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同种异体iPSC来源的iNKT细胞治疗复发性头颈癌:1期临床试验

期刊:Nature CommunicationsDOI:10.1038/s41467-025-66801-w

异基因iPSC来源iNKT细胞治疗复发性头颈癌:一项1期临床试验

主要作者与机构

该研究由千叶大学(Chiba University)医学研究院耳鼻咽喉头颈外科学系的Tomohisa Iinuma、Tomoya Kurokawa、Toyoyuki Hanazawa,千叶大学医学免疫学系的Shinichiro Motohashi,以及理化学研究所(RIKEN)整合医学科学中心发育遗传学实验室的Haruhiko Koseki等人共同完成。研究发表于《Nature Communications》(2025年,第16卷,文章编号11666),DOI为10.1038/s41467-025-66801-w。

研究背景

恒定自然杀伤T细胞(invariant natural killer T cells, iNKT cells)是一类特殊的T细胞亚群,其T细胞受体(T cell receptor, TCR)由人类Vα24-Jα18和Vβ11链组成,能够识别由单态性MHC I类样抗原呈递分子CD1d呈递的糖脂类抗原(如α-半乳糖苷神经酰胺,αGalCer)。iNKT细胞不仅具有类似NK细胞的直接细胞毒性,还能通过释放干扰素-γ(IFN-γ)激活NK细胞、诱导肿瘤反应性细胞毒性T淋巴细胞(cytotoxic T lymphocytes, CTLs)以及“授权”树突状细胞(dendritic cells, DCs),从而在启动抗肿瘤免疫中发挥关键作用。然而,既往临床试验表明,患者内源性iNKT细胞对αGalCer/DCs的反应有限,而自体iNKT细胞的体外扩增又存在技术瓶颈。为克服这些问题,研究团队将iNKT细胞重编程为诱导多能干细胞(induced pluripotent stem cells, iPSCs),再将其再分化为iPSC来源的iNKT细胞(iPSC-iNKT cells)。由于CD1d的单态性,异基因iNKT细胞可对异基因DCs产生应答,这为“现成型”细胞治疗提供了可能。复发性头颈鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma, HNSCC)的标准治疗选择有限,免疫检查点抑制剂的客观缓解率也较低(nivolumab为13.3%,pembrolizumab为14.6%),因此该研究旨在评估异基因iPSC-iNKT细胞经肿瘤供血动脉输注治疗复发性HNSCC的安全性与初步疗效。

研究流程

本研究为单臂、非盲法、首次人体1期临床试验(注册号:jrct2033200116),采用3+3剂量递增设计。主要终点为剂量限制性毒性(dose-limiting toxicity, DLT)的发生率,次要终点包括安全性、疗效评估以及免疫学动态变化。

临床级iPSC-iNKT细胞的制备:首先从健康成人供者外周血单个核细胞(PBMCs)中分离iNKT细胞,通过GMP级仙台病毒载体导入OCT3/4、SOX2、KLF4、c-MYC和SV40大抗原进行重编程,筛选表达多能性标志物且具有Vα24-Jα18基因重排的iNKT细胞来源iPSCs(iNKT-iPSCs),建立主细胞库(master cell bank, MCB)并经日本药品与医疗器械管理局(PMDA)验证。随后,MCB来源的iNKT-iPSCs在GMP级饲养层细胞上分化约30天,获得未成熟iPSC-iNKT细胞并冻存。给药前,将冻存的未成熟iPSC-iNKT细胞复苏,在无饲养层条件下培养约7天,制成终产品。每批终产品均经过质量检测,包括Vα24和Vβ11表达、对K562细胞系的细胞毒性活性以及IFN-γ生产能力。表型分析显示,iPSC-iNKT细胞主要为CD4⁻CD8⁻,表达CD161,组成性表达转录因子PLZF、T-bet和Eomes而不表达RORγt,属于NKT1亚群,TCR刺激后仅产生IFN-γ而不产生IL-4或IL-17。在人头颈癌细胞系FaDu荷瘤的NSG小鼠(敲入人IL7和IL15基因)中,瘤内注射iPSC-iNKT细胞可显著抑制肿瘤生长。

临床试验设计:2020年9月至2023年9月期间,共筛选16例患者,12例入组,最终10例接受iPSC-iNKT细胞输注。首剂量组(3×10⁷ cells/m²)纳入3例,第二剂量组(1×10⁸ cells/m²)纳入7例。细胞通过股动脉插管在透视引导下超选择至肿瘤供血动脉,经造影确认后输注,每2周一次,最多3次。DLT评估期为首次给药至第2周期第14天。

安全性与免疫监测:在每次输注后多个时间点(输注前、0.5、1、2、6、24、48和168小时)采集外周血,检测血清细胞因子(GM-CSF、IFN-γ、IL-2、IL-4、IL-6、IL-8、IL-10、TNF-α)、PBMCs中T细胞亚群和NK细胞数量、抗HLA抗体以及iPSC-iNKT细胞的药代动力学。在第1天(给药前)、第3天、第8天(部分受试者还包括第21天和末次给药后2周)进行流式细胞术分析。此外,对3例第二剂量组受试者(受试者08、09、12)在第1天、第8天和第21天分离CD3⁺ T细胞和CD56⁺CD3⁻ NK细胞,进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)和TCR测序(scVDJ-seq),共分析146,799个细胞。

