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石墨烯氧化物通过内质网应激改变3D人脑类器官脂质稳态的转录组学和脂质组学研究

期刊:science of the total environmentDOI:10.1016/j.scitotenv.2022.157815

这篇文档属于类型a,即报告了一项原创性研究。以下是针对该研究的学术报告:


氧化石墨烯通过内质网应激破坏3D人脑类器官脂质稳态的机制研究

第一作者及机构
本研究由Xudong Liu(茅台学院食品科学与工程系)、Chao Yang(浙江海洋大学国家海洋养殖工程技术研究中心)等共同完成,通讯作者为Lei Zhang(加拿大滑铁卢大学化学工程与纳米技术研究所)和Yi Cao(南华大学公共卫生学院)。研究成果发表于《Science of the Total Environment》期刊2022年第849卷。

研究背景与目标
氧化石墨烯(Graphene Oxide, GO)因其在环境治理、电子器件和生物医学等领域的广泛应用,其潜在的神经毒性备受关注。已有研究表明,GO可穿过血脑屏障(Blood-Brain Barrier, BBB)进入中枢神经系统(Central Nervous System, CNS),并在动物模型中干扰脂质稳态。然而,传统2D细胞模型和动物模型无法完全模拟人脑的复杂性。因此,本研究利用3D人脑类器官(3D human brain organoids)模型,结合转录组学(transcriptomics)和脂质组学(lipidomics),探究GO通过内质网(Endoplasmic Reticulum, ER)应激影响脂质代谢的分子机制。

研究流程与方法
1. GO表征
- 通过原子力显微镜(AFM)、透射电镜(TEM)和动态光散射(DLS)分析GO的形貌、厚度(约5 nm)、水动力尺寸(585.13 nm)和表面电位(-44.36 mV)。X射线衍射(XRD)和傅里叶变换红外光谱(FTIR)验证了GO的化学结构。

  1. 3D人脑类器官培养与暴露实验

    • 使用人诱导多能干细胞(iPSCs)分化为神经前体细胞(NPCs),经90天培养形成直径约1.5 mm的类器官,表达皮质层标志物(如TBR1、Brn2)。
    • 类器官暴露于0、12.5或50 μg/mL GO 24小时,通过吖啶橙/ DAPI染色评估细胞毒性,发现50 μg/mL GO使细胞存活率降至83.4%。
  2. 转录组学分析

    • RNA测序(RNA-seq)显示,50 μg/mL GO显著上调80个基因(如TXNDC5,表达量增加18.5倍)、下调121个基因(如LMO2,表达量降低79%)。
    • 基因本体(GO term)分析表明,GO干扰了脂质代谢相关通路(如胆固醇转运调控、脂肪酸β氧化抑制),KEGG通路分析提示内质网蛋白加工通路(ko04141)可能被激活。
  3. 脂质组学检测

    • 超高效液相色谱-质谱(UPLC-Q-Exactive Orbitrap)分析显示,GO剂量依赖性增加神经酰胺(Ceramide, Cer)等6类脂质,而双甲基磷脂酸(Bis-Methyl Phosphatidic Acid, Bismepa)等6类脂质减少。内质网应激抑制剂4-PBA可逆转GO诱导的脂质变化。
  4. 内质网应激验证

    • 蛋白质印迹(Western blot)证实GO激活了GRP78-IRE1α-XBP-1轴:50 μg/mL GO使GRP78蛋白表达显著升高,IRE1α和XBP-1水平增加,而4-PBA可部分或完全抑制这些效应。

主要结果与逻辑关系
- 细胞毒性:GO通过诱导神经元死亡相关基因(如GO:0070997)降低类器官存活率,但未显著增加超氧化物(DHE染色阴性),提示非氧化应激机制。
- 脂质代谢紊乱:转录组学发现脂质代谢通路异常,脂质组学进一步验证了Cer等脂类的积累,且与ER应激标志物(GRP78、IRE1α)的激活一致。
- 机制验证:4-PBA抑制ER应激后,脂质谱恢复,证实GO通过ER应激途径破坏脂质稳态。

结论与价值
本研究首次在3D人脑类器官模型中揭示了GO通过ER应激(IRE1α/XBP-1轴)干扰脂质代谢的机制,为评估GO的神经毒性提供了更接近人类生理的模型。科学价值在于:
1. 证明了3D类器官在纳米毒理学研究中的优势;
2. 明确了ER应激是GO神经毒性的关键通路;
3. 为GO在生物医学应用中的安全性评估提供了数据支持。

研究亮点
1. 模型创新:采用人iPSC衍生的3D脑类器官,优于传统2D模型和动物实验。
2. 多组学整合:结合转录组学和脂质组学,系统性解析GO的分子机制。
3. 机制深度:发现ER应激是GO干扰脂质稳态的核心环节,并通过抑制剂反向验证。

其他发现
- GO未显著诱发自噬(LC3B、ATG5等标志物无变化),提示其毒性机制可能独立于自噬途径。
- 大尺寸GO(500-5000 nm)的毒性效应可能与既往报道的小尺寸GO不同,需进一步研究尺寸依赖性。


该研究为纳米材料的神经毒性评估提供了新范式,并强调了类器官模型在环境毒理学中的潜力。

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