大規模マイクロアレイを用いたスケーラブルな空間トランスクリプトミクス

大判型マイクロアレイを再利用してスケーラブルな空間トランスクリプトミクスを実現する新手法:Array-Seq技術の誕生 背景と研究の起源 近年、空間分子解析(spatiomolecular analyses)は、生物医学研究や臨床病理学にとって重要なツールとなっています。これは、組織内の細胞や分子の空間的な配置が、それらの機能や健康・病気における異常な変化にどのように影響を与えるかを研究できるからです。しかし、既存の空間トランスクリプトミクス(spatial transcriptomics, ST)技術は、複数の面で制約を抱えています。特に、装置の高額さ、操作の複雑さ、表面積の小ささ、大量のサンプル処理との非互換性、さらに一般的な組織学染色(H&E染色など)との非互換性が挙げられます。これら...

組織内記憶CD8 T細胞の多様性の時空間的インプリンティング

組織常在メモリーCD8 T細胞の多様性における時空間的インプリント 背景紹介 組織常在メモリーCD8 T細胞(Tissue-resident memory CD8 T cells, TRM細胞)は、腸管などのバリア部位で長期的な免疫保護を提供します。しかし、TRM細胞の異質性とその形成メカニズムは完全には解明されていません。これまでの研究では、小腸のTRM細胞が少なくとも2つのサブポピュレーションに分かれることが明らかになっています:一つはエフェクター分子の発現が高く、もう一つは記憶能が強いものです。この異質性の起源は不明でした。本研究は、異なる組織微小環境がTRM細胞の表現型異質性をどのように駆動するかを探り、腸管における時空間的分布の法則を明らかにすることを目的としています。 論文の出所...

脳膜孤立性線維腫の細胞状態は脳血管の発達と恒常性を模倣する

脳膜孤立性線維腫瘍の単一細胞および空間トランスクリプトミクス研究 学術的背景 脳膜孤立性線維腫瘍(Meningeal Solitary Fibrous Tumors, SFTs)は、中枢神経系(CNS)の脳膜に由来する稀な間葉性腫瘍です。SFTsは組織学的に他の脳膜腫瘍(例えば髄膜腫)と類似していますが、局所再発や血行性転移の傾向など、その独特な臨床行動により、その生物学メカニズムと治療戦略が注目されています。現在、SFTsの治療手段は限られており、主に手術と放射線療法に依存しており、転移性または標準治療に耐性のあるSFTsに対しては有効な薬物治療法がありません。したがって、SFTsの細胞状態と空間トランスクリプトーム構造を深く理解することは、新しい治療ターゲットの開発にとって重要です。 近...

前立腺癌における循環腫瘍細胞と腫瘍組織の高度多重化特性評価と単細胞および空間分析:CODuco in situアッセイによる耐性メカニズムの解明

以下是对该学术论文报告的中文翻译,保留了原文的Markdown格式和完整信息: 前列腺癌中循环肿瘤细胞和肿瘤组织的高多重表征:通过CODuco原位检测揭示耐药机制 背景 转移性前列腺癌(Metastatic Prostate Cancer, PC)是一种高度异质性和动态变化的疾病,迫切需要有效的工具来进行患者分层和耐药性监测。液体活检中的循环肿瘤细胞(Circulating Tumor Cells, CTCs)和循环肿瘤DNA(ctDNA)分析具有潜力,但由于耐药机制的多样性,全面的检测至关重要。此前,我们展示了基于mRNA的原位Padlock探针杂交技术在CTCs表征中的应用。 方法 我们开发了一种新型的组合双色(Combinatorial Dual-Color, CODuco)原位mRN...

単細胞および空間トランスクリプトーム解析を組み合わせた胃癌におけるHedgehog経路の細胞異質性の解明

単細胞および空間トランスクリプトーム解析を組み合わせた胃癌におけるHedgehog経路の細胞異質性の解明 学術的背景 胃癌(Gastric Cancer, GC)は世界的に見ても最も一般的で致命的な悪性腫瘍の一つであり、発症率と死亡率の両方が高い。化学療法、放射線療法、標的治療などの進展にもかかわらず、胃癌の治療は依然として大きな課題を抱えている。胃癌の浸潤性と異質性は、特に進行期患者の生存率が極めて低いことを特徴としている。腫瘍細胞の浸潤と転移は再発と死亡の主な原因であり、既存の治療法ではこれらを完全に解決することはできない。免疫療法は有望な治療モデルとして注目されているが、腫瘍微小環境と免疫の複雑性に直面している。したがって、胃癌の発症メカニズムを遺伝子、分子、表現型レベルで深く理解する...