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操作参数对蛋白质在含有碘化丙啶荧光染料的十二烷基硫酸钠毛细管凝胶电泳中电迁移的影响

期刊:TalantaDOI:10.1016/j.talanta.2025.127601

本研究由Felicia Auer和Andras Guttman*共同完成,分别来自匈牙利Pannonia大学生物分子与化学工程研究所的转化糖组学研究组(Translational Glycomics Research Group)和德布勒森大学医学院分子医学研究中心Horváth Csaba纪念生物分离科学实验室(Horváth Csaba Memorial Laboratory of Bioseparation Sciences)。研究成果发表于2025年的《Talanta》期刊第287卷,文章编号127601,属于Elsevier出版社开放获取文章(CC BY-NC-ND 4.0许可)。

学术背景

该研究聚焦于生物制药领域的关键分析技术——十二烷基硫酸钠毛细管凝胶电泳(Sodium Dodecyl Sulfate Capillary Gel Electrophoresis, SDS-CGE)。SDS-CGE是一种基于蛋白质分子量进行分离的常用技术,在治疗性蛋白质的分析与表征中具有重要作用。近年来,随着荧光检测多毛细管电泳系统在高通量生物聚合物分析中的普及,理解操作参数对电泳迁移的影响变得尤为重要。本研究特别关注在凝胶-缓冲体系中加入荧光染料碘化丙啶(Propidium Iodide, PI)后,温度、凝胶浓度和电场强度这三个关键操作参数对SDS-蛋白质复合物电泳迁移率和分辨率的影响。

研究流程

1. 实验设计与样品制备

研究采用治疗性单克隆抗体Daratumumab(商品名Darzalex®)作为模型蛋白,通过还原和非还原两种处理方式获得完整抗体及其亚基(轻链LC、非糖基化重链NGHC、重链HC)。样品缓冲液含100 mM Tris-HCl和1% SDS(pH 9),还原样品额外添加2-巯基乙醇。使用PNGase F酶切除糖链后,所有样品在70℃变性15分钟。

2. 电泳系统构建

采用Beckman Coulter PA800 Plus毛细管电泳仪,配备激光诱导荧光检测器(LIF,488 nm激发/600 nm发射)。使用有效长度20 cm(总长30 cm)的裸熔融石英毛细管(内径50 μm)。凝胶-缓冲体系含4%硼酸(pH 8)、10%葡聚糖(1.8-2.5 MDa)、2 mM EDTA、10%甘油、0.2% SDS和100 μg/mL PI。创新性地将PI直接加入分离基质实现原位荧光标记,避免了传统繁琐的柱前/柱后衍生步骤。

3. 参数优化实验

  • 温度效应:在20-40℃范围内每5℃间隔测试,应用Arrhenius方程计算迁移活化能
  • 凝胶浓度:测试2.0%-10.0%葡聚糖浓度,通过Ferguson方程分析筛分行为
  • 电场强度:考察200-600 V/cm电场下迁移率变化,研究PI存在与否对构象的影响

4. 数据分析

使用32 Karat软件(v10.1)计算分辨率(USP RS法),GraphPad Prism绘制图表。所有实验重复三次取平均值,误差条表示标准偏差。

主要结果

1. 温度影响

电泳迁移率随温度升高而增加(图1a),符合粘度降低预期。30℃时观察到LC/NGHC分辨率局部最大值(图1b)。Arrhenius分析(图2a)显示活化能(Ea)与分子量呈负相关(图2b):完整mAb(148 kDa)< HC(50 kDa)< NGHC(49 kDa)< LC(24 kDa),表明高电荷大分子更易克服筛分网络阻力。

2. 凝胶浓度效应

含PI体系呈现线性Ferguson图(图3a),与不含PI时的非线性行为形成对比,表明PI可能通过电荷相互作用改变硼酸-葡聚糖交联网络。分辨率随凝胶浓度增加呈MW依赖性凸曲线增长(图3b),但HC/NGHC对例外(需通过调节硼酸浓度优化)。

3. 电场强度作用

电场强度与迁移率呈线性正相关(图4a),PI存在时斜率更缓,提示其通过复合物形成增加SDS-蛋白质刚性。所有组分在500 V/cm以上均出现分辨率下降(图4b),可能源于高压导致的构象变化。

结论与价值

研究确立了SDS-CGE-PI体系的最佳操作参数:30℃、10%葡聚糖凝胶、500 V/cm电场强度。科学价值体现在: 1. 首次系统阐明PI存在下操作参数对蛋白质迁移的影响机制 2. 发现PI可使Ferguson图线性化,提高筛分行为可预测性 3. 证实电场诱导构象变化的分子量依赖性 应用价值包括: - 为生物制药质量控制提供快速、高分辨的蛋白质分析方法 - 简化荧光检测流程,适配高通量分析需求 - 参数优化框架可推广至其他治疗性蛋白分析

研究亮点

  1. 方法创新:开发无需衍生的原位荧光标记SDS-CGE技术
  2. 理论突破:建立包含温度、凝胶浓度、电场的三维迁移率方程(公式3)
  3. 异常现象解析:揭示PI对硼酸-葡聚糖网络结构的调控作用
  4. 应用指导:明确不同分子量蛋白分离的参数优化策略

其他发现

研究发现溶菌酶(pI 11.3)与mAb组分(pI 8-9)在活化能需求上存在显著差异(图2b),提示SDS/PI复合程度受蛋白等电点影响。该现象为后续研究电荷效应对迁移行为的影响提供了新方向。数据可通过请求获取,实验方案已申请匈牙利TUDFIN等基金支持。

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