モジュール応答分析のテストと限界の克服
研究背景:ネットワーク推定の新たな挑戦 現代の分子生物学およびシステム生物学の分野において、生体分子ネットワーク(遺伝子制御ネットワーク、タンパク質相互作用ネットワーク、シグナル伝達ネットワークなど)の高精度な解析は、細胞の生命活動、疾患発症機構、薬剤作用機序の理解にとって中核的な位置を占めています。しかし、これらの生体ネットワークは極めて複雑であり、ノードが多数、結合関係が錯綜し、強い非線形ダイナミクスや実験測定ノイズが多いという課題が普遍的に存在します。著者らはこうした背景の下、「モジュラー応答解析(Modular Response Analysis, MRA)」に着目しました。MRAは、系のノードに摂動を加え、その応答を解析してモジュール間の相互作用を推定する古典的手法であり、“遺伝子...