Protocole de résolution de problèmes : Prédiction précise de la séparation de phase au niveau des résidus à l'aide d'incorporations de modèles de langage et de conformation de protéines

Sciences de la vie, Biochimie, Génétique, Biophysique,
séparation de phase   modèle de langage   prédiction au niveau des résidus   incorporations conformationnelles   régions intrinsèquement désordonnées  

I. Contexte académique et importance de la recherche Ces dernières années, la séparation de phase liquide-liquide des protéines (phase separation, PS), en tant que mécanisme clé de régulation des biomolécules intracellulaires, a suscité une vaste attention dans le domaine des sciences de la vie. La séparation de phase ne favorise pas seulement la f...

Identification des gènes du cancer par l'intégration d'un modèle de langage causal avec l'inférence causale basée sur les données omiques

Sciences de l'information, Intelligence artificielle, Médecine, Oncologie, Sciences de la vie, Biochimie, Génétique,
gènes du cancer   causalité   modèle de langage   multi-omique   apprentissage causal  

L’identification précise des gènes du cancer constitue une difficulté centrale dans la recherche fondamentale du cancer et dans le domaine de la médecine de précision. Récemment, une équipe de recherche de l’Université du Jilin et de l’Université des Sciences et Technologies du Zhejiang a publié dans la revue Briefings in Bioinformatics un article ...

Apprentissage contrastif des représentations des récepteurs des cellules T

Médecine, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie, Immunologie,
Récepteur des cellules T   apprentissage contrastif   alignement de séquences   prédiction de spécificité   modèle de langage  

Nouvelle percée dans la prédiction de la spécificité des récepteurs des cellules T (TCR) - Introduction du modèle SCEPTR Contexte académique Les récepteurs des cellules T (TCR) jouent un rôle crucial dans le système immunitaire. Ils déterminent la spécificité des réponses immunitaires en se liant aux peptides présentés par les complexes majeurs d’h...

Un modèle de langage pour la région 5' UTR pour décoder les régions non traduites de l'ARNm et les prévisions de fonction

Un modèle de langage pour la région 5' UTR pour décoder les régions non traduites de l'ARNm et les prévisions de fonction

Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie, Génie biologique, Génétique,
modèle de langage   5' UTR   traduction d'ARNm   expression des protéines   prévision de fonction  

La région 5’ non traduite (5’UTR) est une région régulatrice à l’extrémité des molécules d’ARN messager (ARNm), jouant un rôle clé dans la régulation du processus de traduction et l’influence sur les niveaux d’expression des protéines. Les modèles langagiers ont démontré leur efficacité pour décoder les séquences protéiques et génomiques. Dans cett...