Cadre de préservation de la confidentialité pour les calculs génomiques via le chiffrement homomorphe multi-clés

Cadre de protection de la vie privée pour l’analyse génomique : Recherche basée sur le chiffrement homomorphe multi-clés Contexte académique Avec la réduction des coûts du séquençage génomique, la disponibilité généralisée des données génomiques a ouvert de nouvelles possibilités pour la médecine personnalisée (également appelée médecine génomique)...

EPICPred : Prédire les phénotypes pilotés par les TCR liant les épitopes en utilisant l'apprentissage multi-instances basé sur l'attention

Les récepteurs des cellules T (TCR) jouent un rôle crucial dans le système immunitaire adaptatif, en reconnaissant les agents pathogènes par leur liaison à des épitopes spécifiques. Comprendre les interactions entre les TCR et les épitopes est essentiel pour dévoiler les mécanismes biologiques des réponses immunitaires et pour développer des immuno...

DeepES : Outil de criblage enzymatique basé sur l'apprentissage profond pour identifier les gènes d'enzymes orphelins

Contexte académique Avec le développement rapide des technologies de séquençage, les scientifiques ont pu obtenir un grand nombre de séquences protéiques, y compris de nombreuses séquences enzymatiques. Cependant, bien que des bases de données enzymatiques majeures telles que Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) et BRENDA aient été établi...

MostPlas : un modèle d'apprentissage multi-label auto-correctif pour la prédiction de la gamme d'hôtes des plasmides

Les plasmides sont de petites molécules d’ADN circulaires à double brin présentes dans les bactéries, indépendantes de l’ADN chromosomique. Ils aident les bactéries hôtes à acquérir des traits bénéfiques tels que la résistance aux antibiotiques et aux métaux par le transfert horizontal de gènes. Certains plasmides peuvent se transférer, se réplique...

Analyse de séquence : Alignement de séquences d'ADN à l'aide de modèles Transformer

Contexte académique L’alignement des séquences d’ADN est une tâche centrale en génomique, visant à localiser les fragments courts d’ADN (reads) aux positions les plus probables sur un génome de référence. Les méthodes traditionnelles se divisent généralement en deux étapes : l’indexation du génome, suivie d’une recherche efficace pour localiser les...