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基于多视角高阶网络的静息态功能磁共振成像神经发育障碍诊断方法

期刊:journal of imaging informatics in medicine

这篇文档属于类型a,是一篇关于使用深度学习模型诊断神经发育障碍(Neurodevelopmental Disorders, NDD)的原创性研究论文。以下是详细的学术报告内容:


作者及机构

本研究由Yueyang LiWeiming Zeng(通讯作者)、Wenhao DongLuhui CaiLei WangHongyu Chen(上海海事大学数字图像与智能计算实验室)、Hongjie Yan(徐州医科大学附属连云港医院神经内科)、Lingbin Bian(上海科技大学)和Nizhuan Wang(通讯作者,香港理工大学)共同完成。研究发表于Journal of Imaging Informatics in Medicine


学术背景

研究领域:本研究属于医学影像信息学与人工智能交叉领域,聚焦于利用静息态功能磁共振成像(resting-state fMRI, rs-fMRI)数据诊断神经发育障碍(如自闭症谱系障碍ASD和注意力缺陷多动障碍ADHD)。

研究动机:当前临床诊断NDD主要依赖专家主观行为评估,存在诊断不一致性和延迟性问题。尽管深度学习模型(如图神经网络GNN和卷积神经网络CNN)已用于NDD分类,但现有方法多局限于单层次脑功能网络(Brain Functional Networks, BFNs)或忽略高阶特征(high-order features),而高阶特征对揭示BFNs的复杂关联至关重要。

研究目标:提出一种多视角高阶网络(Multi-view High-order Network, MHNet),通过整合欧几里得空间(Euclidean space)和非欧几里得空间(non-Euclidean space)的特征,提升NDD分类性能。


研究流程与方法

1. 数据准备与预处理

  • 数据集:使用三个公开数据集——ABIDE-I(1112例,ASD vs. 典型发育)、ABIDE-II(1114例)和ADHD-200(947例,ADHD vs. 健康对照)。
  • 预处理:采用DPARSF和Athena2流程,包括去颅骨、时间层校正、运动校正、频带滤波(0.01–0.1 Hz)等,并使用AAL1和Brainnetome图谱划分脑区。

2. MHNet模型架构

MHNet包含三个核心模块:
1. 欧几里得空间特征提取(ESFE)模块
- 功能连接生成(FCG):构建功能连接矩阵(FC matrix)。
- 高阶CNN(HCNN):通过1D-CNN提取局部特征,并引入高阶池化(High-order Pooling, HoP)捕获高阶统计特征。

  1. 非欧几里得空间特征提取(non-ESFE)模块

    • 通用互联网式脑分层网络生成(G-IBHN-G):构建多层次BFNs(Brain-WAN、Brain-MAN、Brain-LAN),模拟互联网分层结构。
    • 高阶GNN(HGNN):基于残差Chebyshev网络(Res-ChebNet)提取拓扑特征,并通过图高阶池化(Graph High-order Pooling, GHoP)捕获高阶图特征。
  2. 特征融合分类(FFC)模块

    • 融合ESFE和non-ESFE的高阶特征,通过多层感知机(MLP)和Softmax分类器实现NDD诊断。

3. 实验设计

  • 对比方法:与12种传统机器学习(如SVM、KNN)和深度学习方法(如BrainGNN、BrainNetCNN)对比。
  • 评估指标:准确率(ACC)、敏感性(SEN)、特异性(SPEC)、AUC和平均得分(AVG)。

主要结果

  1. 分类性能

    • MHNet在三个数据集上均达到最优性能(ABIDE-I: ACC=76.29%, AUC=78.68%;ADHD-200: ACC=70.33%),显著优于其他方法(提升4%-8%)。
    • Brainnetome图谱因更精细的脑区划分(246区 vs. AAL1的116区),性能优于AAL1。
  2. 消融实验

    • 高阶特征的作用:引入HoP和GHoP后,模型性能提升显著(如HCNN+GN比GN提升5%)。
    • 分层结构的影响:多视角BFNs(WAN-MAN-LAN)比单层次网络(如仅Brain-LAN)更有效。
  3. 可解释性分析

    • 模型识别出与NDD相关的关键脑区(如ASD患者的舌回、杏仁核;ADHD患者的尾状核、丘脑),与现有神经科学发现一致。

结论与价值

  1. 科学价值

    • MHNet首次整合了多视角BFNs和高阶特征,解决了现有模型对复杂脑网络表征不足的问题。
    • 提出的G-IBHN-G模块和Res-ChebNet架构为脑网络分析提供了新方法。
  2. 应用价值

    • 为NDD的客观诊断提供了自动化工具,可辅助临床决策。
    • 开源代码和模块化设计便于后续研究扩展。

研究亮点

  1. 创新方法

    • 多视角分层BFNs构建(模拟互联网拓扑)。
    • 高阶特征提取(HoP和GHoP)增强模型对复杂脑网络的表征能力。
  2. 重要发现

    • 揭示了NDD患者脑功能网络的层级异常模式。
    • 验证了Brainnetome图谱在NDD诊断中的优势。
  3. 局限性

    • 未充分整合非影像数据(如临床表型)。
    • 计算复杂度较高,需进一步优化实时性。

其他有价值内容

  • 非影像数据探索:通过构建群体图(population graph)整合性别、年龄等表型信息,性能提升有限(%),表明影像特征仍是主要贡献因素。
  • 代码开源:所有对比方法和MHNet代码均已公开,促进领域内复现与改进。

本研究为NDD的精准诊断提供了新思路,未来可扩展至其他脑疾病(如精神分裂症、抑郁症)的研究中。

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