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肠道微生物组特征与精神分裂症的关联研究

期刊:Nature CommunicationsDOI:10.1038/s41467-020-15457-9

这篇文档属于类型a,即报告了一项原始研究的科学论文。以下是对该研究的学术报告:


主要作者及研究机构
本研究由Feng Zhu、Yanmei Ju、Wei Wang、Qi Wang、Ruijin Guo等来自西安交通大学第一附属医院、华大基因(BGI-Shenzhen)、中国国家基因库(China National Genebank)等机构的研究人员共同完成。研究于2020年发表在《Nature Communications》期刊上。

学术背景
本研究聚焦于精神分裂症(Schizophrenia)与肠道微生物群(gut microbiota)之间的关系。精神分裂症是一种严重的精神疾病,表现为幻觉、妄想和思维障碍,但其病因尚未完全阐明。近年来,越来越多的证据表明,肠-脑轴(gut-brain axis)在精神疾病中扮演重要角色,肠道微生物群可能通过影响神经递质代谢、炎症反应等机制参与精神分裂症的发生和发展。然而,针对未接受药物治疗的精神分裂症患者的肠道微生物组的全面分析仍然不足。因此,本研究旨在通过宏基因组关联分析(metagenome-wide association study, MWAS)探索精神分裂症患者的肠道微生物特征,并验证其功能潜力。

研究流程
研究分为以下几个主要步骤:
1. 样本收集与处理
研究纳入了90名未接受药物治疗的精神分裂症患者和81名健康对照者的粪便样本,并通过宏基因组测序(shotgun metagenomic sequencing)进行分析。平均每个样本获得了11.46 GB的测序数据,并将高质量读数映射到包含1140万个基因的参考基因目录中。

  1. 微生物多样性分析
    研究通过α多样性(Shannon指数)和β多样性(Bray-Curtis差异度)分析,发现精神分裂症患者在属水平和基因水平上的微生物多样性显著高于健康对照者。此外,研究还鉴定了83个在患者和对照者之间存在显著差异的宏基因组操作分类单元(metagenomic operational taxonomic units, MOTUs)。

  2. 功能模块分析
    研究利用京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)数据库和肠道-脑模块(gut-brain modules, GBMs)分析方法,鉴定了与精神分裂症相关的功能模块和代谢通路。结果显示,患者肠道微生物在短链脂肪酸合成、色氨酸代谢和神经递质合成/降解等方面存在显著差异。

  3. 微生物分类器构建与验证
    研究基于26个MOTUs构建了随机森林分类器(random forest classifier),并在发现队列和验证队列中分别达到了0.896和0.765的AUC值。这些MOTUs中包括11种在精神分裂症患者中显著富集的细菌,如Akkermansia muciniphila和Streptococcus vestibularis。

  4. 动物实验
    研究选择了一种在精神分裂症患者中富集的细菌——Streptococcus vestibularis,通过抗生素诱导的微生物耗竭小鼠模型进行移植实验。结果显示,移植S. vestibularis的小鼠表现出类似精神分裂症的行为异常,如社交行为缺陷和神经递质水平改变。

主要结果
1. 微生物多样性
精神分裂症患者的肠道微生物多样性显著高于健康对照者,尤其是在属水平和基因水平上。此外,患者肠道中富集了许多口腔来源的细菌,如Veillonella atypica和Streptococcus salivarius。

  1. 功能模块差异
    研究鉴定了579个KEGG模块和323个KEGG通路在患者和对照者之间存在显著差异。例如,患者肠道微生物在短链脂肪酸合成和色氨酸代谢相关模块中表现出显著富集。

  2. 微生物分类器
    基于26个MOTUs的分类器在发现队列和验证队列中均表现出较高的诊断准确性,表明这些微生物特征在精神分裂症中具有潜在的诊断价值。

  3. 动物实验结果
    移植S. vestibularis的小鼠表现出多动行为和社交行为缺陷,同时外周组织中的神经递质水平也发生了显著改变。这些结果支持了S. vestibularis在精神分裂症中的潜在作用。

结论
本研究通过宏基因组关联分析揭示了精神分裂症患者的肠道微生物特征,并验证了其功能潜力。研究发现,精神分裂症患者的肠道微生物多样性增加,且富集了多种口腔来源的细菌。此外,研究还鉴定了与精神分裂症相关的功能模块和代谢通路,并构建了基于微生物特征的分类器。动物实验进一步证实了S. vestibularis在精神分裂症中的潜在作用。这些结果为精神分裂症的病因研究提供了新的线索,并为未来的靶向干预提供了潜在方向。

研究亮点
1. 重要发现
研究首次系统地揭示了精神分裂症患者的肠道微生物特征,并鉴定了与其相关的功能模块和代谢通路。

  1. 方法创新
    研究利用宏基因组测序和肠道-脑模块分析方法,全面解析了肠道微生物在精神分裂症中的功能潜力。

  2. 应用价值
    基于微生物特征的分类器为精神分裂症的诊断提供了新的工具,而动物实验则为微生物在精神分裂症中的功能研究提供了实验依据。

其他有价值的内容
研究还发现,精神分裂症患者的肠道微生物与代谢疾病之间存在一定的重叠,这为精神分裂症与代谢疾病之间的共病机制提供了新的视角。


以上是对该研究的全面报告,涵盖了研究背景、流程、结果、结论及亮点,为读者提供了深入的理解。

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