EPICPred:注意ベースのマルチインスタンス学習を用いたエピトープ結合TCR駆動型表現型の予測

T細胞受容体(TCR)は適応免疫システムにおいて重要な役割を果たしており、特定の抗原エピトープ(epitope)に結合することで病原体を認識します。TCRとエピトープ間の相互作用を理解することは、免疫応答の生物学的メカニズムを解明し、T細胞を介した免疫療法を開発する上で極めて重要です。しかし、TCRのCDR3領域がエピトープ認識において重要であることは広く認められているものの、特定の疾患や表現型に関連するTCR-エピトープ相互作用を正確に予測する方法は依然として課題となっています。この問題に対処するため、研究者たちはEpicPredを開発しました。これは注意メカニズムに基づく多インスタンス学習(Multiple Instance Learning, MIL)モデルであり、がんやCOVID-1...

全食物植物ベースの食事は転移性乳がん患者のアミノ酸レベルを低下させる

植物性全食品食事が転移性乳がん患者のアミノ酸レベルに及ぼす影響 研究背景 がん細胞の成長と生存は、大量の代謝需要、特にアミノ酸への依存に支えられています。腫瘍は周囲の微小環境からアミノ酸を摂取することでその需要を満たしますが、食事中のアミノ酸摂取量は血清中のアミノ酸レベルに影響を与える可能性があります。研究によると、植物性食事は動物性食事よりもアミノ酸が少ないとされていますが、植物性食事ががん患者の血清中のアミノ酸レベルを低下させるかどうかは不明です。そこで、研究者たちは臨床試験を通じて、植物性全食品食事が転移性乳がん患者の血清アミノ酸レベルに及ぼす影響を探り、この食事法ががん治療に与える潜在的な相乗効果を評価することを目指しました。 論文の出典 この論文はTashjaé Q. Scales...

脳バリアの役割:転移プロセスにおける境界の打破

腫瘍の脳転移における脳バリアの役割 背景紹介 脳転移(Brain Metastases, BMs)は成人において最も一般的な頭蓋内腫瘍であり、その発生率は原発性脳腫瘍の3倍から10倍です。手術切除、放射線療法、化学療法を含む多様な治療法が用いられていますが、脳転移の予後は依然として不良で、治療は困難です。脳転移は主に肺がん(20-56%)、乳がん(5-20%)、メラノーマ(7-16%)から発生しますが、他の種類のがんからも発生することがあります。脳転移のプロセスは、局所浸潤、血液またはリンパ系への侵入、正常組織への浸出、および遠隔部位への定着を含む多段階のプロセスです。脳に到達した循環腫瘍細胞(Circulating Tumor Cells, CTCs)は、血液脳関門(Blood-Brain...

がんにおけるCXXC5の信号統合機能

CXXC5のがんにおけるシグナル統合機能 学術的背景 CXXC5(CXXC型亜鉛フィンガー蛋白質5)は、ZF-CXXC蛋白質ファミリーの一員であり、細胞シグナルネットワークにおいてシグナル統合と情報伝達の重要な役割を果たしています。CXXC5は、Wnt/β-catenin、TGF-β/BMP、ATM/p53などの複数のシグナル経路や遺伝子発現を調節することで、細胞増殖、分化、アポトーシス、代謝などのプロセスに関与しています。その異常な発現や機能不全は、特にがんの発生や進行を含む多くの病理学的プロセスと関連しています。しかし、CXXC5のがんにおける具体的な作用機序や治療的価値はまだ完全には解明されていません。したがって、本稿では、CXXC5の細胞シグナルネットワークにおける機能、特にがんにお...

がん患者における出血イベント:発生率、リスク要因、および予後への影響に関する前向きコホート研究

癌患者における出血リスクの発生率、危険因子、および予後への影響:ウィーンがん、血栓、出血研究基盤の前向きコホート研究レビュー 学術的背景と研究目的 がん患者には血栓および止血機能の異常(hemostatic dysregulation)が頻発しますが、関連研究では主にがん関連静脈血栓塞栓症(cancer-associated venous thromboembolism, VTE)に焦点が当てられ、出血事象に関するデータは比較的少ないです。出血事象は致命的なリスクを伴う可能性があるため、リスク因子や臨床パターンの詳細な理解は臨床判断に重要です。また、VTEの予防と治療の重要な手段として抗凝固療法が挙げられますが、これもがん患者の出血リスクを高めるため、血栓と出血リスクを総合的に評価することが...