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工程化CD4 TCR T细胞靶向NY-ESO-1用于癌症高级细胞疗法

期刊:Science AdvancesDOI:10.1126/sciadv.adu5754

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标题:工程化CD4 TCR-T细胞靶向NY-ESO-1的癌症免疫治疗研究

作者与机构
本研究由Margaux Saillard等来自瑞士洛桑大学(University of Lausanne)、路德维希癌症研究所(Ludwig Institute for Cancer Research)、日内瓦大学(University of Geneva)等机构的跨学科团队完成,通讯作者为Camilla Jandus。研究成果发表于*Science Advances*期刊2025年6月27日第11卷,论文编号eadu5754。


学术背景

研究领域:本研究属于肿瘤免疫治疗领域,聚焦于CD4 T细胞在抗肿瘤免疫中的作用。
研究动机:尽管癌症免疫治疗长期以来以CD8 T细胞为核心,但近年研究发现CD4 T细胞可通过直接细胞毒性或辅助功能参与抗肿瘤免疫。然而,人类白细胞抗原(HLA)II类分子的高度多态性限制了CD4 T细胞疗法的广泛应用。本研究选择HLA-DRB3*02:02(50%高加索人群携带)作为靶点,结合肿瘤睾丸抗原NY-ESO-1(New York Esophageal Squamous Cell Carcinoma 1)的高肿瘤特异性,探索通用型TCR(T细胞受体)疗法的潜力。

科学问题
1. NY-ESO-1特异性CD4 T细胞是否具有跨患者和肿瘤类型的保守TCR特征?
2. 此类TCR能否通过基因工程赋予CD4 T细胞直接抗肿瘤功能?


研究流程与实验设计

1. 抗原特异性CD4 T细胞的筛选与克隆

  • 研究对象
    • 样本来源:8例HLA-DRB3*02:02阳性黑色素瘤患者的PBMCs(外周血单个核细胞)、TILs(肿瘤浸润淋巴细胞)和TILNs(肿瘤浸润淋巴结);3例健康供体(HDs)PBMCs;其他肿瘤类型(肺癌、卵巢癌、神经母细胞瘤)患者样本。
    • 靶标肽段:NY-ESO-1123–137、HTERT916–930、Melan-A94–108
  • 方法
    • 多肽-MHCII四聚体染色:通过荧光标记的pHLAII多聚体(pmHCI multimer)筛选抗原特异性CD4 T细胞。
    • 克隆扩增:通过有限稀释法分离单克隆T细胞,评估其细胞毒性和细胞因子分泌谱。
  • 关键技术
    • MixMHC2Pred算法:预测HLA-DRB3*02:02限制性表位的结合亲和力(阈值:百分位排名<3.5)。
    • CIITA基因转导:通过转导CIITA(MHC II类反式激活因子)增强肿瘤细胞的MHC II表达,用于体外杀伤实验。

2. TCR特征与功能分析

  • TCR测序
    • 对NY-ESO-1特异性克隆进行TCRα/β链测序,发现TRAV8-4TRBV20-1的保守性使用。
    • 对比健康供体和脐带血样本,排除天然TCR库偏倚。
  • 结构模拟
    • 通过ModellerTCRmodel2软件构建TCR-pMHC三维模型,分析NY-ESO-1肽段与HLA-DRB3*02:02的相互作用位点。

3. TCR基因工程与功能验证

  • TCR转导
    • 将克隆的TCRα/β链(含鼠源恒定区)通过慢病毒载体导入原代CD4 T细胞,结合CRISPR-Cas9敲除内源性TCR。
  • 体外实验
    • 细胞毒性检测:LDH(乳酸脱氢酶)释放实验显示,工程化CD4 T细胞对HLA匹配肿瘤细胞的杀伤率达72%(效靶比30:1)。
    • 细胞因子谱:ELISA和LEGENDplex检测显示Th1极化(高IFN-γ、TNF-α)和Th2特征(IL-5、IL-13)。
  • 体内实验
    • 小鼠模型:免疫缺陷IL-2-NOG小鼠接种HLA-DRB3*02:02阳性黑色素瘤细胞(T333A),输注TCR工程化CD4 T细胞后,肿瘤生长抑制效果与NY-ESO-1特异性CD8 T细胞相当。

主要结果与逻辑链条

  1. 保守TCR特征

    • NY-ESO-1特异性CD4 T细胞中,TRAV8-4和TRBV20-1在患者中高度保守(占比>50%),而Melan-A和HTERT特异性克隆则无此规律。
    • 结构基础:分子模拟显示NY-ESO-1肽段与HLA-DRB3*02:02的相互作用位点更多(43个),强于HTERT(37个)和Melan-A(35个)。
  2. 高效细胞毒性

    • NY-ESO-1克隆的杀伤能力显著高于其他抗原特异性克隆(P<0.001),且PBMCs来源的克隆活性高于TILs(可能与肿瘤微环境耗竭相关)。
    • 表型标志:高表达PD-1、TIGIT、VISTA,低表达CD57,提示活化-耗竭混合状态。
  3. 治疗潜力验证

    • 工程化CD4 T细胞在体内外均显示抗肿瘤效果,且无脱靶毒性(NY-ESO-1在正常组织表达极低)。

结论与价值

  1. 科学意义
    • 首次揭示NY-ESO-1特异性CD4 T细胞的保守TCR特征及其结构基础,为“准通用型”TCR疗法提供设计模板。
  2. 应用前景
    • 靶向HLA-DRB3*02:02/NY-ESO-1的TCR工程化CD4 T细胞可覆盖50%高加索人群,适用于多种实体瘤(如黑色素瘤、卵巢癌、神经母细胞瘤)。

研究亮点

  1. 创新方法
    • 结合TCR测序与结构模拟,阐明TCR保守性的分子机制。
    • 开发CRISPR-Cas9辅助的TCR双敲除策略,提升转导效率。
  2. 关键发现
    • CD4 T细胞可直接通过高亲和力TCR介导肿瘤杀伤,挑战了传统“辅助性T细胞”的认知边界。

其他价值

  • 临床转化潜力:本研究为NY-ESO-1疫苗联合TCR-T疗法提供了理论依据,目前团队已启动相关临床试验(未在本文中详述)。
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