使用冷冻电子断层扫描技术对染色质生物分子凝聚体进行定量空间分析

学术背景 生物分子凝聚体(biomolecular condensates)是细胞内通过液-液相分离(LLPS)形成的无膜细胞器,在基因表达、信号传导等关键生物学过程中发挥重要作用。然而,由于传统成像技术的限制,凝聚体内部的高分辨率结构信息长期缺失,这阻碍了对其功能机制的深入理解。染色质(chromatin)作为真核生物细胞核内遗传物质的主要组织形式,其动态凝聚与解聚过程直接影响基因调控,但染色质凝聚体的精细结构和分子排布规律仍不明确。 本研究由Michael K. Rosen团队主导,旨在解决以下关键问题: 1. 如何克服传统冷冻电镜制样技术对液态凝聚体结构的破坏 2. 如何在高密度的凝聚体内部实现单个核小体(nucleosome)的精确定位与取向分析 3. 比较体外重构染色质凝聚体与天然...

核小体纤维拓扑结构指导转录因子结合增强子

核小体纤维拓扑结构指导转录因子结合增强子 学术背景 细胞身份的确立依赖于多个转录因子(Transcription Factors, TFs)在细胞类型特异性基因的增强子上的协同结合。尽管TFs能够识别可及染色质中的特定DNA基序(motif),但这一信息并不足以解释TFs如何选择增强子。本文通过比较四种不同的TF组合,分析了它们在基因组中的结合位点、染色质可及性、核小体定位以及三维基因组组织,揭示了核小体纤维的拓扑结构如何指导TFs结合到增强子。 论文来源 本文由Michael R. O’Dwyer、Meir Azagury、Katharine Furlong等作者共同撰写,作者来自University of Edinburgh、The Hebrew University-Hadassah ...