数据分析流程:scRNA-seq数据使用Cell Ranger(v7.2.0)处理,以GRCh38为参考基因组;scVDJ-seq数据使用Cell Ranger VDJ流程。整合后的数据使用Seurat v4进行分析,经线粒体基因比例<5%和检测基因数>500的质控过滤后,进行主成分分析(PCA)、聚类和UMAP可视化。差异表达基因(DEGs)通过Metascape进行基因本体(Gene Ontology, GO)富集分析。TCR克隆型定义为具有至少一条产生性TCRα链和一条产生性TCRβ链的独特α-β配对,克隆扩增定义为第21天与第1天相比细胞数≥8且扩增倍数≥2。

主要结果

安全性:10例受试者中未观察到死亡或细胞因子释放综合征。最常见的不良事件为发热(5例,1–2级),其余包括贫血(1例3级)、荨麻疹(1例1–2级)、斑丘疹(1例3级)等。1例受试者(受试者11)在首次输注后出现3级全身性斑丘疹,被判定为DLT,经全身糖皮质激素治疗后4周内缓解。在第二剂量组6例可评估受试者中确认1例DLT,因此第二剂量(1×10⁸ cells/m²)被确定为最大耐受剂量(MTD)。血清细胞因子检测中仅IL-6和IL-8可检出,但输注后未见显著升高。流式细胞术分析未发现T细胞亚群、NK细胞或iNKT细胞计数的明显变化。抗HLA抗体检测未观察到任何新诱导的抗HLA抗体或供者特异性抗体。药代动力学分析显示,iPSC-iNKT细胞特异性HLA基因在输注后7天内降至检测限以下(除受试者08首次给药外),表明异基因细胞的存留期不超过一周。

疗效:8例可评估受试者中,首剂量组1例疾病稳定(stable disease, SD)、2例疾病进展(progressive disease, PD);第二剂量组4例SD、1例PD。值得注意的是,第二剂量组的两例SD受试者(受试者08和09)肿瘤长径分别缩小11%和12%。受试者08的CT影像显示,入组前1.5个月内肿瘤长径从39 mm增至46 mm,经2个周期iPSC-iNKT细胞输注后缩小至41 mm。

免疫学动态:在第二剂量组受试者中,CD4⁺和CD8⁺ T细胞的PD-1表达在给药后第8天显著升高(p=0.0313),提示T细胞被激活;NK细胞的PD-1表达在2例受试者中升高,但组间无统计学差异。scRNA-seq分析显示,第8天CD4⁺和CD8⁺ T细胞中上调的DEGs经GO分析富集于IFN-γ信号通路。代表性基因STAT1、IRF1、ISG15和MX1在CD8⁺和CD4⁺ T细胞中于第8天和第21天均表达增加,而IL-4通路相关基因(STAT6、AKT1)未上调。PDCD1(编码PD-1)在CD8⁺和CD4⁺ T细胞中于第8天升高,但在NK细胞中未升高。

TCR克隆扩增分析:比较第1天与第21天的TCR库,CD8⁺ T细胞的克隆扩增较CD4⁺ T细胞更为常见且更为强劲。受试者08、09和12分别鉴定出9、8和1个高效扩增的CD8⁺ T细胞克隆。CD8⁺ T细胞被分为5个亚群:CD8TCF7(初始表型)、CD8CXCR3(记忆表型)、CD8KLRG1(效应表型)、CD8MKI67(增殖型)和CD8RORC(Tc17表型)。在受试者08和09中,克隆扩增主要发生在效应表型(CD8KLRG1)和记忆表型(CD8CXCR3)亚群,且伴随UMAP上的分散分布,提示功能性多样化;而受试者12的扩增较为有限。基因表达比较显示,受试者08的扩增CD8⁺ T细胞中JUN、FOS和CD69等激活相关基因上调,GO分析富集于NF-κB和TCR信号通路;受试者09中FOS和CD69也有轻度上调。

研究结论与意义

本研究首次证明,异基因iPSC-iNKT细胞经肿瘤供血动脉重复输注治疗复发性HNSCC具有良好的安全性,未引起细胞因子释放综合征或针对异基因细胞的抗体产生。尽管iPSC-iNKT细胞在体内的存留时间有限(约一周),但在部分受试者中仍能激活宿主T细胞的IFN-γ通路,诱导效应和记忆表型CD8⁺ T细胞的克隆扩增,并伴随肿瘤缩小。这一发现表明,iPSC-iNKT细胞无需αGalCer/DCs的额外刺激即可发挥免疫佐剂活性,为“现成型”异基因iPSC来源免疫细胞治疗实体瘤提供了首个临床安全性证据。此外,GMP级iNKT-iPSC主细胞库的建立和工业级生产能力的验证,为iPSC-iNKT细胞治疗的规模化应用奠定了基础。

研究亮点

该研究的创新性体现在三个方面:第一,这是异基因iPSC来源iNKT细胞治疗实体瘤的首次人体临床试验,为iPSC来源免疫细胞(尤其是T细胞类)的临床安全性提供了先驱性数据;第二,研究揭示了iPSC-iNKT细胞在无外源刺激条件下通过IFN-γ通路激活宿主CD8⁺ T细胞并驱动克隆扩增的独特免疫机制;第三,研究建立了从iPSC重编程、分化、冻存到临床级终产品制备的完整工艺流程,并通过PMDA验证,展示了工业规模生产的可行性。研究亦指出局限性,包括样本量小、随访时间有限,以及异基因细胞的快速清除可能限制疗效持久性;未来方向包括HLA基因敲除以延长存留、与αGalCer/DCs联合使用以及CAR修饰等策略。

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