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血管化人脑类器官单细胞转录组学解析胎儿缺氧再灌注损伤中的谱系特异性应激适应

期刊:TheranosticsDOI:10.7150/thno.117001

本研究由Simeng Yi、Min Huang、Chunmei Xian等来自西南医科大学附属医院神经系统疾病与脑功能实验室(Laboratory of Neurological Diseases and Brain Function, The Affiliated Hospital, Southwest Medical University)、西南医科大学表观遗传学与脑科学研究所(Institute of Epigenetics and Brain Science, Southwest Medical University)的多位研究者共同完成,于2025年6月9日发表在学术期刊《Theranostics》(2025年第15卷第14期,页码7001-7024)。

学术背景

胎儿缺氧是导致新生儿死亡和永久性脑损伤的主要因素,约23%的受影响新生儿会出现不可逆的神经功能缺陷,包括认知障碍、抑郁和焦虑等远期行为异常。传统动物模型因物种差异和行为变异性存在局限,而现有的三维(3D)人脑类器官(brain organoids)模型缺乏血管系统和免疫组分(如小胶质细胞),难以模拟神经血管互作和炎症反应。为此,本研究开发了一种血管化人脑皮质类器官(vascularized human cortical organoids, VHCOs)模型,整合了皮质类器官(HCOs)与血管类器官(HBVOs),旨在单细胞分辨率下解析缺氧-复氧损伤中细胞类型特异性应激适应机制。

研究流程

  1. 模型构建

    • HCOs制备:使用H9人胚胎干细胞(human embryonic stem cells, hESCs)通过悬浮培养生成胚胎体(embryoid bodies, EBs),分阶段诱导为皮质类器官(HCOs),历时75天,直径从419.15±14.40 µm增至1556.85±118.98 µm。免疫染色验证了神经前体细胞(SOX2、PAX6)、中间祖细胞(TBR2)、皮质层神经元(TBR1)和成熟星形胶质细胞(GFAP+)的存在。
    • HBVOs制备:通过EBs分阶段诱导为血管类器官(HBVOs),10天后形成直径894.42±65.93 µm的球体,包含CD31+内皮细胞(endothelial cells, ECs)、PDGFRβ+周细胞(pericytes)和ACTA2+平滑肌细胞(smooth muscle cells, SMCs)。
    • VHCOs融合:将30天的HCOs与10天的HBVOs共培养30天,形成直径1863.22±134.14 µm的整合类器官。免疫荧光显示其具备血脑屏障(blood-brain barrier, BBB)特征:ZO-1/CLDN5+紧密连接、GFAP+/S100B+星形胶质细胞与血管共定位。
  2. 缺氧-复氧模型

    • 60天的VHCOs暴露于1%低氧环境48小时(模拟急性缺氧),随后复氧5天(21% O₂)。免疫组化和qPCR证实缺氧诱导因子HIF-1α及缺氧响应基因(如AK4、PDK1)显著上调。
  3. 单细胞转录组分析

    • 对缺氧、复氧及对照组VHCOs进行单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq),共分析46,418个细胞,鉴定出16种细胞类型,包括神经前体细胞(ventricular radial glia, vRG;outer radial glia, oRG)、中间祖细胞(intermediate progenitors, IPs)、星形胶质前体细胞(astrocyte precursors, AstPs)、GABA能神经元(GABAergic neurons)、谷氨酸能神经元(glutamatergic neurons)、少突胶质细胞(oligodendrocytes)、小胶质细胞(microglia)、内皮细胞(ECs)、周细胞、平滑肌细胞、间充质基质细胞(mesenchymal stromal cells, MSCs)和成纤维细胞(fibroblasts)。
  4. 关键发现

    • 细胞类型特异性损伤
      • AstPs表现为发育停滞(持续下调NFIA、ZBTB20等胶质发生基因)和突触功能受损(DST、FZD3下调)。
      • GABA能神经元亚型I(低GAD1/2表达)出现神经源性崩溃,而亚型II(高GAD1/2表达)表现出缺氧耐受性。
      • 小胶质细胞呈现双相炎症反应:缺氧期抑制(AXL、NF-κB下调),复氧期超活化(CCL3、IL6上调)。
    • 血管重塑:缺氧期ECs血管生成信号(EFNB2、MMP14)受抑,复氧期通过NOTCH信号(JAG1-NOTCH3)和胶原沉积(COL3A1、COL5A1)驱动修复。
    • 细胞互作重编程
      • 神经-非神经互作网络(如IGF2-IGF2R、LGALS3-MERTK、WNTs-SFRP2)在修复期显著激活。
      • CellPhoneDB分析揭示缺氧后BBB破坏(GJA1-TJP1下调)及复氧期通过LGALS3-MERTK信号修复。
  5. 调控机制

    • SCENIC分析显示:
      • AstPs中SOX2靶基因激活可能参与修复。
      • GABA能神经元亚型I中ATF4驱动的未折叠蛋白反应(unfolded protein response, UPR)与缺氧易感性相关。
      • 复氧期周细胞和MSCs中ARID3A/MSX1上调促进肌源性分化。

结论与价值

本研究通过VHCOs模型首次在单细胞层面揭示了人类胎儿脑缺氧-复氧损伤的细胞特异性机制:
1. 科学价值:填补了传统模型无法模拟神经血管单元(neurovascular unit)的空白,明确了AstPs和GABA能神经元亚型I为关键脆弱靶点,为精准干预提供新靶标(如IGF2-IGF2R通路)。
2. 应用价值:VHCOs可作为药物筛选平台,评估针对缺氧后神经保护或血管修复的疗法。

研究亮点

  1. 创新模型:首个整合BBB和小胶质细胞的血管化类器官,模拟人类胎儿脑发育(8-16孕周转录特征)。
  2. 技术突破:单细胞转录组结合SCENIC/CellPhoneDB多组学分析,解析缺氧记忆(hypoxia memory)在非神经细胞的持续效应。
  3. 临床意义:发现小胶质细胞双相炎症和GABA能神经元亚型异质性,为新生儿脑病分层治疗提供依据。

局限与展望

  1. 未功能验证BBB通透性,未来需微流控技术整合。
  2. 仅使用H9细胞系,需多供体验证普适性。
  3. 缺乏少突胶质细胞谱系,需优化培养方案。

此研究为理解人类特异性缺氧脑损伤机制树立了新范式,并为开发神经保护策略奠定了坚实基础。

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