SMART:生物细胞中反应和传输的空间建模算法
细胞信号反应与运输的空间建模算法研究 背景介绍 生物细胞通过复杂的生化反应网络来实现其功能。这些反应网络具有显著的时空动态性,且在细胞的不同区域和亚细胞结构中存在显著的空间分异(spatial compartmentalization)。然而,传统的细胞信号传导模型通常将细胞视为一个均匀混合的体系,忽略了空间效应对反应和运输过程的影响。这种简化虽然在特定情况下有效,但在许多实际场景中会降低模型的预测能力。例如,信号分子的扩散速度较慢、细胞内环境拥挤、细胞结构的复杂性等都会导致空间效应的显著影响。因此,开发能够精确模拟细胞信号传导和运输过程的计算模型成为生物计算科学领域的重要挑战。 2025年1月发表在 Nature Computational Science 期刊上的一篇研究论文,提出了名为...