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阴道微生物群分子分析及人工智能辅助多重PCR检测在细菌性阴道病女性中的诊断性能:单中心经验

期刊:frontiers in cellular and infection microbiologyDOI:10.3389/fcimb.2024.1377225

阴道微生物群分子特征及人工智能辅助多重PCR检测在细菌性阴道病诊断中的性能评估:单中心经验

作者及机构
本研究由西北大学国家微检测系统工程技术中心的Sihai Lu、Zhuo Li、Xinyue Chen等共同完成,通讯作者为Penggao Dai(daipg@nwu.edu.cn)和Liehong Wang(15509719@qq.com)。论文于2024年4月5日发表在*Frontiers in Cellular and Infection Microbiology*(影响因子未提及),标题为《Vaginal Microbiota Molecular Profiling and Diagnostic Performance of Artificial Intelligence-Assisted Multiplex PCR Testing in Women with Bacterial Vaginosis: A Single-Center Experience》。


学术背景

细菌性阴道病(Bacterial Vaginosis, BV)是女性下生殖道最常见的微生物综合征,与不良妊娠结局和抗生素滥用密切相关。传统诊断方法(如Nugent评分)存在主观性强、耗时等局限性。近年来,分子技术(如多重实时PCR和二代测序)为微生物群落分析提供了新视角,但现有方法无法同时定量检测关键乳酸杆菌(如*Lactobacillus crispatus*、*L. iners*)和BV相关病原体(如*Gardnerella vaginalis*)。本研究旨在开发一种新型多重PCR(multiplex PCR, mPCR)检测技术,结合机器学习算法,优化BV的诊断流程。


研究流程与方法

  1. 样本收集与分组

    • 样本来源:从西安医科大学附属第一医院随机收集4865例阴道分泌物样本,排除其他生殖道感染后,最终纳入288例(74例BV患者、25例健康对照、30例中间型微生物群)。
    • 纳入标准:非妊娠、无激素或抗生素使用史、采样前24小时无性行为。
    • 检测指标:通过涂片显微镜检查、革兰染色和化学酶法测定pH值、微生物密度、Nugent评分等。
  2. mPCR检测开发

    • 靶标设计:针对4种乳酸杆菌(*L. crispatus*、*L. gasseri*、*L. jensenii*、*L. iners*)和11种BV相关病原体(如*G. vaginalis*、*Atopobium vaginae*)设计特异性引物和TaqMan探针。
    • 技术验证:灵敏度测试显示可检测低至15拷贝/μL的DNA,且无非特异性扩增(图2a)。
  3. 机器学习模型构建

    • 特征选择:基于微生物丰度差异(如*L. crispatus*减少、*G. vaginalis*增加)筛选候选标志物。
    • 算法应用:采用支持向量机(Support Vector Machine, SVM)、决策树(Decision Tree, DT)和随机森林(Random Forest, RF)构建诊断模型,训练集与验证集比例为2:1。
  4. 数据分析

    • 统计方法:使用ANOVA、卡方检验分析微生物分布差异,ROC曲线评估模型性能。

主要结果

  1. 微生物群差异

    • BV患者中,*L. crispatus*和*L. jensenii*的丰度显著降低(p < 0.0001),而*L. iners*、*G. vaginalis*、*A. vaginae*等病原体显著增加(图3d)。
    • 中间型微生物群(Nugent评分4-6)中,93.3%的样本经SVM模型被重新归类为BV阳性(图5d)。
  2. 诊断模型性能

    • SVM模型表现最优:AUC达0.969(95% CI: 0.945–0.99),灵敏度90.4%,特异性96.1%(图5c)。
    • 对比传统Nugent评分,该模型对“灰色地带”样本(如中间型)的诊断更敏感。
  3. 微生物互作关系

    • *L. iners*与多种病原体(如*A. vaginae*)呈正相关,提示其可能促进BV发展(图4c)。

结论与价值

  1. 科学价值

    • 首次通过mPCR同时定量检测4种乳酸杆菌和11种BV病原体,揭示了BV患者微生物群的动态变化规律。
    • 证实*L. iners*的丰度升高与BV风险相关,为微生物互作机制研究提供新方向。
  2. 应用价值

    • 开发的mPCR技术可作为Nugent评分的替代方案,提升临床诊断效率。
    • SVM模型的高精度为BV的自动化诊断提供了可行性。

研究亮点

  1. 技术创新:自主研发的15重mPCR检测(BVLab assay)具有高灵敏度和特异性。
  2. 跨学科方法:结合微生物组学与机器学习,解决了中间型样本的诊断难题。
  3. 临床意义:为BV的精准分型和个体化治疗提供了分子基础。

局限性:样本仅来自中国人群,未来需扩大种族多样性验证。


(全文约2000字)

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