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基于功能与结构先验的可解释动态脑网络分析

期刊:IEEE Transactions on Medical ImagingDOI:10.1109/TMI.2025.3584231

基于功能与结构先验的可解释动态脑网络分析方法研究

作者与发表信息

本研究由南京航空航天大学人工智能学院的Shengrong LiQi Zhu(通讯作者)、Wei ShaoDaoqiang Zhang(IEEE高级会员)以及哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院的Chunwei Tian共同完成,发表于IEEE Transactions on Medical Imaging期刊。研究得到国家自然科学基金(62371234、62076129等)、江苏省重点研发计划(BE2022842)等项目的支持。


学术背景

研究领域:动态功能脑网络(Dynamic Functional Brain Network, DFBN)分析,属于医学影像与计算神经科学交叉领域。
研究动机:传统DFBN分析方法依赖数据驱动模型,忽视脑结构与功能的先验知识,导致模型可解释性不足;同时,动态脑网络的复杂时空耦合特性使拓扑特征提取成为挑战。
科学问题:如何结合脑功能模块化(如默认模式网络DMN)与结构聚类先验,构建可解释的DFBN分析框架?
研究目标:提出一种融合功能-结构先验的时空张量图卷积网络(ST²GCN),实现动态脑网络的层次化表征与疾病诊断。


研究方法与流程

1. 动态脑网络构建与层次化表征

研究对象
- 癫痫数据集:306例(114正常对照NC、103额叶癫痫FLE、89颞叶癫痫TLE)
- ADNI数据集:226例(82 NC、76记忆担忧SMC、69早期轻度认知障碍EMCI)
- ABIDE数据集:630例(337 NC、293自闭症谱系障碍ASD)
预处理:使用SPM8和DPARSF工具箱进行fMRI数据标准化、去噪、分区(AAL图谱90个脑区)。

关键步骤
- 动态网络构建:通过非重叠滑动窗口(窗口数T=5)提取时间子信号,计算Pearson相关系数(阈值α=0.6)生成动态功能连接矩阵。
- 功能子网络划分:基于预定义的功能-结构聚类(如DMN、额顶网络FPN等8个子网络),将全脑网络分解为层次化子网络。

2. 时空张量图卷积网络(ST²GCN)

创新方法
- 层内传播(Intra-graph Propagation):在单个时间窗口内聚合子网络内相邻节点的空间特征(公式3),采用对称归一化拉普拉斯矩阵处理动态邻接张量。
- 层间传播(Inter-graph Propagation):通过虚拟图连接不同时间窗的相同脑区(公式4),利用全1矩阵构建虚拟邻接关系,捕捉时间演化特征。

功能子网络约束(FSC)
- 层内一致性:通过余弦相似度(公式6)强化同一子网络内脑区特征的相似性。
- 层间差异性:通过欧氏距离(公式7)增强不同子网络间的特征区分度。

3. 分类与可解释性分析

  • 自注意力机制:加权融合不同子网络特征(公式8),生成全局脑网络表征。
  • 诊断模型:两层MLP(32→2神经元)实现疾病分类,采用10折交叉验证评估性能。

主要结果

1. 分类性能

癫痫数据集
- NC vs. FLE&TLE:准确率84.0%(F1 88.1%,AUC 82.0%)
- NC vs. TLE:准确率84.1%(AUC 82.4%)
ADNI数据集
- NC vs. EMCI:准确率95.3%(AUC 94.3%)
ABIDE数据集:NC vs. ASD准确率73.8%(AUC 75.16%)
(均显著优于16种对比方法,如BraingNN、ST-GCN等,详见表I-III)

2. 可解释性发现

关键子网络贡献
- 癫痫诊断中,DMN注意网络(ATN)权重最高(NC vs. FLE任务中ATN贡献45.5%,表VI)。
- 认知障碍诊断中,ATN-FPN交互异常(NC vs. SMC任务中ATN贡献33.7%,FPN贡献26.7%)。

动态连接异常
- 癫痫患者颞叶-视觉网络(VN-AN)连接强度降低(p=0.0316,图6b),与记忆-视觉功能损伤一致。
- SMC患者突显网络-感觉运动网络(SAN-SMN)连接增强(p=0.0120),反映代偿性神经重塑(图6c)。

时空变异性:患者组脑网络动态波动率显著高于对照组(如NC vs. FLE p=0.0182,图7),印证疾病导致网络不稳定性。


结论与价值

科学价值
1. 提出首个融合功能-结构先验的层次化DFBN分析框架,克服传统方法时空特征解耦的局限。
2. 通过ST²GCN与FSC约束,实现脑疾病生物标志物的网络级可解释性(如揭示DMN-ATN在癫痫中的作用)。

应用价值
- 为癫痫分型、认知障碍早期诊断提供新工具(如ADNI数据集EMCI识别AUC达94.3%)。
- 开源代码(GitHub)促进医学影像社区方法复用。


研究亮点

  1. 方法创新:首次将张量图卷积与虚拟图传播结合,实现动态脑网络时空特征协同提取。
  2. 先验融合:通过功能子网络约束(FSC)显式建模脑模块化特性,增强模型生理可解释性。
  3. 多中心验证:在癫痫、ADNI、ABIDE三大数据集上验证普适性,性能超越现有SOTA方法。

其他发现

  • 判别性脑区:颞叶癫痫中海马(Hippocampus.L)杏仁核(Amygdala.R)特征显著(p<0.05,图8b),与临床病理机制吻合。
  • 计算效率:模型仅需0.0433百万参数,单轮训练耗时1.967秒,适合临床部署。

(注:专业术语如”Pearson相关系数”、”AAL图谱”等首次出现时保留英文原词,后文使用中文表述。)

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