

本研究的科学价值在于:第一,系统整合了化学成分分析、网络药理学、分子对接、动物实验验证和非靶向代谢组学等多种研究手段,形成了一个多层次的机制阐明体系;第二,首次揭示了YL通过调节AGEs-RAGE/NF-κB信号轴抑制炎症和氧化应激、以及通过恢复代谢稳态来治疗DN的机制;第三,为YL在DN临床治疗中的应用提供了实验依据。本研究的应用价值在于:为YL这一已获批的临床中成药拓展了DN适应症的科学证据,也为其他中药复方治疗DN的机制研究提供了方法学参考。

研究亮点

本研究的亮点主要体现在以下方面:其一,采用“网络药理学预测—分子对接验证—动物实验确证—代谢组学补充”的多层次整合研究策略,系统深入地阐明了YL治疗DN的分子机制;其二,明确鉴定出YL中的关键活性成分为黄酮类化合物(包括norwogonin、baicalein、scutellarein、chrysin、quercetin等),并预测和验证了其核心作用靶点为AKT1、TNF、IL-6等;其三,聚焦于AGEs-RAGE/NF-κB这一DN发病机制中的核心信号通路,从蛋白表达水平证实了YL的调控作用;其四,通过非靶向代谢组学发现YL可逆转DN大鼠尿液中9种关键代谢物的异常变化,揭示了YL在代谢调控层面的治疗机制;其五,研究采用了临床等效剂量范围的三个剂量组(189、378、756 mg/kg)进行量效关系考察,确定了高剂量组的最佳疗效,为临床用药剂量提供了参考。

研究局限性

作者也在文中指出了本研究的若干局限性:首先,受当前技术条件限制,未能进行生物物理验证(如表面等离子体共振SPR和等温滴定量热法ITC)来直接表征化合物-靶点的相互作用;其次,缺乏体重调节指标的检测和系统性饮食摄入监测,无法解释YL对DN大鼠体重无明显影响的原因;第三,虽然代谢组学分析鉴定了失调的通路,但YL引起的代谢物变化与治疗效果之间的相关性仍需进一步的机制验证。这些局限性为后续研究指明了方向。

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