DockEM: 低~中分解能クライオ電子顕微鏡密度マップを活用した原子スケールのタンパク質-リガンドドッキング精製法
学術的背景と研究動機 近年、タンパク質–リガンドドッキング(protein–ligand docking)はバーチャル創薬スクリーニング(virtual drug screening)および構造に基づく新薬開発(structure-based drug discovery)の中核技術として、急速に発展してきました。大規模なハイスループットスクリーニング技術の応用により創薬効率は向上したものの、新薬開発は依然として高コスト・長期間・低い転化率などの課題に直面しています。従来の小分子ドッキング手法は、主にタンパク質とリガンドの三次元構造とエネルギー関数の評価に基づいていますが、ドッキングの精度をいかに向上させるかは、今なお本分野で解決すべき鍵となる技術的課題です。 一方で、クライオ電子顕微鏡(c...