METTL3、m6A修饰与EGR1的相互作用影响心肌缺血/再灌注损伤结局的研究报告
一、研究概述
本研究由郑州大学第一附属医院心血管外科的Chen Huang、Xun Zhang、Shi-Xiong Wu、Qing Chang、Zhi-Kun Zheng及通讯作者Jing Xu(邮箱:fccxuj@zzu.edu.cn)共同完成。该研究成果发表于*Cell Biology and Toxicology*期刊2025年第41卷,文献编号为7。
二、学术背景与研究目的
心肌缺血/再灌注(ischemia/reperfusion,I/R)损伤是临床心脏病再灌注治疗中面临的重大障碍,其发病机制尚未完全阐明。早期生长反应因子1(early growth response 1,EGR1)是一种在细胞增殖、分化、存活和凋亡中发挥重要作用的转录因子。既往研究表明,抑制EGR1可减轻心肌I/R损伤,但其精确的调控通路仍需进一步阐明。线粒体自噬(mitophagy)作为维持细胞线粒体质量和功能的关键过程,对心肌I/R损伤具有显著影响。在心血管疾病中,N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)RNA甲基化通过其调控因子甲基转移酶样3(methyltransferase like 3,METTL3)发挥重要作用。本研究旨在探讨EGR1调控线粒体自噬介导的心肌细胞焦亡(pyroptosis)的分子通路及其对心肌I/R损伤的影响,重点阐明METTL3介导的m6A修饰在其中的调控机制。
三、详细研究流程
本研究采用了体外与体内相结合的实验策略,主要包括以下实验程序:
1. 原代心肌细胞提取与缺氧/复氧(hypoxia/reoxygenation,H/R)损伤模型的构建
研究人员从1-2日龄C57BL/6小鼠乳鼠心脏中提取原代心肌细胞,经胰蛋白酶和胶原酶消化、过滤、离心后,接种于预包被黏附蛋白的培养皿中。通过α-SCA抗体免疫荧光鉴定心肌细胞纯度大于95%。体外H/R损伤模型通过将心肌细胞置于含1% O₂、94% N₂和5% CO₂的模块化培养箱中缺氧24小时,随后在95%空气和5% CO₂环境中复氧12小时构建,以模拟体内I/R损伤。
2. 细胞分组与基因干预
实验中设置了17个细胞分组,包括对照组、H/R组、以及转染短发夹RNA(short hairpin RNA,shRNA)靶向敲低EGR1(shEGR1)、METTL3(shMETTL3)或胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白2(insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2,IGF2BP2)(shIGF2BP2)的各处理组。此外,还设置了使用线粒体自噬抑制剂3-甲基腺嘌呤(3-methyladenine,3-MA,5 mM)和JAK2/STAT3通路特异性抑制剂AG490(50 μM)的处理组,以及EGR1过表达质粒(EGR1-OE)与shMETTL3或shIGF2BP2的共转染组。转染采用Lipofectamine™ 3000转染试剂,质粒浓度为50 nM,转染48小时后通过RT-qPCR验证敲低或过表达效率。
3. 体内小鼠心肌I/R损伤模型的建立
实验选用8-10周龄雄性SPF级C57BL/6小鼠(体重20-26克),随机分为四组:Sham+shNC+NC-OE组、I/R+shNC+NC-OE组、I/R+shMETTL3+NC-OE组和I/R+shMETTL3+EGR1-OE组,每组14只。在构建I/R模型前3天,通过心肌内注射将10 μL滴度为1.5×10⁵ TU/mL的腺病毒载体注入各组小鼠心肌。I/R模型通过异氟烷麻醉后气管插管,结扎左前降支(left anterior descending,LAD)冠状动脉30分钟诱导缺血,随后释放结扎线进行60分钟再灌注。通过心电图ST段抬高确认缺血成功,ST段回落确认再灌注成功。Sham组除不结扎LAD外其余操作相同。每组6只小鼠在I/R构建7天后用于心脏功能评估,剩余8只用于Evans蓝/TTC染色及心脏和血清样本收集。
4. 检测指标与实验方法
