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PPARγ依赖的脂肪祖细胞翻译机制重塑在肥胖中受损

期刊:Cell ReportsDOI:10.1016/j.celrep.2024.114945

研究背景与目的
这项研究由美国加州大学洛杉矶分校(UCLA)的Mirian Krystel de Siqueira、Gaoyan Li和Claudio J. Villanueva等人主导,联合加拿大蒙特利尔大学等机构完成,发表在2024年12月24日的《Cell Reports》期刊上。研究聚焦于脂肪组织在肥胖状态下的可塑性丧失机制,特别是PPARγ激动剂罗格列酮(rosiglitazone)对脂肪前体细胞翻译机器的重塑作用。肥胖时脂肪组织扩张能力下降,脂肪前体细胞(APCs)向成熟脂肪细胞分化的能力受损,而噻唑烷二酮类(TZDs)药物如罗格列酮虽然能改善胰岛素敏感性,但其对脂肪前体细胞在翻译层面的调控机制尚未阐明。研究团队假设罗格列酮通过调节核糖体基因表达和翻译选择性来促进脂肪组织重塑。

实验流程与方法
研究首先建立了急性药物治疗模型:野生型(WT)瘦小鼠和瘦素缺陷型(ob/ob)肥胖小鼠分别接受罗格列酮或溶剂对照灌胃处理3天。随后对小鼠进行葡萄糖耐量测试、[18F]-氟代脱氧葡萄糖正电子发射断层扫描(PET-CT)评估组织葡萄糖摄取、组织学染色观察脂肪与肝脏形态变化。
第二步,对附睾白色脂肪组织(eWAT)和腹股沟白色脂肪组织(iWAT)的基质血管组分(SVF)进行单细胞RNA测序(scRNA-seq),共获得eWAT 61343个细胞和iWAT 65556个细胞,经Louvain算法聚类鉴定出平滑肌细胞、中性粒细胞、B细胞、内皮细胞、脂肪前体细胞、自然杀伤T细胞、树突状细胞、多种巨噬细胞亚群等。脂肪前体细胞进一步亚聚类为祖细胞(progenitors)和前脂肪细胞(preadipocytes)。
第三步,通过流式细胞术分选Lin⁻CD31⁻CD45⁻PDGFRA⁺细胞群,以DPP4标记祖细胞、ICAM1和CD36标记前脂肪细胞,比较肥胖小鼠在罗格列酮处理后各亚群数量和分化能力的变化。分离的细胞在含地塞米松、胰岛素和IBMX的完全分化培养基(DMI)中培养4天,用LipidTOX染色观察脂滴形成。
第四步,进行差异表达基因分析和通路富集,特别关注核糖体相关基因。利用PPARγ染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)数据分析罗格列酮是否直接调控核糖体基因,并用ChIP-qPCR在3T3-L1和10T1/2细胞中验证结合位点。
第五步,通过表面感知翻译(SUnSET)实验检测体内蛋白合成水平,使用嘌呤霉素标记新生肽链。进一步对eWAT SVF原代细胞进行蔗糖梯度超速离心分离多聚核糖体(polysome),收集含3个以上核糖体的组分进行RNA测序(polysome-seq),比较罗格列酮组与对照组的翻译组差异和翻译效率。
第六步,对iWAT SVF进行蛋白质组学分析,验证翻译变化是否对应蛋白水平变化。使用eIF4A抑制剂CR-1-31-B处理10T1/2细胞和原代脂肪前体细胞,观察阻断翻译对脂肪分化的影响。
第七步,对翻译效率上调的转录本进行5′非翻译区(5′UTR)的k-mer基序富集分析,寻找可能形成G四链体(G-quadruplex)的富G序列。

