生物学的にインスパイアされた協調的水素分解による後期重水素化と三重水素化

学術的背景 水素化分解反応(hydrogenolysis)は、分子水素の添加によって化学結合を切断する基礎的な化学反応であり、バイオマスや石油などの原料を高価値の化学品や燃料にアップグレードするために広く応用されています。さらに、水素化分解反応は、製薬や精密化学工業においても、複雑な分子構造を合成するための重要なツールです。しかし、従来の水素化分解反応は、高温高圧条件下での不均一触媒に依存しており、その選択性は限られています。近年、均一触媒は、より温和な条件下で高い選択性を提供する有望な代替方法として注目されています。それにもかかわらず、炭素-ハロゲン結合(C-X結合)の均一水素化分解反応、特にトリチウム化(tritiation)や重水素化(deuteration)反応は、まだ解決されていな...

ADAR1を標的とした前立腺癌治療のための小分子の研究

学術的背景 前立腺癌(Prostate Cancer, PCA)は男性において最も一般的な悪性腫瘍の一つであり、特に西洋諸国では男性の癌関連死の第二大原因となっています。アンドロゲンシグナル療法は初期の前立腺癌治療に有効ですが、ほとんどの患者は最終的に再発し、現在のところ根治的な治療法はありません。そのため、新しい治療ターゲットと薬剤の探索が現在の研究の焦点となっています。RNA編集酵素ADAR1(Adenosine Deaminase Acting on RNA 1)は、さまざまな癌において癌促進作用を持つことが発見されていますが、前立腺癌における具体的な機能と潜在的な治療価値はまだ十分に探求されていません。本研究は、ADAR1が前立腺癌において果たす重要な役割を明らかにし、効果的な小分子...

細胞内アロステリック調節剤によるニューロテンシン受容体1のアレスチン偏向作動の分子メカニズム

学術的背景 Gタンパク質共役受容体(GPCRs)は、ヒトの細胞表面で最も豊富な受容体ファミリーであり、FDA承認薬物の中で最も一般的なターゲットです。GPCRsは、疼痛、糖尿病、心血管疾患、がんなど、さまざまな疾患の治療において重要な役割を果たしています。しかし、GPCRsの薬物開発には多くの課題があり、特に受容体サブタイプの選択性とターゲットおよび非ターゲット副作用の制御が問題となっています。従来のオーソステリックリガンド(orthosteric ligands)ではこれらの問題を解決することが難しいため、オーソステリックポケット外に作用するアロステリック調節剤(allosteric modulators)の開発が有望な戦略として注目されています。アロステリック調節剤は、内因性リガンドのシ...

GutBugDB:ヒト腸内マイクロバイオームを介した生物および異生物分子の生物変換を予測するウェブリソース

近年、ヒト腸内細菌叢(Human Gut Microbiota, HGM)が薬物や栄養素の代謝において重要な役割を果たすことが認識されるようになってきました。腸内細菌叢は、経口薬の生物学的利用能に影響を与えるだけでなく、その代謝酵素を介して薬物や生物活性分子の生体変換(biotransformation)に関与し、薬物の薬物動態や薬力学特性に影響を及ぼします。しかし、腸内細菌叢の複雑さや個人間の差異により、特定の微生物が薬物や栄養素の代謝に果たす具体的な役割を特定することは依然として大きな課題です。この問題を解決するため、研究者たちはGutBugDBを開発しました。これは、ヒト腸内細菌叢が媒介する生物および異生物質(xenobiotic)分子の生体変換を予測するためのオープンアクセスのデジタ...

SP-DTI:サブポケット情報を利用したTransformerモデルによる薬物-標的相互作用予測

学術的背景 薬物-ターゲット相互作用(Drug-Target Interaction, DTI)の予測は、薬物発見における重要なプロセスであり、実験スクリーニングのコストと時間を大幅に削減することができます。しかし、深層学習技術がDTI予測の精度を向上させたにもかかわらず、既存の方法は依然として2つの大きな課題に直面しています:汎化能力の不足とサブポケットレベルの相互作用の無視です。まず、既存のモデルは未知のタンパク質やクロスドメイン設定において性能が著しく低下します。次に、現在の分子関係学習は、サブポケットレベルの相互作用をしばしば無視しており、これらの相互作用は結合部位の詳細を理解する上で重要です。これらの課題を解決するために、研究者はSP-DTIという新しいモデルを提案し、サブポケット...