分享自:

通过批量及单细胞RNA测序揭示IVDD和NAFLD共享诊断生物标志物的跨疾病研究

期刊:frontiers in molecular neuroscienceDOI:10.3389/fnmol.2025.1639705

这篇文档属于类型a,即报告了一项原创性研究。以下是针对该研究的学术报告:


作者及机构
本研究由Jiasen Wei(新乡市中心医院脊柱外科)、Chenglong Ji(海军军医大学长征医院骨科)、Lina Liu(中国人民解放军海军医学中心骨科)等共同完成,通讯作者为Wenbo Lin、Ximing Xu和Kaiqiang Sun。研究发表于Frontiers in Molecular Neuroscience期刊,2025年9月22日上线,DOI: 10.3389/fnmol.2025.1639705。


学术背景
研究领域:本研究横跨椎间盘退变(Intervertebral Disc Degeneration, IVDD)非酒精性脂肪肝病(Non-Alcoholic Fatty Liver Disease, NAFLD)两大慢性疾病领域。近年来,流行病学证据提示IVDD与NAFLD存在潜在关联,但两者的共同分子机制尚不明确。
研究动机:IVDD是腰痛的主要诱因,而NAFLD全球患病率达25-30%,二者均与肥胖、代谢综合征等密切相关。既往研究发现,NAFLD患者腰痛发生率升高,且高脂饮食(High-Fat Diet, HFD)可能通过炎症反应加剧IVDD进展。
研究目标:通过整合生物信息学分析与实验验证,鉴定IVDD与NAFLD的共享诊断标志物,并探索其分子机制及潜在治疗策略。


研究流程
1. 数据收集与预处理
- 从GEO数据库获取3个IVDD数据集(GSE153761、GSE56081、GSE70362)和2个NAFLD数据集(GSE63067、GSE89632),筛选标准包括疾病组与对照组的可比性及原始数据可用性。
- 使用R包“sva”校正批次效应,并通过“limma”包进行差异表达分析(Differentially Expressed Genes, DEGs),IVDD组鉴定出266个DEGs(155上调、111下调),NAFLD组鉴定出970个DEGs(448上调、522下调)。

  1. 关键基因模块鉴定

    • 采用加权基因共表达网络分析(Weighted Gene Co-expression Network Analysis, WGCNA)构建基因共表达网络。IVDD组中,MEblack模块与疾病表型负相关;NAFLD组中,MEblue与MEbrown模块分别呈现正/负相关。
    • 通过DEGs与WGCNA模块基因的交集分析,筛选出6个共享基因(ME1、HAS2、ADRB2、RASD1、PLCD1、FICD)。
  2. 机器学习与生物标志物筛选

    • 结合LASSO回归和随机森林(Random Forest, RF)算法,进一步筛选出3个核心诊断标志物:ME1(苹果酸酶1)、HAS2(透明质酸合成酶2)、ADRB2(β2肾上腺素受体)。
    • ROC曲线验证显示,ME1在IVDD和NAFLD中的AUC(Area Under Curve)分别为0.7448和0.9194,具有高诊断效能。
  3. 单细胞RNA测序分析

    • 从GSE244889(IVDD)和GSE202379(NAFLD)单细胞数据中,鉴定出20种IVD细胞簇(如髓核细胞、巨噬细胞)和9种肝脏细胞簇(如肝细胞、星状细胞)。
    • ME1在IVDD巨噬细胞和NAFLD肝细胞中表达显著上调,功能富集分析揭示其参与PI3K-AKT、mTOR等代谢与炎症通路。
  4. 动物实验验证

    • NAFLD模型:C57BL/6J小鼠高脂饮食(HFD)喂养10周,诱导肝脂肪变性和炎症(Oil Red O染色证实)。
    • IVDD模型:NAFLD小鼠接受尾椎针刺手术诱导椎间盘退变,HFD组较正常饮食组(NFD)表现出更严重的髓核组织破坏(Safranin O-Fast Green染色评分升高)。
    • 运动干预:游泳训练(30分钟/天)显著改善NAFLD小鼠的肝脂肪沉积,并减轻IVDD病理进展,伴随ME1表达下调及ADRB2表达上调。

主要结果
1. 共享生物标志物的鉴定:ME1、HAS2和ADRB2在IVDD与NAFLD中呈现一致的表达趋势(ME1上调,HAS2/ADRB2下调),且与免疫浸润(如巨噬细胞、NK细胞)显著相关。
2. 分子机制
- ME1通过调控NADPH代谢和炎症反应(如IL-17信号通路)参与疾病进展。
- ADRB2缺失促进交感神经信号紊乱,加剧炎症和ECM降解(如MMP3表达升高)。
3. 治疗潜力:游泳运动通过抑制ME1和激活ADRB2,同时改善NAFLD和IVDD。


结论与意义
1. 科学价值:首次揭示IVDD与NAFLD的共享分子标志物,为代谢性骨病与肝病的共病机制提供新见解。
2. 临床应用:ME1、HAS2和ADRB2可作为跨疾病诊断靶点,运动干预(如游泳)被证明是一种可行的联合治疗策略。
3. 创新性
- 整合多组学数据(bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq)与机器学习算法(LASSO/RF)。
- 建立首个NAFLD-IVDD共病小鼠模型,验证运动干预的跨器官保护作用。


研究亮点
1. 跨学科视角:将代谢性疾病(NAFLD)与退行性骨病(IVDD)的分子关联系统化。
2. 方法学创新:开发基于nomogram的疾病预测模型(AUC>0.9),并利用单细胞测序解析细胞特异性基因功能。
3. 转化医学:提出“运动-ADRB2”轴作为潜在治疗靶点,为临床管理提供实验依据。


其他价值
研究局限性包括样本量较小(仅5个GEO数据集),且未在蛋白水平验证标志物功能。未来需扩大临床队列并探索ME1抑制剂的应用潜力。

上述解读依据用户上传的学术文献,如有不准确或可能侵权之处请联系本站站长:admin@fmread.com