シミュレーションベース推論によるクライオ電子顕微鏡画像からの分子構造テンプレートマッチング

シミュレーションベース推論による単分子構造認識の加速 ――《amortized template matching of molecular conformations from cryoelectron microscopy images using simulation-based inference》研究ニュースレポート 研究背景と意義 分子生物学や構造生物学の分野において、生体高分子がどのように異なる構造(コンフォメーション)へと転換してその機能を発揮するかを理解することは、生命現象のメカニズムを解明する核心的な目標です。よく知られているように、タンパク質や核酸などの生体高分子は高度な柔軟性を持ち、細胞内で様々な構造間を絶えず再編成しています。そして、これら異なるコンフォメーションは...

高視力のためのアクティブな感覚としての注視眼球運動

微眼動が高視覚鋭度の能動的感覚メカニズムとして機能する 学術背景 人間の視覚感知は複雑なプロセスであり、特に目を安定させようとすると、眼球は自覚せずに微小な動きを生じます。これを微眼動(Fixational Eye Movements, FEM)と呼びます。これらの微眼動には通常、ドリフト(drift)とマイクロサッケード(microsaccades)の2つのタイプがあります。過去の研究では、微眼動により網膜上の画像が揺れることを示していますが、人間の視覚システムはそれでも微眼動の振幅よりも細かい詳細を感知することができます。この現象は科学界で広い関心を集めています:なぜ微眼動が視覚鋭度を損なうだけでなく、むしろその影響が積極的であるのか? この問いに答えるために、研究者たちは理論と実験を組...

個別化された神経膠腫成長予測のためのベイズ推論

ベイズ推論を用いた個別化予測による膠芽腫の成長 序論 膠芽腫(glioblastoma)は最も侵襲性の高い原発性脳腫瘍であり、腫瘍細胞は周囲の組織に高度に侵入します。標準的な医学的イメージング技術によってこれらのびまん性腫瘍境界を正確に識別することは困難であり、そのため臨床介入の効果が低く、予後も不良です。このような課題に対処するために、医学画像を用いて腫瘍の空間的および時空的な発育を信頼性を持って計算し予測することが、各個体に最適な治療計画を立てる際に有益です。 近年、腫瘍成長の生物物理モデルが非侵襲的画像測定データを用いて開発および校正され、将来の腫瘍成長や治療結果を予測することを目指しています。しかし、腫瘍の発展を予測するには2つの主要な課題を解決する必要があります。一つは、モデル予測...