同义密码子对蛋白质主链构象影响的再评估 —— 一项严格统计检验下的结构生物学范式辩证 一、学术背景与研究动因 在分子生物学和结构生物学的领域，密码子（codon）与蛋白质结构之间的关系一直是研究关注的热点。传统观念认为，蛋白质的一级结构（即氨基酸序列）决定其空间构象（折叠），而遗传密码的“简并性”允许同一种氨基酸由多个“同义密码子（synonymous codons）”编码。从20世纪末开始，越来越多的文献证实，同义密码子的使用偏好与诸多生物学过程密切相关，如mRNA剪接、翻译速率调控及蛋白质折叠动力学等。这些联系不仅丰富了我们对分子生物学中的“非编码信息”的理解，也对蛋白质设计和基因工程提出了更多维度的理论基础。 2022年，一项由A. A. Rosenberg等人发表于Nature Co...

RNA构象空间的研究：RNase P RNA在溶液中的动态结构 学术背景 RNA的构象多样性在生物学中具有重要作用，尤其是在RNA剪接、包装、细胞转录激活以及环境刺激响应等过程中。然而，传统的生物物理技术无法直接可视化RNA在溶液中的完整构象空间。RNase P RNA是一种存在于所有生命体中的RNA酶，负责编辑前体tRNA（pre-tRNA）的5’端。由于其底物特异性广泛，RNase P RNA被认为具有高度的构象灵活性，这种灵活性与其酶活性所需的刚性结构之间存在着复杂的平衡关系。理解这种构象灵活性与结构刚性之间的关系，对于揭示RNA的功能和生物学意义至关重要。 论文来源 本论文由Yun-Tzai Lee、Maximilia F. S. Degenhardt、Ilias Skeparnia...