该文档属于类型a（单篇原创研究论文），以下是学术报告内容：
一、研究团队与发表信息
本研究由Dayan Sun（北京儿童医院/首都医科大学）、Dingding Wang（复旦大学生命科学学院）等30余位作者合作完成，通讯作者为Jiucun Wang（复旦大学）、Li Zhang（上海交通大学医学院）、Shen Yang（北京儿童医院）和Jinshi Huang（北京儿童医院）。研究成果发表于Journal of Hepatology（2025年8月25日接受，DOI: 10.1016/j.jhep.2025.08.036）。
二、学术背景
科学领域：本研究聚焦于胆道闭锁（Biliary Atresia, BA）的免疫代谢机制，结合多组学分析、单细胞测序和动物模型验证，揭示了鞘脂代谢通路（Sphingolipid Metabolism）通过S1P/S1PR4信号轴驱动CD8⁺组织驻留记忆T细胞（Tissue-Resident Memory T cells, TRM）分化的新机制。
研究背景与目的：
- BA是新生儿严重胆管病变，以进行性炎症和纤维化为特征，肝门肠吻合术（HPE）后仍需肝移植的病例高达60-75%。既往研究发现BA患者肝脏中CX3CR1⁺CD8⁺效应T细胞（Teff）和CD103⁺CD8⁺ TRM细胞显著扩增，但其分化机制及与胆管损伤的关系不明。
- 鞘脂代谢物S1P（Sphingosine-1-phosphate）是免疫细胞迁移和分化的关键调节因子，但其在BA中的作用未被阐明。本研究旨在通过多组学整合鉴定BA分子亚型，揭示S1P/S1PR4轴如何促进TRM分化并加剧胆管损伤。
三、研究流程与方法
1. 多组学整合分析
- 样本：34例BA肝组织 vs. 22例对照（肝母细胞瘤旁组织）。
- 技术：转录组、蛋白质组、代谢组高通量检测，通过PCA和差异表达分析筛选差异基因（DEGs）、蛋白（DEPs）和代谢物（DEMs）。
- 关键发现：鞘脂代谢通路（如SPHK1、S1PR4、S1P）在BA中显著激活，且S1P浓度升高3倍。
2. 分子亚型鉴定
- 聚类分析：基于转录组和蛋白质组数据将BA分为S1（免疫高激活型）和S2（代谢稳态型）。S1患者预后更差，伴随ALT、AST等指标升高，且富集炎症通路。
- 验证：利用GSE122340数据集（n=171）验证亚型特异性基因的预后预测价值。
3. 单细胞RNA测序（scRNA-seq）
- 数据来源：重新分析已发表的BA血液和肝脏scRNA-seq数据。
- 关键结果：S1PR4主要在CX3CR1⁺CD8⁺ Teff细胞中高表达；伪时序分析显示Teff细胞分化为TRM细胞伴随S1PR4下调。
4. 功能实验
- 体外模型：
- 细胞来源：健康志愿者外周血CX3CR1⁺CD8⁺ Teff细胞。
- 干预：IL-2/IL-15/TGF-β诱导TRM分化，加入S1P或S1PR4抑制剂（CYM50358）。
- 结果：S1P促进TRM分化（CD69/CD103上调），而抑制剂阻断此效应；TRM细胞通过分泌IFNγ和颗粒酶B（GZMB）诱导胆管细胞凋亡（凋亡率30% vs. 对照组10%）。
5. 动物模型验证
- 模型构建：新生Balb/c小鼠腹腔注射恒河猴轮状病毒（RRV）诱导BA表型，并用CYM50358干预。
- 评估指标：生存率、胆管阻塞程度、肝脏炎症/纤维化（H&E和天狼星红染色）、血清生化指标（ALT/AST/胆红素）。
- 结果：CYM50358将存活率从40%提升至75%，显著减轻胆管阻塞和纤维化，减少肝脏CD8⁺ TRM细胞浸润。
四、主要结果与逻辑关系
1. 多组学整合：发现BA中鞘脂代谢通路异常激活，尤其是S1亚型（S1P/S1PR4上调），为后续机制研究提供靶点。
2. scRNA-seq分析：定位S1PR4表达于Teff细胞，并通过伪时序分析揭示其与TRM分化的动态关联。
3. 功能实验：体外验证S1P/S1PR4直接驱动TRM分化及胆管细胞凋亡，明确因果链。
4. 动物模型：S1PR4抑制显著改善BA表型，证实该通路的治疗潜力。
五、结论与价值
1. 科学价值：
- 首次阐明S1P/S1PR4通过促进CD8⁺ TRM分化加剧BA胆管损伤的机制。
- 提出BA分子分型（S1/S2），为精准治疗提供依据：S1患者或可从S1PR4抑制剂中获益。
2. 应用价值：
- CYM50358在动物模型中表现显著疗效，支持其临床转化潜力。
- 为其他免疫介导的胆管疾病（如硬化性胆管炎）提供新治疗思路。
六、研究亮点
1. 创新性方法：多组学整合（转录组/蛋白组/代谢组）结合scRNA-seq动态轨迹分析，系统性解析BA异质性。
2. 机制深度：从代谢重编程（S1P）到免疫细胞分化（TRM）再到组织损伤（胆管凋亡），建立完整病理链条。
3. 临床相关性：S1/S2亚型分类和S1PR4靶点的提出直接指导个体化治疗。
七、其他有价值内容
- 局限性：临床样本量较小（n=34），需扩大队列验证；RRV模型与人类BA存在物种差异。
- 数据共享：RNA-seq数据已上传至NCBI GEO（GSE300457），促进后续研究。
本研究为BA的免疫代谢治疗奠定了理论基础，并为靶向鞘脂通路的药物开发提供了实验依据。