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整合应激反应的终止机制

期刊:scienceDOI:10.1126/science.adw5137

Claudia de Miguel等作者来自英国剑桥MRC分子生物学实验室,其研究成果于2025年11月13日首次发表在《Science》期刊上,论文编号10.1126/science.adw5137。这项研究聚焦于真核生物翻译起始因子2(eIF2)的磷酸化调控机制,特别是揭示了整合应激反应(Integrated Stress Response, ISR)终止的关键分子机制。

学术背景

eIF2α的丝氨酸52位点(S52)磷酸化是细胞应对环境变化的核心调控机制,通过抑制其鸟苷酸交换因子(Guanine nucleotide exchange factor, GEF)eIF2B来衰减蛋白质合成。尽管这一通路已被研究数十年,但磷酸化eIF2(p-eIF2)信号如何终止仍不清楚。eIF2B作为十聚体复合物(α、β、γ、δ、ε亚基),其活性受p-eIF2结合抑制。此前研究认为游离p-eIF2是磷酸酶靶标,但该团队发现p-eIF2-eIF2B复合物才是生理性底物,而PPP1R15B(R15B)磷酸酶亚基在此过程中发挥关键作用。

研究流程与方法

  1. 复合物捕获与结构解析

    • 样本制备:在HEK293T和Expi293细胞中表达Flag标记的R15B截短体(R15B414-713和R15B411-511),通过免疫沉淀纯化天然复合物。质谱鉴定显示R15B与eIF2(α、β、γ)、eIF2B全亚基及PP1磷酸酶共纯化。
    • 冷冻电镜分析:采用单颗粒冷冻电镜(cryo-EM)解析复合物结构。对R15B414-713样本的67%颗粒显示催化构象(eIF2-eIF2B),分辨率2.7 Å;33%颗粒为抑制构象(p-eIF2-eIF2B),局部分辨率3.8 Å。R15B411-511样本则富集抑制构象,整体分辨率3.0 Å。
    • 结构特征:发现eIF2Bγ的GTP结合口袋(含致病突变热点)及R15B通过螺旋H1-H2和对接环(docking loop)桥接eIF2γ与eIF2Bγ,迫使eIF2α C端固定,维持GDP结合状态。
  2. 功能验证实验

    • 突变体分析:构建R15B关键区域突变体(如H2A、Q490E),发现其与eIF2-eIF2B结合能力显著降低。冷冻电镜二维分类显示H2A突变体仅42%保留抑制构象(野生型100%)。
    • 磷酸酶活性检测:利用碱性磷酸酶处理复合物,发现R15B414-713(含PP1结合位点)能使p-eIF2去磷酸化,而R15B411-511(底物捕获型)无此功能。去磷酸化后复合物构象从抑制态转为催化态。
  3. 疾病关联分析

    • ** vanishing white matter病突变映射**:eIF2Bγ的GTP结合口袋中25%致病突变(如K25R、D107N)直接干扰GTP结合,揭示该病可能与eIF2Bγ核苷酸结合缺陷相关。

主要结果

  1. 结构发现:首次解析了内源性R15B-p-eIF2-eIF2B复合物的冷冻电镜结构,揭示R15B通过构象重排使p-S52暴露于磷酸酶活性中心。
  2. 功能机制:R15B不仅招募PP1,还通过诱导eIF2α C端位移解除p-S52的分子内静电屏蔽,实现eIF2B从抑制中解救。
  3. 疾病关联:eIF2Bγ的GTP结合缺陷可能是 vanishing white matter病的分子基础。

结论与意义

该研究阐明了ISR终止的核心机制:R15B通过双重功能(底物招募与构象激活)实现p-eIF2在eIF2B上的去磷酸化,重启翻译并维持细胞稳态。科学价值在于:
1. 理论突破:挑战了“游离p-eIF2是磷酸酶唯一底物”的传统认知,提出“复合物解救”新模型。
2. 应用潜力:为神经退行性疾病及癌症(如ISR通路失调相关疾病)提供新靶点。
3. 方法创新:首次对含大量无序区的磷酸酶复合物进行高分辨率结构解析,为类似体系研究提供范式。

研究亮点

  1. 创新发现:揭示R15B在eIF2B抑制复合物上的去磷酸化活性,填补ISR终止机制的空白。
  2. 技术突破:通过冷冻电镜解析动态复合物的构象变化,克服了无序蛋白的结构解析难题。
  3. 跨学科价值:整合结构生物学、生物化学与疾病遗传学,为治疗干预提供分子基础。

此外,研究还暗示PPP1R15A(R15A)可能具有类似功能,为后续研究开辟了新方向。

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