急性髓系白血病(AML)中假基因POU5F1B低表达对诊断及预后的影响
作者及研究机构
本研究的通讯作者为江苏大学附属人民医院检验科的Zhao-qun Deng(邮箱:zqdeng2002@163.com)。其他作者包括Jing Yi、Ling-yu Zhou、Yun-yun Yi、Xin Zhu、Xiao-yu Su、Qian Zhao、Jiang Lin和Jun Qian,分别来自江苏大学附属人民医院检验科、复旦大学华山医院急诊科及江苏大学附属人民医院血液科。研究发表于《Medical Science Monitor》(Med Sci Monit)期刊,2019年7月4日正式出版,研究获得中国国家自然科学基金(20120016)、江苏省医学创新团队(CXTDB2017002)等多项资助。
急性髓系白血病(AML)是一种恶性克隆性疾病,以骨髓中异常髓系祖细胞分化阻滞和积累为特征,成人中发病率随年龄增长而升高。尽管分子遗传学进展(如细胞遗传学和分子异常)已为AML预后提供了重要指标,但非编码RNA(ncRNA,包括miRNA、lncRNA和假基因)在癌症中的作用近年备受关注。假基因曾被视为“垃圾DNA”,但部分假基因可通过竞争性内源RNA(ceRNA)机制调控亲本基因表达,甚至参与肿瘤发生。
OCT-4是维持胚胎干细胞多能性的关键转录因子,其假基因POU5F1B(OCT-4-PG1)在胃癌中过表达且与不良预后相关。然而,POU5F1B在AML中的表达及临床意义尚未明确。本研究旨在评估POU5F1B在初诊AML患者中的表达水平,并探讨其与AML诊断和预后的关联。
研究纳入175例初诊AML患者和39例健康对照者骨髓样本,所有患者均按WHO和FAB分类标准诊断。骨髓单核细胞(BMNCs)通过淋巴细胞分离液提取,总RNA采用Trizol试剂分离,逆转录为cDNA后储存于-20°C备用。
采用实时定量PCR(RQ-PCR)技术检测POU5F1B表达。引物设计如下:
- 正向引物:5’-GCGATCAAGCAGCGACTA-3’
- 反向引物:5’-AGGGAAAGGGACTGAGGAG-3’
反应条件包括95°C预变性30秒,随后40个循环的扩增(95°C 5秒,58.1°C 30秒,72°C 30秒,80°C 31秒采集荧光),最终通过熔解曲线分析确认特异性。表达量以管家基因ABL为内参,采用2−ΔΔCt法计算。
通过PCR和高分辨率熔解曲线分析(HRMA)检测DNMT3A、N/K-RAS、NPM1等基因突变,FLT3-ITD和CEBPA突变则通过PCR直接测序验证。
AML患者POU5F1B表达显著低于健康对照(中位数0.0536 vs. 0.7991,p<0.001),且在非急性早幼粒细胞白血病(non-APL)和中危AML亚组中同样低表达(p<0.001)。
ROC曲线显示,POU5F1B可区分AML患者与健康对照(AUC=0.682,95%CI: 0.579–0.786),在non-APL和中危AML中AUC分别为0.683和0.663。
本研究首次揭示POU5F1B在AML中普遍低表达,且其表达水平与WBC计数、CR率和OS显著相关,提示其可作为AML诊断和预后的潜在生物标志物。可能的机制包括:
1. ceRNA调控:POU5F1B与亲本基因OCT-4高度同源,可能通过竞争miRNA结合位点解除OCT-4的抑制,而OCT-4高表达已知与AML不良预后相关。
2. 表观遗传调控:假基因衍生的lncRNA可能通过招募染色质修饰复合物(如SUV39H1)沉默OCT-4启动子。
科学价值:为AML的分子分型提供了新靶点,并为假基因功能研究提供了临床证据。
应用价值:POU5F1B检测或可辅助AML早期诊断和风险分层,指导个体化治疗。
局限性:需进一步通过功能实验验证POU5F1B与OCT-4的调控关系,并扩大样本验证其在各亚型中的普适性。
注:全文可通过链接访问:Med Sci Monit全文。