这是一项关于结直肠癌(colorectal cancer,CRC)代谢重塑机制的原创性研究,由南方医科大学南方医院病理科的 Jianxiong Chen、Shiyu Duan 等人完成,通讯作者为 Jun Zhou。该研究于 2024 年发表在 Nature Communications 上,文章编号为 15:4969。
研究背景
代谢重塑是肿瘤在应激条件下生存的重要策略。结直肠癌是全球第三常见的恶性肿瘤,也是癌症相关死亡的第二大原因,每年约有 90 万人因此死亡。然而,结直肠癌细胞代谢重塑的具体分子机制仍不清楚。MYG1(melanocyte proliferating gene 1,黑色素细胞增殖基因 1)是 UPF0160 蛋白家族中唯一未被充分研究的成员,具有 3′−5′ RNA 外切酶活性,其 N 端含有核定位信号和线粒体定位信号,在酵母中被认为是核-线粒体通讯的协调者。此前有研究发现 MYG1 在肺腺癌中具有促癌作用,但在结直肠癌中的具体功能尚不清楚。本研究旨在鉴定在结直肠癌代谢重编程中发挥核心作用的核-线粒体双定位蛋白,并阐明其作用机制。
研究流程与主要结果
第一部分:MYG1 在结直肠癌中的表达及临床意义。 研究者首先通过分析公共数据集(GSE24514、GSE9348、GSE20842、GSE74602)筛选结直肠癌与正常黏膜的差异表达基因,并结合腺瘤与正常黏膜的比较(GSE20916)以及转移细胞与原发肿瘤细胞的比较(GSE1323),最终锁定同时具有核和线粒体定位的候选基因 MYG1。在 TCGA COADREAD 队列中的基因集富集分析(GSEA)显示 MYG1 可能参与多种代谢通路。蛋白印迹(western blot)和免疫组织化学(IHC)检测证实 MYG1 在结直肠癌组织中较配对正常黏膜显著上调,且在远处转移患者中表达更高。NF-CRC1 队列(149 对福尔马林固定石蜡包埋样本)的临床相关性分析显示 MYG1 表达与淋巴结转移、远处转移、T 分期和临床分期显著相关。生存分析表明 MYG1 高表达患者的总生存期和无进展生存期均较差。拷贝数变异分析显示 MYG1 在结直肠癌中极少发生扩增,提示其上调并非由基因扩增驱动。进一步研究发现 MYG1 表达在 KRAS 突变型细胞系和组织中显著高于 KRAS 野生型,而在 APC 突变与 MYG1 表达之间未发现显著关联。
第二部分:MYG1 在体外和体内促进结直肠癌增殖与转移。 在 RKO 和 LoVo 细胞中敲低 MYG1 后,细胞增殖、克隆形成、侵袭和迁移能力均受到显著抑制。为探究其功能是否依赖外切酶活性,研究者构建了外切酶失活突变体 MYG1ALL(DHH 残基替换为 ALL),发现 MYG1ALL 同样能促进细胞增殖、克隆形成、侵袭和迁移,尽管程度略低于野生型,表明 MYG1 存在外切酶活性非依赖性的细胞功能。在 LoVo 细胞中敲除 MYG1 也得到一致结果。皮下异种移植模型显示沉默 MYG1 抑制肿瘤生长,过表达 MYG1 则促进肿瘤生长。肝转移模型中 MYG1 显著增加肝转移灶数量。此外,MYG1 促进 G1-S 细胞周期转换,并诱导上皮-间质转化(EMT),表现为 β-catenin、vimentin 和 fibronectin 表达升高,而 ZO-1 和 E-cadherin 表达降低。
第三部分:MYG1 以外切酶活性非依赖方式促进结直肠癌有氧糖酵解。 对 MYG1 敲除的 LoVo 细胞进行 RNA 测序,差异表达基因的功能富集分析显示 MYG1 可能调控糖酵解等代谢过程。在 HCT116 细胞中过表达 MYG1 后,LDHA、GLUT1 和 PKM2 的 mRNA 表达升高。耗氧率(OCR)测定显示 MYG1 过表达细胞的基础呼吸和最大呼吸均降低,而细胞外酸化率(ECAR)升高,表明 MYG1 抑制氧化磷酸化、促进糖酵解。MYG1ALL 同样促进葡萄糖摄取和乳酸分泌,并上调 GLUT1、LDHA 和 PKM2 蛋白表达,进一步证实其作用不依赖外切酶活性。值得注意的是,在肺腺癌细胞 PC9 中,MYG1 反而抑制葡萄糖摄取和乳酸分泌,且 MYG1 表达与 KRAS 突变在肺腺癌中无显著关联,提示 MYG1 在不同癌种中具有代谢调控的异质性。
