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人类γδ T细胞受体-CD3复合物的结构

期刊:natureDOI:10.1038/s41586-024-07439-4

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人类γδ T细胞受体-CD3复合物的结构解析及其免疫学意义

作者及机构
本研究由Weizhi Xin、Bangdong Huang、Ximin Chi等共同完成,通讯作者为Qiang Su和Qiang Zhou。研究团队来自中国杭州西湖大学的Research Center for Industries of the FutureWestlake Laboratory of Life Sciences and Biomedicine等机构。论文于2024年6月6日发表在Nature期刊(第630卷)。


学术背景

γδ T细胞是脊椎动物免疫系统中的独特亚群,兼具先天性和适应性免疫特性,在抗感染、抗肿瘤和组织稳态中发挥关键作用。其表面表达的γδ T细胞受体(TCR)能够独立于主要组织相容性复合体(MHC)识别多种抗原,包括磷酸化代谢物(如Vγ9Vδ2 TCR识别的磷酸抗原)和脂类抗原(如Vγ5Vδ1 TCR识别的CD1d-糖脂复合物)。然而,γδ TCR与CD3复合物的完整结构及其组装机制尚不明确,这限制了对其信号转导和免疫治疗潜力的深入理解。

本研究旨在解析两种典型人类γδ TCR-CD3复合物(Vγ9Vδ2和Vγ5Vδ1)的冷冻电镜结构,揭示其独特的组装机制,并探讨其在T细胞激活中的功能差异。


研究流程与方法

1. 蛋白复合物的制备与纯化

  • 构建表达系统:将TCR的γ链、δ链与CD3亚基(CD3εγ、CD3εδ、CD3ζζ)的基因克隆至优化载体中,在ExpiHEK293F细胞中表达。
  • 纯化策略:通过Flag标签和Strep标签两步亲和层析纯化复合物,使用尺寸排阻色谱(SEC)验证其单体和二聚体状态。Vγ9Vδ2复合物为单体,而Vγ5Vδ1复合物因分子量更大,SEC洗脱体积更小,提示其为二聚体。
  • 去垢剂优化:为减少冷冻电镜数据中的胶束干扰,Vγ9Vδ2复合物纯化时采用LMNG(lauryl maltose neopentyl glycol)和胆固醇半琥珀酸酯(CHS)替代传统去垢剂Gdn。

2. 功能验证实验

  • 细胞模型:构建稳定表达Vγ9Vδ2或Vγ5Vδ1 TCR的Jurkat-76细胞系,与抗原呈递细胞(K562细胞)共培养,通过流式细胞术检测T细胞激活标志物CD69的上调。
  • 连接肽(Connecting Peptide, CP)功能研究:设计嵌合TCR(将γδ TCR的CP替换为αβ TCR的CP),发现CP长度和灵活性影响配体结合与T细胞激活。例如,Cγ2亚型的CP更长且无二硫键,导致更高的配体结合能力但激活效率降低。

3. 冷冻电镜结构解析

  • 数据采集:使用300 kV冷冻电镜(Thermo Fisher Krios)采集图像,通过MotionCor2和CryoSPARC进行运动校正和三维重构。
  • 结构解析
    • Vγ9Vδ2 TCR-CD3:分辨率达3.4 Å,显示其为单体,胞外域(ECD)和连接肽具有高度构象灵活性。跨膜区(TM)存在胆固醇样分子,通过氢键网络稳定复合物。
    • Vγ5Vδ1 TCR-CD3:通过局部重构获得ECD(3.0 Å)、跨膜区(3.9 Å)和整体低分辨率(9.5 Å)结构,证实其为二聚体,两个原体通过Vγ5域的背对背相互作用组装。

4. 胆固醇的调控作用

  • 突变实验:构建TM区突变体(如tcrδ2的F283A/F290A/F291A),发现胆固醇结合缺失导致CD3ζ构象变化,增强T细胞激活。
  • 胆固醇耗竭实验:使用ALOD4蛋白耗竭细胞膜胆固醇后,γδ TCR信号显著增强,证实胆固醇对TCR信号转导的抑制作用。

5. 二聚化机制与功能验证

  • Vγ5域的关键作用:Vγ5二聚化界面由保守的Tyr106和Arg120介导,形成“Arg-Tyr-Tyr-Arg”簇。通过荧光寿命成像(FLIM-FRET)证实Vγ5或Vγ2 TCR-CD3在细胞膜上形成二聚体,而其他Vγ亚型(如Vγ9)为单体。
  • 功能丧失突变:引入Y106E/R120H突变后,Vγ5Vδ1 TCR丧失二聚化能力,且无法激活T细胞,表明二聚化是T细胞激活的必要条件。

主要研究结果

  1. 两种γδ TCR-CD3的组装机制

    • Vγ9Vδ2为单体,依赖跨膜区胆固醇稳定;Vγ5Vδ1为二聚体,通过Vγ5域相互作用组装。
    • 二聚化机制由Vγ亚型决定,提示γδ TCR的功能多样性可能与其寡聚状态相关。
  2. 连接肽的调控作用

    • CP长度和灵活性影响配体结合与信号转导。Cγ2亚型因CP更长,虽增强配体结合,但降低激活效率。
  3. 胆固醇的抑制作用

    • 胆固醇通过嵌入跨膜区抑制TCR信号,其耗竭可增强γδ T细胞响应,这一机制与αβ TCR类似。
  4. 二聚化的生物学意义

    • 二聚化是Vγ5Vδ1 TCR激活的必要条件,可能通过增加配体结合价(如CD1d-糖脂的双价结合)增强信号。

研究结论与价值

  1. 科学价值

    • 首次揭示γδ TCR-CD3复合物的两种组装模式,填补了γδ TCR结构生物学的空白。
    • 阐明了胆固醇和连接肽在TCR信号调控中的保守性与独特性。
  2. 应用潜力

    • 为设计基于γδ TCR的免疫疗法(如CAR-γδ T细胞)提供结构基础,尤其是针对Vγ5Vδ1的二聚化特性可优化靶向性。
    • 胆固醇调控机制的发现提示可通过调节膜脂质环境增强γδ T细胞的抗肿瘤活性。

研究亮点

  1. 技术创新

    • 结合冷冻电镜局部重构与FLIM-FRET,解决二聚体结构的动态异质性难题。
    • 开发嵌合TCR模型,首次证明CP长度对γδ TCR功能的直接影响。
  2. 理论突破

    • 提出“Vγ亚型决定寡聚状态”的新范式,解释了γδ TCR的功能多样性。
    • 发现胆固醇的抑制作用在γδ和αβ TCR中的保守性,深化了对TCR信号调控的理解。

其他重要发现

  • 抗原识别模式的启示:γδ TCR的胞外域灵活性类似抗体Fab段,可能通过多种几何构象识别非经典抗原,这一特性与其“类抗体”功能一致。
  • HV4区的进化意义:Vγ5二聚化界面由高度保守的HV4区介导,提示其可能在进化中保留了特定的免疫监视功能。

以上内容全面涵盖了该研究的背景、方法、结果与意义,为相关领域的研究者提供了系统的参考。

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