主要结果与分析
罗格列酮急性处理3天显著改善ob/ob小鼠的葡萄糖耐量,而未改变总体重。PET-CT显示罗格列酮增加脑、心、肝、肌肉和脂肪组织的葡萄糖摄取。组织学上,ob/ob-罗格列酮小鼠肝脏脂滴数量和大小减少,eWAT中冠状结构减少,并出现多房性新生脂肪细胞。
scRNA-seq结果显示,肥胖导致eWAT和iWAT的细胞簇偏离瘦小鼠状态,而罗格列酮处理使ob/ob小鼠的细胞微环境向瘦小鼠状态转变。在巨噬细胞方面,罗格列酮减少炎症性巨噬细胞和脂质相关巨噬细胞(LAMs)的数量,尤其在eWAT中更为显著。
对脂肪前体细胞亚群的分析发现,罗格列酮处理降低了祖细胞(DPP4⁺)和前脂肪细胞(ICAM1⁺)的频率和绝对数量,但iWAT中ICAM1⁺/CD36⁺的更分化前脂肪细胞数量增加。体外分化实验表明,来自罗格列酮处理小鼠的eWAT DP4⁺和DPP4⁻细胞在DMI培养基中脂滴形成显著增加;iWAT细胞在仅含胰岛素的极简培养基中也表现出更强的分化能力。这说明罗格列酮在体内已经启动了脂肪前体细胞向脂肪细胞分化的程序。
差异表达基因分析显示,eWAT祖细胞和前脂肪细胞中,罗格列酮主要下调了肥胖中上调的炎症相关通路(如NF-κB通路),同时上调了肥胖中下调的PPAR信号和脂肪生成通路。值得注意的是,核糖体通路和肽链延伸通路在eWAT前脂肪细胞以及iWAT的祖细胞和前脂肪细胞中均被罗格列酮显著上调。iWAT的反应中,罗格列酮更多地上调了肥胖中下调的基因,且核糖体、真核起始因子(eIF)通路和mTOR信号在两组细胞中均富集。
蛋白质组学证实罗格列酮处理可增加iWAT SVF中多种小亚基和大亚基核糖体蛋白的表达。ChIP-seq再分析发现PPARγ在eWAT中有41个核糖体基因附近的结合位点,在iWAT中有24个,涉及rpl23a、rps3a1、rpl11、rpl19、rps14、rps27a等基因。ChIP-qPCR进一步确证了PPARγ与这些基因的PPAR反应元件结合。
SUnSET实验显示罗格列酮处理增加eWAT和iWAT的蛋白合成。多聚核糖体分析发现,罗格列酮在总RNA水平诱导1461个差异表达基因,但只有116个基因在多聚核糖体组分中富集,说明存在强烈的翻译缓冲作用。多聚核糖体富集的85个共享基因主要参与脂肪因子信号、甘油三酯生物合成和脂肪生成,而非炎症通路。qPCR验证发现eWAT中adipoq、arxes1、fabp4等脂肪特异性基因在多聚核糖体组分中的表达显著高于总RNA,而iWAT中这种选择性更为明显。蛋白质组学也显示FABP4等脂肪生成蛋白表达上调。
使用eIF4A抑制剂阻断翻译起始能显著抑制10T1/2细胞的脂肪分化,脂滴形成几乎完全被阻断。
翻译效率分析鉴定出135个转录本翻译效率上调、206个下调。这些上调转录本的5′UTR中富集富G六聚体基序,可能形成G四链体结构。zfp451、zfp516、stx6、tns1、postn以及pnpla2(编码ATGL脂肪甘油三酯脂肪酶)等转录本的5′UTR中发现了该富G基序。

结论与价值
研究首次揭示罗格列酮通过PPARγ直接结合核糖体基因增强子来诱导核糖体因子表达,进而驱动脂肪前体细胞中mRNA的翻译选择性。这种翻译重塑使多聚核糖体优先翻译脂肪生成和脂质代谢相关的mRNA,同时通过翻译缓冲抑制炎症通路的蛋白输出。研究提出,肥胖时脂肪前体细胞核糖体因子表达降低可能是脂肪细胞肥大和代谢适应障碍的重要原因。该工作为TZDs在脂肪组织可塑性中的新机制提供了证据,并将核糖体功能定位为代谢性疾病的潜在治疗靶点。

研究亮点与特色
研究结合了单细胞转录组学、多聚核糖体分析、蛋白质组学和翻译效率计算,全面覆盖了从转录到翻译再到蛋白表达的调控层次。利用急性罗格列酮处理模型避免了长期药物引起的体重和脂肪量改变带来的混淆。发现G四链体相关基序在翻译效率上调转录本5′UTR中富集,提示罗格列酮可能驱动能够解析这些结构的蛋白表达,为脂肪组织翻译调控提供了新视角。研究还强调了脂肪库特异性——eWAT和iWAT在罗格列酮反应上的差异,iWAT表现出更强的分化反应和更广泛的翻译选择性。

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