207の綿花系統における単一ヌクレオチド解像度でのDNAメチル化多様性が複雑な形質へのエピジェノムの寄与を明らかにする

コットンにおける全体的なDNAメチル化多型の研究が複雑な形質に対するエピゲノムの貢献を明らかに 背景と研究の動機 過去数十年にわたり、全ゲノム関連解析(GWAS)を通じて、ゲノムおよび遺伝的多様性に関する研究が進められ、作物形質の変異理解に理論的基盤を提供してきました。しかしながら、DNAメチル化をはじめとするエピジェネティック修飾が作物形質の制御にどのように寄与するかについては、未だに十分に解明されていません。DNAメチル化は、シトシン(Cytosine)にメチル基を付加することで発生し、遺伝子発現の調節、ゲノムの安定性の維持、さらに多くの作物における重要な農学形質において重要な役割を果たします。これまでの研究では、ゲノムメチル化レベルの多型が生態学的適応形質に関連していることが示されてい...

胎児の溝形成のタイミングおよびスルカス間遺伝子発現勾配に関連した成人ヒト脳溝形態の双峰分類

胎児の溝形成のタイミングおよびスルカス間遺伝子発現勾配に関連した成人ヒト脳溝形態の双峰分類

研究の背景と目的 本研究は、成人の脳皮質溝回の複雑な形態特徴、特に脳溝(sulci)の線形と複雑性形態の分類とその形成メカニズムに焦点を当てています。溝は脳皮質表面の溝状の構造で、異なる遺伝特性、機能領域、そして胎児期の溝回発達時期に対応しています。本研究チームは、データパイプラインの自動化分析を通じて、脳溝回構造の分類特性とその遺伝子発現グラデーションとの関係を探求しようとしています。この研究の重要性は、脳表面構造の個体差が非常に大きいにもかかわらず、その形成過程がある種の規則に従う可能性があることにあります。本研究は、溝回形態に対する定量化分類システムを提供し、溝回複雑性の発達起源を明らかにし、今後の神経発達と疾患研究に新たな視点を提供することを目的としています。 研究の出所と著者 この...

筋萎縮性側索硬化症逆転表現型との遺伝的関連

ALS逆転表現型の遺伝的関連研究 筋萎縮性側索硬化症(ALS)は、致命的な神経変性疾患であり、上位および下位運動ニューロンの死、進行性の筋力低下、最終的には呼吸不全を特徴とします。しかし、一部のALS患者は、症状が著しくかつ持続的に改善するという、通常とは異なる臨床的な逆転現象を示しています。この現象は「ALS逆転」と呼ばれ、その生物学的な基盤はまだ明らかにされていません。この稀な表現型の背後にある遺伝的要因を探索するため、研究チームは全ゲノム関連解析(GWAS)を実施し、ALS逆転表現型に関連する遺伝的関連を特定しようとしました。 論文の背景と研究目的 ALSは重篤な神経変性疾患であり、その病程は通常、不可逆で致命的です。しかし、少数の症例において、患者の症状が著しくかつ持続的に改善するこ...

抗逆転写ウイルス療法を受けているSIV感染サルの脊髄における遺伝子発現変化

NARP研究所の研究がSIV感染の脊髄遺伝子発現への影響を明らかに 背景紹介 抗レトロウイルス療法(ART)の実施にもかかわらず、HIVに関連する末梢神経障害(HIV-DSP)は依然としてHIV感染の最も一般的な神経学的症状の1つです。HIV-DSPの臨床症状には、脱力、しびれ、灼熱感、過敏反応が含まれます。ARTによってウイルスの複製が抑制されているにもかかわらず、HIV患者の最大3分の1がHIV-DSPの症状を持続的に示しています。この現象の正確なメカニズムはまだ完全には解明されていませんが、現在のところHIV-DSPはウイルスの直接的および間接的効果と、一部のART薬(逆転写酵素阻害剤やプロテアーゼ阻害剤など)の潜在的な毒性作用が共同で引き起こしていると考えられています。さらに、糖尿病...

ヒト卵巣の老化における時空間転写変化とFOXP1の調節的役割

人類卵巣の老化における時空間トランスクリプトーム変化とFOXP1の調節作用に関する研究報告 学術背景 世界の平均寿命が長くなるにつれて、女性の更年期における健康問題がますます注目されています。卵巣の老化はその重要な問題の一つであり、骨粗鬆症、心血管疾患、肥満、腫瘍、アルツハイマー病および糖尿病など多くの健康問題と密接に関連しています。卵巣老化を遅らせる治療戦略を探るためには、卵巣の細胞組成、分子特性およびその時空間変化を完全に理解する必要があります。しかし、現在、人間の卵巣老化が細胞および分子レベルにどのように影響するかについての理解はまだ限られています。本研究では、単一細胞RNAシーケンシング(single-cell RNA sequencing、略称scRNA-seq)と空間トランスクリ...

炎症性筋疾患の細胞タイプマッピングが封入体筋炎における選択的筋線維脆弱性を強調する

炎性筋症における筋繊維タイプの異質性表現と封入体筋炎の選択的感受性 年齢とともに、炎性筋症の発症率が徐々に増加しており、その中でも封入体筋炎(IBM)は最も一般的なタイプであり、現在有効な治療法は存在しません。他の炎性筋症とは異なり、IBMは慢性的な経過をたどり、炎症と変性病理の特性を有します。さらに複雑なのは、IBMの進行を引き起こす要因と分子的な駆動要因が未だ明確でないことです。この疾患を深く研究するために、研究者たちは単核RNAシーケンシングと空間トランスクリプトミクスを用いて、患者の筋肉生検サンプルの細胞タイプ特異的な駆動要因のマッピングを行い、IBM筋肉と免疫介在性壊死性筋症(IMNM)および非炎症性の骨格筋サンプルを比較しました。 研究背景と目的 IBMは高齢者に最も多い炎性筋症...