这篇文档属于类型a，即报告了一项原创性研究。以下是针对该研究的学术报告：
1. 研究团队与发表信息
本研究由来自多个机构的团队合作完成：第一作者Jessica J. Chiang（哈佛医学院微生物与免疫生物学系），共同作者包括Konstantin M. J. Sparrer（芝加哥大学微生物系）、Michiel van Gent等；通讯作者为Michaela U. Gack（芝加哥大学微生物系）。研究发表于Nature Immunology期刊2018年1月第19卷，页码53–62，DOI为10.1038/s41590-017-0005-y。
2. 学术背景与研究目标
该研究聚焦于先天免疫系统中RIG-I（Retinoic acid-Inducible Gene-I，视黄酸诱导基因I）受体如何识别DNA病毒感染的机制。尽管已知RIG-I能检测RNA病毒衍生的双链RNA（dsRNA），但其在DNA病毒（如疱疹病毒）感染中的作用尚不明确。研究目标包括：
- 鉴定DNA病毒感染期间被RIG-I识别的宿主RNA分子；
- 揭示病毒如何通过干扰宿主RNA生命周期触发免疫应答。
背景知识：RIG-I通过识别病毒RNA的5′-三磷酸基团和双链结构激活抗病毒信号通路，但DNA病毒（如HSV-1）不产生此类RNA。此前研究发现，RNA聚合酶III（Pol III）可将病毒DNA转化为RIG-I配体，但生理条件下具体的RNA分子未被鉴定。
3. 研究流程与实验方法
研究分为六个主要步骤：
步骤1：RIG-I在HSV-1感染中的时间依赖性作用
- 研究对象：正常人肺成纤维细胞（NHLFs）和RIG-I基因敲除（ddx58–/–）小鼠胚胎成纤维细胞。
- 方法：通过siRNA敲低RIG-I、cGAS或IFI16，感染HSV-1后检测细胞因子（IFN-β、TNF）表达。
- 关键实验：qRT-PCR和ELISA分析显示，RIG-I在感染后期（16小时）显著促进细胞因子表达，而DNA传感器（如cGAS）在早期（6小时）起主要作用。
步骤2：鉴定HSV-1感染中与RIG-I结合的宿主RNA
- 方法：在HEK 293T细胞中表达Flag标记的RIG-I，感染HSV-1突变株（US3激酶失活）后免疫沉淀RIG-I-RNA复合物，通过RNA测序（RNA-seq）分析结合RNA。
- 结果：RNA-seq显示RIG-I显著富集宿主非编码RNA（如5S rRNA假基因141，即RNA5SP141），而非病毒RNA。qRT-PCR验证RNA5SP141在感染后细胞质中积累。
步骤3：验证RNA5SP141作为RIG-I直接配体
- 方法：体外转录RNA5SP141转染细胞，检测IFN-β表达；通过ATP水解实验验证RIG-I激活；U6启动子表达RNA5SP141以排除dsRNA污染干扰。
- 结果：RNA5SP141能强烈激活IFN-β通路，且依赖5′-三磷酸基团（磷酸酶处理取消活性）。ATP水解实验证实其直接激活RIG-I的ATP酶活性。
步骤4：HSV-1诱导RNA5SP141的核质转位
- 方法：细胞分馏实验结合qRT-PCR，比较感染与未感染细胞中RNA5SP141的亚细胞定位。
- 结果：HSV-1感染导致RNA5SP141从核内转位至细胞质，而RNA病毒（如SeV）无此效应。
步骤5：病毒通过下调RNA结合蛋白“解除屏蔽”RNA5SP141
- 方法：Co-IP鉴定RNA5SP141结合蛋白（如MRPL18、TST）；siRNA敲低或过表达这些蛋白，检测IFN-β激活。
- 结果：HSV-1感染下调MRPL18和TST表达，释放RNA5SP141以供RIG-I识别。敲低MRPL18/TST增强IFN-β应答。
步骤6：RNA5SP141在EBV和IAV感染中的作用
- 方法：在EBV潜伏感染的AGS细胞中诱导病毒激活，或感染流感病毒（IAV），通过siRNA/gapmer敲低RNA5SP141检测免疫应答。
- 结果：RNA5SP141对EBV和IAV触发的IFN-β通路均至关重要，且IAV感染同样下调MRPL18/TST。
4. 主要结果与逻辑关联
- 结果1：RIG-I在HSV-1感染后期激活，区别于早期DNA传感器。
- 结果2：RNA5SP141是RIG-I在DNA病毒感染中的主要宿主RNA配体。
- 结果3：病毒通过核质转位和结合蛋白下调“暴露”RNA5SP141。
- 结果4：该机制亦适用于EBV和IAV，提示核复制病毒的共性免疫逃逸漏洞。
5. 结论与科学价值
研究首次揭示宿主RNA5SP141作为RIG-I的“自我”配体，在DNA病毒和部分RNA病毒感染中触发先天免疫的核心作用。科学价值包括：
- 拓展了“非我”识别范式，提出“病毒扰动宿主RNA导致自我暴露”的新机制；
- 为抗病毒药物设计（如靶向RNA5SP141-MRPL18/TST相互作用）提供新靶点；
- 解释疱疹病毒核复制与免疫激活的时空关联性。
6. 研究亮点
- 创新发现：鉴定首个生理条件下被RIG-I识别的宿主RNA配体；
- 方法学：结合RNA-seq、gapmer敲低和U6启动子表达排除实验假象；
- 跨病毒验证：机制在HSV-1、EBV和IAV中均成立，增强普适性。
7. 其他价值
研究暗示自身免疫疾病中“自我RNA异常暴露”可能与类似机制相关，为自身免疫研究提供新视角。
（注：全文约2000字，涵盖研究全流程与核心发现，术语首次出现时保留英文原词，如RIG-I、RNA5SP141等。）