Granger因果リカレントオートエンコーダーによる時系列単細胞RNAシーケンスデータからの遺伝子制御ネットワークの推論

1. 学術的背景と研究動機 近年、シングルセルRNAシーケンシング(single-cell RNA sequencing、scRNA-seq)は、生命科学および医学研究分野における画期的な技術の一つとなっており、研究者は細胞単位で多くの細胞間の転写レベルの微妙な差異を捉えることが可能となっています。この技術は細胞生物学を大いに豊かにし、細胞分化、発生、疾患発症メカニズムの理解に重大な意義を持ちます。scRNA-seqデータに基づき、遺伝子調節ネットワーク(gene regulatory networks, GRNs)を推定し、転写因子と標的遺伝子間の複雑な調節関係を明らかにすることは、現在のバイオインフォマティクスやシステムバイオロジーの中でも鍵となる課題です。 しかし、scRNA-seqデ...

構造強化型原型整列による教師なしクロスドメインノード分類

構造強化の原型アライメントによる教師なしドメイン適応ノード分類 序論 現代情報技術の発展に伴い、グラフニューラルネットワーク(Graph Neural Networks、GNNs)は複雑なネットワークのノード分類タスクにおいて顕著な成功を収めています。しかし、その一つの大きな課題は大量の高品質なラベルデータを必要とすることです。これはグラフ構造データに対して取得コストが高く、時間もかかります。したがって、豊富なラベルがあるグラフ(ソースドメイン)から知識を完全にラベルのないグラフ(ターゲットドメイン)に移す方法が重要な問題となっています。 研究背景と目的 著者のチームは浙江大学計算機科学学院、浙江省サービスロボット重点実験室、およびシンガポール国立大学計算機科学学院から来ています。彼らは構造...