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宫颈癌中糖基转移酶的细胞异质性及Galnt3阴性上皮细胞的保护作用:基于公共数据库的回顾性队列研究

期刊:international journal of surgeryDOI:10.1097/js9.0000000000002520

宫颈癌中糖基转移酶的细胞异质性及其保护性作用:基于公共数据库的回顾性队列研究

作者及机构
本研究由Xiangya Hospital, Central South University的Junbo Xiao、The Second Hospital of Hebei Medical University的Ren Niu(通讯作者)和Fangchao Zhao(通讯作者)合作完成,发表于*International Journal of Surgery*(2025年出版,DOI: 10.1097/js9.0000000000002520)。研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组(STRNA-seq)技术,揭示了糖基转移酶(Glycosyltransferases, GTs)在宫颈癌(Cervical Cancer, CC)中的细胞异质性,并发现Galnt3阴性上皮细胞是患者预后的保护性因素。


学术背景
宫颈癌是全球女性第四大常见恶性肿瘤,死亡率高且预后差。糖基转移酶(GTs)是一类催化糖基转移反应的酶,通过修饰细胞表面蛋白和脂质的糖基化参与肿瘤进展,但其在宫颈癌中的作用尚不明确。既往研究表明,GTs在乳腺癌、胃癌等癌症中可作为预后标志物,但宫颈癌中GTs的细胞特异性表达及其与肿瘤微环境(TME)的相互作用缺乏系统性研究。本研究旨在通过单细胞和空间转录组技术,解析GTs在宫颈癌中的异质性表达,并探索其作为治疗靶点的潜力。


研究流程与方法
1. 数据获取与预处理
- 数据来源:整合了来自GEO(GSE208653)的scRNA-seq数据(2例正常组织、2例癌组织)、CROST数据库的空间转录组数据(ID: visds000566)及TCGA的309例宫颈癌患者转录组数据。
- 质量控制:使用Seurat R包过滤低质量细胞(基因数<600或>8000,线粒体基因占比>10%),标准化后通过PCA降维和UMAP可视化聚类。

  1. 细胞注释与GT评分

    • 细胞分群:将细胞分为10类(如T细胞、上皮细胞、巨噬细胞等),并基于GT相关基因集(来自公开数据库)进行评分(AUCell、UCells等5种方法综合)。
    • 差异分析:鉴定出11个在上皮细胞中差异表达的GT相关基因(如高表达的*Galnt3*、*B4GALT4*和低表达的*CHPF*)。
  2. 细胞发育轨迹与通讯分析

    • 伪时序分析:通过Monocle软件发现*Galnt3*表达随上皮细胞发育逐渐降低,提示其可能参与晚期肿瘤进展。
    • 细胞互作:GT高表达上皮细胞(GT-highEpi)通过黏附连接(Adherens Junction)等通路与内皮细胞互作,促进癌症相关信号激活。
  3. 空间转录组验证

    • 空间定位:在病理切片中确认*Galnt3*等基因在癌组织中的高表达区域,并通过deconvolution分析量化细胞亚群分布。
  4. 功能实验

    • 体外实验:在C-33A和CaSki细胞系中敲低或过表达*Galnt3*,发现其显著影响细胞增殖和侵袭能力(CCK-8和Transwell实验)。
    • 机制研究:WB和qPCR证实*Galnt3*通过NF-κB通路上调MCP1表达,招募巨噬细胞浸润,但不影响其极化。

主要结果
1. GTs的细胞异质性:GT相关基因在上皮细胞中富集程度最高,其中*Galnt3*表达与肿瘤恶性程度正相关。
2. 保护性作用:Galnt3阴性上皮细胞浸润程度高的患者预后更佳(OS和DFS显著延长),且与肿瘤相关巨噬细胞(TAM/M2)和髓系来源抑制细胞(MDSC)呈负相关。
3. 功能机制:*Galnt3*通过O-糖基化激活NF-κB信号,促进MCP1分泌和免疫微环境重塑,驱动肿瘤进展。


结论与价值
本研究首次在单细胞和空间层面揭示了GTs在宫颈癌中的异质性分布,明确了*Galnt3*作为促癌因子的作用机制,并提出Galnt3阴性上皮细胞可作为预后标志物。其科学价值在于:
1. 理论层面:阐明了GTs通过糖基化修饰调控肿瘤微环境的分子机制。
2. 应用层面:为宫颈癌的免疫治疗提供了新靶点(如靶向Galnt3-NF-κB-MCP1轴)。


研究亮点
1. 技术创新:整合单细胞与空间转录组,解析GTs的空间分布与细胞互作网络。
2. 发现新颖:首次报道Galnt3阴性上皮细胞的保护性作用及其免疫调节功能。
3. 临床意义:为宫颈癌分层治疗和预后评估提供了潜在生物标志物。

局限性:研究依赖公共数据库,需进一步通过独立队列和动物实验验证机制。未来可探索GTs抑制剂与免疫治疗的联合应用。


(全文约2000字)

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