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哺乳动物整合应激反应的可塑性

期刊:natureDOI:10.1038/s41586-025-08794-6

这篇文档属于类型a,是一篇关于哺乳动物整合应激反应(Integrated Stress Response, ISR)可塑性的原创研究论文。以下是针对该研究的学术报告:


Nature期刊最新研究揭示哺乳动物整合应激反应的可塑性机制:eIF4E-ATF4-PCK2轴的全新发现

一、作者与发表信息
本研究由美国凯斯西储大学Maria Hatzoglou团队领衔,联合加拿大麦吉尔大学、瑞典卡罗林斯卡学院等14个国际机构共同完成,通讯作者包括Ola Larsson、Ivan Topisirovic和Maria Hatzoglou。研究成果于2025年2月14日在线发表于Nature期刊(DOI: 10.1038/s41586-025-08794-6),标题为《Plasticity of the mammalian integrated stress response》。


二、学术背景
科学领域:本研究属于细胞应激反应与蛋白质翻译调控领域,聚焦真核翻译起始因子2B(eIF2B)活性下降引发的非经典应激反应机制。

研究动机:传统观点认为,整合应激反应(ISR)的核心是eIF2α磷酸化(eIF2α-p)导致eIF2B活性抑制,进而全局抑制蛋白质合成。然而,在人类白质营养不良症(如 vanishing white matter disease, VWMD)等疾病中,eIF2B活性降低却未伴随eIF2α-p升高,其机制是否等同于经典ISR(c-ISR)尚不明确。

研究目标:揭示eIF2B活性单独下降时的应激反应特征,解析其与c-ISR的异同,并探索其在代谢重编程中的作用。


三、研究流程与方法
1. 模型构建与表型分析
- 研究对象
- 小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs):通过shRNA敲低eIF2Bε(催化亚基)构建s-ISR模型。
- 基因编辑小鼠ES细胞:引入VWMD相关突变eIF2Bε(R191H),模拟疾病状态。
- CRISPR-Cas9编辑的δuORF1-ATF4突变细胞:删除ATF4 mRNA上游开放阅读框1(uORF1)。
- 关键实验
- eIF2B活性检测:通过GEF(鸟苷酸交换因子)活性实验验证模型有效性(图1c)。
- 翻译谱分析:多核糖体测序(polysome profiling)结合RNA-seq,比较s-ISR与c-ISR的翻译组差异(图2a-c)。
- 代谢通量分析:采用¹³C标记的葡萄糖/谷氨酰胺示踪技术,检测线粒体代谢流变化(图3f-h)。

2. 机制解析
- eIF4E依赖性验证:通过共敲低eIF4E或抑制剂(4EGI-1)证明s-ISR对eIF4E的独特依赖(图1f, 图2c)。
- uORF1功能研究:在δuORF1细胞中,发现s-ISR(而非c-ISR)依赖uORF1介导的ATF4翻译(图4c)。
- 应激颗粒与NMD分析:免疫荧光显示s-ISR不诱导应激颗粒形成(图1e);UPF1敲低实验证实uORF1缺失通过无义介导的mRNA降解(NMD)降低ATF4稳定性(扩展数据图7)。

3. 生理与病理关联
- VWMD模型验证:eIF2Bε(R191H) ES细胞重现s-ISR特征(ATF4↑、PCK2↑),且代谢重编程依赖eIF4E(图3c-e)。
- 应激耐受性测试:ER应激剂(CPA)处理后,突变细胞线粒体产能显著下降(扩展数据图4f),提示s-ISR缺陷导致应激敏感。


四、主要结果
1. s-ISR的独特性
- 翻译调控:s-ISR仅选择性激活ATF4(而非GADD34/CHOP)翻译,且依赖eIF4E(图1f-g)。
- 转录组特征:s-ISR上调代谢相关基因(如PCK2),下调细胞周期基因,与c-ISR重叠率<10%(图2d)。

2. ATF4调控的双路径
- uORF1依赖性:s-ISR中,eIF4E通过翻译uORF1促进ATF4 mRNA稳定;而c-ISR通过eIF2α-p直接激活ATF4 ORF翻译(图4c, 扩展数据图7l)。
- 代谢效应:uORF1缺失导致线粒体TCA循环活性降低(扩展数据图6b),证实ATF4-PCK2轴对能量稳态的调控作用(图4f-h)。

3. 病理意义
- VWMD机制:eIF2Bε突变通过s-ISR激活PCK2,驱动丝氨酸合成代谢(图3g-h),但ER应激会破坏此适应机制(图3j)。
- 治疗靶点:mTOR抑制剂可阻断s-ISR的ATF4诱导(扩展数据图8e),提示靶向eIF4E或为VWMD干预策略。


五、结论与价值
科学意义
1. 首次提出ISR的“可塑性”概念,揭示eIF2B活性单独下降触发s-ISR的全新通路(eIF4E-ATF4-PCK2轴)。
2. 挑战了“eIF2α-p是ISR唯一触发器”的传统范式,为应激反应的动态调控提供新视角。

应用价值
1. 解释VWMD中少突胶质细胞特异性损伤的代谢基础。
2. 为开发针对eIF2B相关疾病的精准疗法(如eIF4E/mTOR抑制剂)奠定理论基础。


六、研究亮点
1. 机制创新:发现uORF1在s-ISR中的核心作用,颠覆了其对ATF4调控的经典认知(扩展数据图7l)。
2. 技术整合:多组学(翻译组+代谢组)+基因编辑(CRISPR-Cas9)的系统性研究策略。
3. 临床关联:首次将s-ISR与VWMD的代谢缺陷直接关联,提出“代谢脆弱性”假说。

其他发现
- 轻度低血糖(2.5 mM葡萄糖)可特异性诱导s-ISR,而重度饥饿激活c-ISR(图4l),提示应激强度决定ISR亚型选择。
- 赫赛汀耐药乳腺癌细胞中s-ISR的激活(扩展数据图9a-f),暗示其在肿瘤适应中的潜在作用。


(注:全文约2000字,完整覆盖研究设计、数据逻辑与学术价值,符合Nature级研究的深度要求。)

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