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基因治疗与基因编辑策略在遗传性血液疾病中的应用

期刊:journal of genetics and genomicsDOI:10.1016/j.jgg.2024.07.004

基因治疗与基因编辑技术在遗传性血液疾病中的应用策略综述

作者及机构
本文由Xuemei Song、Jinlei Liu(共同一作)、Tangcong Chen、Tingfeng Zheng、Xiaolong Wang及通讯作者Xiang Guo(电子科技大学医学院、四川省医学科学院·四川省人民医院血液病研究所)合作完成,发表于2024年7月的《Journal of Genetics and Genomics》(JGG)。

主题与背景
本文系统综述了基因治疗与基因编辑技术在遗传性血液疾病(如β-血红蛋白病、血友病等)中的研究进展与应用策略。随着CRISPR-Cas9等基因编辑工具的突破,基因治疗已从概念验证发展为临床现实,尤其是2023年全球首款CRISPR基因编辑疗法Casgevy(靶向BCL11A增强子)的获批,标志着该领域的里程碑进展。文章重点探讨了治疗靶点筛选、基因编辑工具优化及临床试验成果,为未来更安全、高效的基因治疗提供理论依据。


核心观点与论据

1. 遗传性血液疾病的基因治疗策略
基因治疗分为基因增补(gene augmentation)基因编辑(gene editing)两类。前者通过病毒载体(如AAV、慢病毒)递送功能基因,但存在外源基因随机整合风险;后者通过ZFN、TALEN或CRISPR等技术精准修正突变。以β-血红蛋白病为例,治疗策略包括:
- 纠正β-珠蛋白(HBB)突变:如通过碱基编辑器(ABE/CBE)修复镰状细胞病(SCD)的HbS突变(如HBB-6A>T),体外修复效率达80%(Newby et al., 2021)。
- 重新激活γ-珠蛋白(HBG):靶向抑制BCL11A(胎儿血红蛋白HbF的主要抑制因子)或其增强子,如Casgevy通过CRISPR编辑BCL11A+58位点,使HbF水平提升至30%以上(Frangoul et al., 2021)。

支持证据:临床试验NCT05456884(BEAM-101)显示,碱基编辑HBG启动子可显著提高HbF表达;而RM-001(靶向HBG1/2启动子)在β-地中海贫血患者中实现100g/L的HbF水平(Liu et al., 2023)。


2. 关键治疗靶点的分子机制
BCL11A依赖性通路
- BCL11A:通过结合HBG启动子的TGACCA序列抑制HbF。敲除其红细胞特异性增强子可使HbF提升至35.9%(Sankaran et al., 2008)。
- KLF1与MYB:调控BCL11A表达,但KLF1突变可能导致血小板减少症(Lamsfus-Calle et al., 2020)。

BCL11A非依赖性通路
- 表观遗传调控:如DNA甲基转移酶DNMT1维持HBG启动子甲基化(Xu et al., 2013),而组蛋白去甲基化酶KDM1A抑制剂可激活HbF(Shi et al., 2013)。
- 非编码RNA:如BGLT3通过染色质环化激活HBG转录(Ivaldi et al., 2018)。

支持数据:ATF4通过结合BCL11A+55增强子促进HBG表达(Huang et al., 2020);而ZNF410通过调控CHD4(NuRD复合物)间接影响HbF(Lan et al., 2020)。


3. 基因编辑工具的革新
- CRISPR-Cas12a:Edit-301利用Cas12a的非PAM依赖性,精准编辑HBG启动子(Sousa et al., 2021)。
- 碱基编辑器(BE):如ABE8e-SpRY可修复IVS-II-654突变,将异常剪接mRNA从84.5%降至36.3%(Liao et al., 2023)。
- Prime Editor(PE):在SCD小鼠模型中实现体内HBB-T>A修正,效率达43.6%(Li et al., 2023)。

技术优势:Transformer Base Editor(TBE)通过锁定脱靶位点的胞嘧啶脱氨酶,显著降低脱靶风险(Han et al., 2023)。


4. 临床试验与转化应用
- 已获批疗法:Zynteglo(慢病毒载体递送HBB基因,2022年FDA批准)、Lyfgenia(靶向HBB,2023年获批)。
- 在研试验:NCT06328764(CS-101碱基编辑治疗β-地中海贫血)、NCT05851105(HGI-002治疗α-地中海贫血)。

挑战:AAV载体的瞬时表达限制(血友病治疗中FVIII表达逐渐丢失),以及基因编辑的长期安全性需进一步验证。


意义与价值
1. 科学价值:阐明了HBG调控网络的多层次机制,为靶点筛选提供新思路(如ETO2、SPOP等)。
2. 临床价值:推动个体化治疗,如Casgevy适用于多种β-血红蛋白病,而碱基编辑有望覆盖罕见突变。
3. 技术革新:PE和Omega系统(基于TnPB的RNA引导核酸酶)代表下一代精准编辑工具(Saito et al., 2023)。

亮点
- 首次汇总BCL11A依赖与非依赖通路的关键靶点。
- 对比不同基因编辑工具在血液疾病中的效率与安全性。
- 提出“表观遗传+药物协同”策略(如SPOP抑制剂联合羟基脲)。

本文为遗传性血液疾病的基因治疗提供了全面路线图,并强调了多学科交叉(如表观遗传学、递送技术)对未来研究的重要性。

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