第四部分:核定位 MYG1 通过 PKM2/c-Myc 信号促进糖酵解。 亚细胞组分分离和蛋白酶 K 剃除实验证实 MYG1 同时定位于细胞核和线粒体。为明确不同亚细胞定位 MYG1 的功能,研究者构建了不同定位信号缺失的突变体:MYG1N(缺失线粒体定位肽,仅保留核定位)和 MYG1M(缺失核定位肽,仅保留线粒体定位)。结果显示 MYG1N 在促进葡萄糖摄取和乳酸分泌方面起主导作用。原位结直肠癌小鼠模型中,MYG1N 组肿瘤增殖更快,18F-FDG PET/CT 扫描显示 MYG1N 组肿瘤葡萄糖摄取最高,肿瘤重量也最大。2-脱氧葡萄糖(2-DG)处理可有效消除 MYG1N 诱导的致癌效应,表明核 MYG1 通过糖酵解促进肿瘤进展。免疫共沉淀结合质谱鉴定发现核内 MYG1 与 PKM2 相互作用,且 MYG1 通过 149-199 氨基酸片段与 PKM2 直接结合。MYG1N 促进 PKM2 在核内积累,增加 PKM2 二聚体比例,但不影响 PKM2 的丙酮酸激酶活性。机制上,MYG1 招募 Hsp90/GSK3β 复合物,促进 PKM2 在 Ser/Thr 位点的磷酸化,从而增强 PKM2 蛋白稳定性。PKM2 在核内转录激活 c-Myc,而 c-Myc 又转录上调 MYG1,形成正反馈环。染色质免疫沉淀-定量 PCR(ChIP-qPCR)和双荧光素酶报告实验证实 c-Myc 可直接结合 MYG1 启动子并激活其转录。
第五部分:线粒体 MYG1 抑制细胞凋亡和氧化磷酸化。 线粒体 MYG1 与细胞色素 c(cytochrome c,cyt c)共定位并相互作用。MYG1M 过表达降低 cyt c 蛋白水平,抑制 OCR,减少 cyt c 从线粒体向胞质的释放,降低 cleaved caspase-3 和 cleaved caspase-9 水平,并抑制 5-FU 诱导的细胞凋亡。这表明线粒体 MYG1 通过抑制氧化磷酸化和阻断 cyt c 释放来促进肿瘤细胞存活。
第六部分:临床验证。 在 NF-PET 队列(43 例行 18F-FDG PET/CT 扫描的结直肠癌患者)中,SUVmax 与 MYG1 表达呈正相关,MYG1 表达也与 PKM2 和 c-Myc 表达显著正相关。小鼠模型肿瘤的 IHC 分析证实 MYG1N 组肿瘤中 PKM2、c-Myc 和 Ki-67 表达更高,凋亡细胞比例更低。
结论与意义
本研究首次揭示了 MYG1 作为结直肠癌代谢重编程关键驱动因子的功能及其核-线粒体协同作用机制。核 MYG1 通过招募 Hsp90/GSK3β 复合物促进 PKM2 磷酸化和稳定,进而激活 PKM2/c-Myc 正反馈信号通路,驱动糖酵解和肿瘤进展;线粒体 MYG1 则通过抑制氧化磷酸化和阻断细胞凋亡发挥促癌作用。临床上,KRAS 突变患者 MYG1 高表达,提示高糖酵解水平和不良预后。靶向 MYG1 有望破坏结直肠癌的代谢平衡,为该疾病的诊断和治疗提供新的潜在靶点。
研究亮点
本研究的主要亮点包括:1)首次明确了 MYG1 在结直肠癌中的促癌作用及其不依赖外切酶活性的功能机制;2)揭示了 MYG1 核-线粒体双定位的协同功能——核 MYG1 驱动糖酵解,线粒体 MYG1 抑制凋亡和氧化磷酸化;3)发现了 MYG1-PKM2-c-Myc 正反馈环在驱动糖酵解中的核心作用;4)建立了 MYG1 表达与 KRAS 突变及 18F-FDG 摄取之间的临床关联,为精准治疗提供了依据。此外,研究还揭示了 MYG1 在结直肠癌与肺腺癌中代谢调控功能的差异性,提示靶向策略需考虑癌种异质性。