Chrombus-XMBD:染色質特徴に基づく3Dゲノム予測グラフ畳み込みモデル

研究背景と学問的意義 真核細胞内において、クロマチン(Chromatin)の三次元空間構造は、遺伝子発現の制御に極めて重要な役割を果たしています。DNAは複雑な折りたたみやループ形成、局所的な空間再構築を通じて、異なる遺伝子要素(プロモーターpromoterやエンハンサーenhancerなど)が空間的に隣接し、精巧なシス(cis)制御を実現します。近年、発生生物学、疾患メカニズム、またはエピゲノム研究の分野で、三次元ゲノム(3D-genome)の動的構造が遺伝子発現の変化と密接に関連していることが繰り返し証明されています。 現在、ゲノム空間構造を捉える主な実験手法には、3C、4C、5C、Hi-C、ChIA-PET、HiChIPなどがあります。しかし、これらの実験手法はコストが高く、操作が複雑...