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利用基于CT的集成深度学习预测非小细胞肺癌患者免疫检查点抑制剂的获益:一项回顾性研究

期刊:Lancet Digital HealthDOI:10.1016/s2589-7500(23)00082-1

学术报告

一、研究主要作者、机构及期刊信息

本文的研究由 Maliazurina B Saad、Lingzhi Hong、Muhammad Aminu、Natalie I. Vokes 等多位学者共同完成,主要来自德克萨斯大学 MD Anderson 癌症中心和斯坦福大学医学院。本研究发表于 The Lancet Digital Health,2023 年 7 月,《Predicting benefit from immune checkpoint inhibitors in patients with non-small-cell lung cancer by CT-based ensemble deep learning: a retrospective study》。


二、研究的学术背景

本研究的主要领域是非小细胞肺癌(Non-Small-Cell Lung Cancer, NSCLC)患者的精准治疗,特别是免疫检查点抑制剂(Immune Checkpoint Inhibitor, ICI)疗法的疗效预测。NSCLC 是全球最主要的癌症相关死亡原因之一,而 ICI 已成为无靶向治疗选择患者的重要治疗手段。然而,约仅有 20%-30% 的患者对 ICI 显现出长期疗效。

目前已有组织学标志物(如 PD-L1 表达)用于指导 ICI 治疗,但这些生物标志物存在性能不足、组织可采性限制和肿瘤异质性等问题。另外,放射影像学数据可能全面捕捉癌症生物学特征,因此有潜力成为非侵入性预测工具。基于这一背景,该研究旨在利用深度学习技术分析患者的胸部 CT 图像,开发一种影像学特征体系来预测 ICI 疗法的临床获益,并评估其临床价值。


三、研究方法与工作流程

  1. 研究设计与数据收集
    本研究为回顾性建模研究,数据来源于德州大学 MD Anderson 癌症中心和斯坦福大学医学院,共纳入 976 名转移性 NSCLC 患者,研究时间跨度为 2014 年 1 月 1 日至 2020 年 2 月 29 日。纳入患者需满足以下条件:
    • EGFR 和 ALK 野生型(不存在驱动突变)。
    • 明确的 NSCLC 病理诊断和转移性病程。
    • 接受至少两个疗程的抗 PD-1 或 PD-L1 抑制剂治疗。
    • 在接受 ICI 治疗前取得高质量的胸部 CT 图像。

患者数据被分为训练集(564 人)、验证集(78 人)和测试集(274 人),用于模型的构建、验证与测试。同时,斯坦福大学的数据被用作外部验证集(60 人)。

  1. 影像数据处理与CT深度学习模型开发

    • 影像预处理:为减少图像获取协议的异质性影响,研究团队开发了一系列图像处理算法以标准化 CT 数据。
    • 模型架构与训练:研究采用了一种集成式深度学习框架(ensemble deep learning),集成了四种三维卷积神经网络(Convolutional Neural Network, CNN)子网络:
      • 子网络1:采用监督学习方法。
      • 子网络2与3:混合监督与非监督学习者,但集成方式不同。
      • 子网络4:采用非监督学习方法。 所有子网络采用独立训练,模型优化过程中通过数据增强(旋转、缩放、对比度调整等)、Dropout 和正则化方法避免过拟合。
    • 集成策略:为增强模型的泛化性和稳健性,采用基于决策树的集成算法整合四个子网络的输出,最终形成 Deep-CT 模型。
  2. 结果分析与验证

    • 单变量与多变量分析:评估 Deep-CT 模型的预测能力,并与临床基准模型(集成了传统临床和病理特征)的性能进行比较。
    • 特征相关性分析:解析 Deep-CT 的图像风险评分,探讨其与放射组学(radiomics)特征及其他生物标志物的关系。
    • 外部验证:在斯坦福数据集上独立测试 Deep-CT 模型的表现。

四、研究主要结果

  1. 基于 CT 的深度学习模型的预测性能
    Deep-CT 模型在 MD Anderson 测试集上实现了患者显著的生存分层:低风险组中位总生存时间(Overall Survival, OS)比高风险组延长了 5.4-6.5 个月,中位无进展生存时间(Progression-Free Survival, PFS)延长了 15.5-17.3 个月。在斯坦福外部数据集中,Deep-CT 模型同样成功分层了患者 OS。

同时,Deep-CT 模型在单变量和多变量分析中显示出独立的预测能力,对 PD-L1 表达、组织学类型和其他已知风险因素具有补充性。

  1. 模型与放射组学特征的关联性
    Deep-CT 模型的风险评分对某些放射组学特征(如肿瘤和肺组织的纹理异质性)显示出显著相关性,但放射组学特征单独建模的性能低于 Deep-CT,表明深度学习捕捉了超越传统放射组学的图像模式。

  2. 深度学习与临床基准模型的协同预测能力
    整合 Deep-CT 模型与临床基准模型得出的组合模型(Composite Model)展示了最优的预测性能。在 PFS 的预测上,组合模型的 C-index 从基准模型的 0.70 提升至 0.75,并在多个亚组中表现稳定。


五、研究结论与意义

本研究首次开发了一种基于 CT 深度学习的影像学特征模型,能够独立且稳健地预测转移性 NSCLC 患者在接受 ICI 疗法后的生存获益。Deep-CT 模型不仅在 MD Anderson 和斯坦福数据集上表现出一致的预测性能,还展示了显著优于传统临床指标(如 PD-L1)的能力。

该模型有望成为一种非侵入性、可扩展的工具,赋能于精准免疫治疗的个性化决策:
- 帮助识别可能从 ICI 单药疗法获益的患者,优化治疗选择,减少联合化疗带来的毒副作用。
- 发现高风险患者,支持早期疗效评估,制定强化治疗策略。


六、研究亮点

  1. Deep-CT 模型通过图像全胸区域的深度学习解析,捕捉超越传统放射组学的图像异质性模式。
  2. 创新性地结合多种深度学习子网络,形成集成框架,提升模型稳定性与可靠性。
  3. 提供了基于影像学的非侵入性预测方法,对 PD-L1 等组织标志物具有显著补充价值。
  4. 在多中心队列和跨种族、年龄、性别等亚组中表现出良好的泛化性,支持其广泛应用的潜力。

七、进一步影响与展望

尽管 Deep-CT 模型在现有数据中显示了可行性,本研究是一项回顾性分析,仍需在更大规模的多中心前瞻性队列中进行验证。同时,模型对 ICI 单药和联合化疗疗效的预测能力值得进一步探索。随着算法优化和生物标志物的整合,本研究可能为未来非小细胞肺癌的个性化免疫治疗提供坚实基础。

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