本研究采用了多种实验技术手段:(1)心脏功能检测通过小动物超声系统(Fujifilm Vevo 3100,40 MHz探头)测量左心室射血分数(left ventricular ejection fraction,LVEF)和左心室短轴缩短率(left ventricular fractional shortening,LVFS);(2)心肌梗死面积通过Evans蓝/TTC双染色评估,计算梗死区(infarct area,INF)/危险区(area at risk,AAR)及AAR/左心室(left ventricle,LV)比值;(3)细胞活力通过CCK-8法检测;(4)心肌损伤标志物心肌肌钙蛋白I(cardiac troponin I,cTnI)和肌酸激酶同工酶MB(creatine kinase MB,CK-MB)及炎症因子IL-1β、IL-18通过ELISA检测;(5)RT-qPCR检测mRNA表达,GAPDH作为内参;(6)Western blot检测自噬相关蛋白(LC3、p62、PINK1、Parkin)、线粒体分裂蛋白(DRP1、FIS1、MFF)、融合蛋白(OPA1、MFN1、MFN2)、JAK2/STAT3通路蛋白(JAK2、p-JAK2、STAT3、p-STAT3)和焦亡标志物(cleaved-caspase 1、N-GSDMD、IL-1β、IL-18)等蛋白表达;(7)透射电子显微镜(TEM)和扫描电子显微镜(SEM)观察线粒体超微结构和细胞膜形态;(8)免疫荧光共定位实验检测自噬体(GFP-LC3B)与线粒体(MitoTracker Red)及溶酶体(LysoTracker)与线粒体的共定位;(9)m6A定量通过m6A RNA甲基化检测试剂盒完成,m6A免疫沉淀(MeRIP)用于检测EGR1 mRNA的m6A修饰水平;(10)RNA稳定性实验使用链霉溶菌素(streptolydigin,5 μg/mL)抑制转录后检测EGR1 mRNA的降解速率;(11)RNA免疫沉淀(RIP)实验检测IGF2BP2与EGR1 mRNA的直接结合;(12)双荧光素酶报告基因实验验证IGF2BP2与EGR1 mRNA m6A位点(1184位点,A到U突变)的结合依赖性。
四、主要研究结果
1. EGR1沉默改善心肌I/R损伤模型中的线粒体自噬功能障碍和线粒体动力学失衡
H/R处理后,心肌细胞活力显著下降,cTnI和CK-MB水平升高,EGR1 mRNA和蛋白表达显著上调。TEM显示H/R组心肌细胞线粒体显著肿胀、空泡化和嵴断裂。免疫荧光共定位显示H/R处理后自噬体与线粒体及溶酶体与线粒体的共定位斑点减少。Western blot显示H/R处理显著降低PINK1、Parkin和LC3II/LC3I水平,同时升高p62表达,表明H/R导致线粒体自噬功能障碍。转染shEGR1敲低EGR1后,线粒体形态损伤得到恢复,共定位斑点数量增加,PINK1、Parkin和LC3II/LC3I表达上调而p62下调。3-MA处理逆转了EGR1敲低对线粒体自噬的促进作用及其对心肌细胞损伤的保护效果。此外,EGR1敲低恢复了H/R诱导的线粒体呼吸复合物(UQCRC2、SDHB、MTCO2)表达下调,改善了ATP产生和线粒体膜电位(mitochondrial membrane potential,MMP),降低了总ROS和线粒体ROS水平,并恢复了抗氧化酶(GPX、GSH、SOD)水平。Western blot显示H/R促进线粒体分裂蛋白(DRP1、FIS1、MFF)表达上调,抑制融合蛋白(OPA1、MFN1、MFN2)表达,而EGR1敲低逆转了这一效应。免疫荧光染色(TOM20)证实EGR1沉默恢复了线粒体平均长度,改善了线粒体碎片化。
2. EGR1沉默通过诱导JAK2/STAT3通路促进线粒体自噬并减轻心肌细胞损伤
Western blot显示H/R处理抑制了JAK2和STAT3的磷酸化。EGR1敲低消除了H/R对JAK2/STAT3通路激活的抑制作用,而使用AG490处理逆转了shEGR1对JAK2/STAT3通路的激活效应。AG490取消了shEGR1对线粒体形态的改善作用,阻断了自噬体与线粒体及溶酶体与线粒体共定位的增加,并恢复了线粒体自噬相关蛋白的表达变化。AG490还逆转了shEGR1对ATP产生、MMP、线粒体呼吸复合物表达、ROS水平和抗氧化酶水平的改善作用,并逆转了线粒体分裂/融合蛋白的变化。细胞活力和损伤标志物检测表明AG490逆转了EGR1沉默的保护效应。
3. EGR1抑制线粒体自噬促进心肌细胞焦亡
