双方向エピジェネティック編集が遺伝子制御の階層構造を明らかにする 背景と研究動機 ヒトゲノムにおいて、エンハンサーなどの非コード要素が遺伝子制御に果たす役割は広く認識されています。しかし、現在一般的に用いられているCRISPR干渉法は、非コード要素と遺伝的相互作用の研究においていくつかの限界があります。主に、従来のCRISPR手法、例えばCRISPR干渉（CRISPRi）やCRISPR活性化（CRISPRa）は、一度に単一の遺伝子座を編集することしかできないため、遺伝子制御ネットワークにおける相互作用の理解が制限されています。したがって、本研究はこれらの問題を解決するために、二方向のエピジェネティック特性を編集できるシステムを開発することを目指します。 出典と著者情報 この論文「Bidire...

ARID1A LossとB細胞運命およびリンパ腫生成 背景紹介 本稿は、ARID1A（AT-Rich Interactive Domain 1A）がB細胞運命決定およびリンパ腫生成に果たす重要な役割について調査したものである。ARID1Aは、血糖再構築複合体（BAF, BRG1/Brahma-associated factors）の重要なサブユニットであり、その変異は多くのヒト悪性腫瘍で一般的に見られる。従来の研究から、BAF複合体はクロマチンのアクセシビリティを調節することで、遺伝子の発現と細胞運命に影響を及ぼすことが知られている。しかし、ARID1A変異の機能喪失後の具体的なメカニズム、特にB細胞における挙動はまだ明らかにされていない。本研究は、ARID1A変異がB細胞の発育にどのように...

この研究は、マウス胚発生過程におけるMeis2転写因子のGABA作動性ニューロン発生・分化への関与メカニズムを探求しました。研究者らはCRISPR/Cas9ノックダウン、単一細胞RNA測定(scRNA-seq)、系統追跡などの技術を総合的に適用し、Meis2が胚基底核の投射ニューロン前駆細胞で高発現し、これらの前駆細胞が外側基底核由来のGABA作動性投射ニューロンに分化するのを促進することを発見しました。 Meis2はDlx5ファミリー転写因子と協調的に作用し、特定のシス制御エレメント(cis-regulatory elements、cREs)に結合して、投射ニューロン分化に関連する遺伝子エンハンサー領域を活性化し、投射ニューロン運命を誘導します。一方、内側基底核領域ではLhx6転写因子の発...