Granger因果リカレントオートエンコーダーによる時系列単細胞RNAシーケンスデータからの遺伝子制御ネットワークの推論
1. 学術的背景と研究動機 近年、シングルセルRNAシーケンシング(single-cell RNA sequencing、scRNA-seq)は、生命科学および医学研究分野における画期的な技術の一つとなっており、研究者は細胞単位で多くの細胞間の転写レベルの微妙な差異を捉えることが可能となっています。この技術は細胞生物学を大いに豊かにし、細胞分化、発生、疾患発症メカニズムの理解に重大な意義を持ちます。scRNA-seqデータに基づき、遺伝子調節ネットワーク(gene regulatory networks, GRNs)を推定し、転写因子と標的遺伝子間の複雑な調節関係を明らかにすることは、現在のバイオインフォマティクスやシステムバイオロジーの中でも鍵となる課題です。 しかし、scRNA-seqデ...