SEM结果显示H/R组心肌细胞表面出现肿胀、大量气泡状突起和膜孔形成等典型焦亡形态学特征,shEGR1改善了这些形态学变化,而AG490逆转了这种改善。TUNEL染色显示EGR1敲低降低了H/R诱导的TUNEL阳性细胞百分比,AG490消除了这一效应。LDH释放结果与此趋势一致。Western blot显示EGR1敲低恢复了H/R诱导的cleaved caspase-1、N-GSDMD/GSDMD、IL-1β和IL-18的表达上调,AG490处理阻断了这一抑制效应。ELISA检测细胞上清中IL-1β和IL-18浓度结果与之相符。3-MA处理也消除了shEGR1对焦亡的改善作用。这些结果表明EGR1通过JAK2/STAT3通路抑制线粒体自噬,从而促进心肌细胞焦亡。
4. METTL3介导的m6A修饰调控心肌细胞损伤中EGR1的表达
H/R处理后,METTL3 mRNA和蛋白表达显著上调,总m6A水平升高,EGR1 mRNA的m6A修饰水平增加。通过SRAMP网站预测EGR1 mRNA存在4个高置信度的m6A修饰位点。转染shMETTL3敲低METTL3后,H/R诱导的EGR1 mRNA和蛋白表达上调被抑制,MeRIP分析证实shMETTL3显著抑制了EGR1 mRNA的m6A修饰水平。这些结果确认EGR1是METTL3介导的m6A修饰的靶标mRNA。
5. METTL3和IGF2BP2通过m6A修饰调控EGR1 mRNA的稳定性
RNA稳定性实验显示,敲低METTL3显著加速了EGR1 mRNA的降解,表明m6A修饰增强了EGR1 mRNA的稳定性。转染shIGF2BP2敲低IGF2BP2后,H/R损伤心肌细胞中EGR1的mRNA和蛋白表达均下调,RNA稳定性分析显示EGR1 mRNA降解加速。RIP实验证实IGF2BP2与EGR1 mRNA存在直接结合,且METTL3沉默逆转了H/R处理对IGF2BP2与EGR1 mRNA结合的促进作用。双荧光素酶报告基因实验显示,当IGF2BP2被沉默时,野生型EGR1(EGR1#WT)的荧光素酶活性显著下降,而突变型EGR1(EGR1#MUT,m6A位点A到U突变)的荧光素酶活性无统计学显著差异。这证实IGF2BP2以m6A修饰依赖性方式直接结合EGR1 mRNA,增强其稳定性并上调其表达。
6. METTL3通过EGR1/JAK2/STAT3通路促进心肌细胞焦亡和损伤
TEM显示shMETTL3保护了心肌细胞线粒体免受H/R诱导的损伤,但EGR1-OE抵消了这一保护作用。免疫荧光共定位显示shMETTL3增加了自噬体与线粒体及溶酶体与线粒体的共定位斑点,EGR1-OE处理阻断了shMETTL3的促线粒体自噬效应。Western blot显示shMETTL3上调了PINK1、Parkin和LC3II/LC3I表达并下调p62,EGR1-OE恢复了这些蛋白的变化水平。体内实验中,I/R+shMETTL3+NC-OE组小鼠心脏功能(LVEF和LVFS)较I/R+shNC+NC-OE组显著改善,心肌梗死面积减小,心肌组织病理损伤减轻。重要的是,共转染EGR1-OE逆转了shMETTL3对心脏的保护效应。此外,shMETTL3抑制了I/R诱导的心肌细胞焦亡标志物表达,而EGR1-OE恢复了焦亡水平。shIGF2BP2与EGR1-OE的共转染实验得出了相似的结论。
五、结论与研究价值
本研究首次系统阐明了METTL3/m6A/IGF2BP2/EGR1/JAK2/STAT3/线粒体自噬/焦亡这一完整的分子调控轴在心肌I/R损伤中的致病机制。具体而言,在心肌I/R损伤中,METTL3介导EGR1 mRNA的m6A修饰,IGF2BP2以m6A依赖方式结合EGR1 mRNA并增强其稳定性,导致EGR1表达上调。升高的EGR1抑制JAK2/STAT3通路激活,进而抑制线粒体自噬,导致线粒体动力学失衡和线粒体功能障碍,最终促进心肌细胞焦亡和心肌I/R损伤加重。本研究丰富了心肌I/R损伤的病理生理学机制认识,为临床防治心肌I/R损伤提供了新的潜在治疗靶点,具有重要的科学价值和应用前景。
六、研究亮点
本研究的亮点在于:(1)首次完整揭示了METTL3介导的m6A修饰通过IGF2BP2识别机制上调EGR1表达,进而通过JAK2/STAT3通路调控线粒体自噬和焦亡的级联分子通路;(2)综合运用了体外H/R模型和体内心肌I/R模型,从细胞、分子和整体动物水平多层次验证了该通路的功能;(3)采用了多种前沿技术手段,包括MeRIP、RIP、RNA稳定性实验和双荧光素酶报告基因实验,系统验证了m6A修饰调控EGR1表达的分子机制;(4)将表观转录组学修饰(m6A)与线粒体自噬、细胞焦亡和心肌I/R损伤联系起来,建立了新的机制框架,为表观遗传调控在心血管疾病中的研究提供了新范式。