Algorithmes de modélisation spatiale pour les réactions et le transport dans les cellules biologiques

Algorithmes de modélisation spatiale pour les réactions et le transport dans les cellules biologiques Contexte Les cellules biologiques utilisent des réseaux complexes de réactions biochimiques pour remplir leurs fonctions. Ces réseaux présentent une dynamique spatio-temporelle marquée, avec une compartimentation spatiale significative dans différe...

Annotation génomique des guides CRISPR valide les cibles dans les lignées cellulaires variantes et améliore la découverte dans les criblages

annotation des guides CRISPR ciblant le génome à l’aide de l’algorithme EXORCISE Contexte académique La technologie CRISPR-Cas9 a révolutionné les criblages génétiques, notamment en analysant l’essentialité des gènes et les interactions chimio-génétiques. En programmant des ARN guides (gRNAs) pour cibler des séquences spécifiques du génome, ce syst...

Conception hiérarchique de nanocages protéiques pseudosymétriques

Contexte académique L’auto-assemblage des protéines est un phénomène omniprésent dans les systèmes biologiques, remplissant des fonctions variées allant du support structurel à la régulation des réactions biochimiques. Bien que des progrès significatifs aient été réalisés dans le domaine de la conception de protéines, les structures auto-assemblées...