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背侧下托神经元编码凹面和凸面几何形状

期刊:natureDOI:10.1038/s41586-024-07139-z

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研究团队与发表信息

本研究由Yanjun Sun(斯坦福大学医学院神经生物学系;加州大学欧文分校解剖与神经生物学系)、Douglas A. Nitz(加州大学圣地亚哥分校认知科学系)、Xiangmin Xu(加州大学欧文分校解剖与神经生物学系;神经环路图谱中心)和Lisa M. Giocomo(斯坦福大学医学院神经生物学系)合作完成,发表于Nature期刊(2024年3月28日,卷627,页821-829)。研究通过开放获取(Open Access)发布,DOI: 10.1038/s41586-024-07139-z


学术背景

科学领域:本研究属于空间认知神经科学领域,聚焦于大脑如何编码自然环境中几何特征(如边界、角落、曲率)的神经机制。
研究动机:动物在复杂地形中导航需要识别环境的几何属性(如凹角和凸角),但此前对这类特征的神经编码机制尚不明确。传统实验室环境多采用直线边界,而自然环境中普遍存在曲线和复杂几何结构。
关键问题:大脑是否通过特定神经元群体区分凹角(concave corners)和凸角(convex corners)?这些编码是否依赖环境的具体属性(如角度、高度)?
研究目标:揭示背侧下托(dorsal subiculum)神经元对几何特征的编码规律,并验证其是否参与构建环境的“认知地图”(cognitive map)。


研究流程与方法

1. 实验对象与成像技术

  • 研究对象:使用转基因小鼠(CamK2a-Cre; Ai163)和野生型小鼠(C57BL/6),通过单光子微型显微镜(1p miniscope)自由活动状态下记录背侧下托神经元的钙信号。
  • 样本量:9只小鼠用于主要实验(凹角/凸角编码),12只小鼠用于CA1对照实验。
  • 创新方法
    • 纵向钙成像:通过梯度折射率透镜(GRIN lens)植入下托区域,长期追踪单个神经元活动。
    • 信号处理:采用CNMF-E(约束非负矩阵分解)和OASIS算法去卷积钙信号,提取神经元的峰电位(spike)活动。

2. 行为实验设计

  • 环境类型:设计了多种几何形状的开放场(open field),包括圆形、三角形、正方形、六边形、梯形、凸角环境等,并操控以下变量:
    • 角度:不对称环境(如30-60-90°三角形)测试神经元对不同角度的响应。
    • 高度:对比高墙(30 cm)与矮墙(15 cm)环境中的神经元活动。
    • 连接性:通过插入可分离的离散角落,测试神经元对墙壁连接状态的敏感性。
  • 实验流程:每只小鼠每日进行1-2次20-30分钟的探索任务,记录神经元活动与行为轨迹。

3. 数据分析方法

  • 角落细胞(corner cells)定义
    • 角落评分(corner score):量化神经元活动与角落的距离关系(范围-1至+1),通过随机化峰电位时间生成零分布,筛选显著性(p<0.05)。
    • 稳定性验证:要求神经元跨会话(session)的空间相关性>0.3。
  • 解码分析:训练线性-非线性泊松模型(LN模型),区分神经元编码的参考系( allocentric vs. egocentric)。

主要结果

1. 下托神经元对凹角的编码

  • 特异性响应:7.2%的下托神经元在三角形/正方形角落表现出显著活动(图1f-h),而圆形环境中几乎无此类神经元(0.04%)。
  • 几何敏感性
    • 角度:神经元对锐角(30°)的响应强于钝角(125°)(图2d-f)。
    • 高度:矮墙环境中角落细胞比例下降53%,但残留活动仍高于非角落细胞(图2i-k)。
    • 连接性:离散角落的分离导致神经元活动衰减,但6 cm间隙时仍高于基线(图3d)。

2. 凸角的独立编码机制

  • 非重叠群体:1.4%的神经元专一编码凸角,与凹角细胞无解剖学重叠(图4f-g)。
  • 泛化能力:凸角细胞对圆柱体等高曲率物体同样响应(扩展数据图7h-l)。

3. 编码的参考系与功能分离

  • 以世界为中心(allocentric):多数角落细胞的活动独立于动物头部方向或运动速度(扩展数据图8e-h)。
  • 与边界细胞(BVCs)的区别:角落细胞与边界向量细胞(boundary vector cells)重叠率仅3.5%(扩展数据图10c)。

4. 曲率编码的泛化

  • 凹面与凸面:角落细胞在椭圆形环境的高曲率区域(图5e-f)或小直径圆柱体周围(图5g-h)活动增强,表明其编码超越离散角落的广义几何特征。

结论与意义

科学价值
1. 机制发现:首次证实背侧下托通过独立神经元群体编码凹角与凸角,为“认知地图”理论补充了几何特征解析的神经基础。
2. 自然行为关联:凹角(如巢穴入口)和凸角(如树枝分叉)在自然环境中具有生态学意义,本研究揭示了其神经表征的普适性。
3. 技术贡献:开发了基于钙成像的角落评分系统,为复杂几何编码研究提供新工具。

应用潜力
- 为类脑导航算法(如机器人路径规划)提供生物启发模型。
- 助力空间认知障碍(如阿尔茨海默病)的神经环路研究。


研究亮点

  1. 新颖发现:明确了凹角与凸角在单细胞水平的独立编码机制。
  2. 方法创新:结合纵向钙成像与几何操控,建立了环境曲率编码的分析框架。
  3. 跨环境验证:通过不对称形状、物体插入等设计,证实编码的鲁棒性。

其他有价值内容

  • 感官依赖性:视觉信息对角落编码的影响大于触觉(扩展数据图6j-k),提示多模态整合的层级性。
  • 进化意义:角落编码可能源于对自然复杂地形的适应性选择,如洞穴动物的导航需求。

(全文约2,200字)

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