アミノ酸主鎖のコンフォメーションが翻訳された同義コドンに依存することは統計的に有意ではない

同義コドンがタンパク質主鎖コンフォメーションに与える影響の再評価 —— 厳密な統計検定による構造生物学パラダイムの再考 一、学術的背景と研究動機 分子生物学と構造生物学の分野では、コドン(codon)とタンパク質構造との関係が常に注目されてきました。伝統的な考え方では、タンパク質の一次構造(すなわちアミノ酸配列)がその立体構造(フォールディング)を決定し、遺伝暗号の「縮重性」により同じアミノ酸が複数の「同義コドン(synonymous codons)」でコードされることが可能です。1990年代末以降、同義コドンの使用傾向がmRNAスプライシング、翻訳速度制御、タンパク質の折り畳みダイナミクスなど、様々な生物学的プロセスと密接に関わることが多くの文献で確認されています。これらの知見は、分子生物...